ランチョンセミナーのお知らせ 12月3日(火) (第42回日本分子生物学会年会) [終了]

学会セミナー情報

ランチョンセミナーのお知らせ 12月3日(火) (第42回日本分子生物学会年会) [終了]

本セミナーは終了いたしました。

3'mRNA-Seqを利用した網羅的遺伝子発現解析
Comprehensive gene expression analysis using 3 'mRNA-Seq

演者：: 長谷川嘉則先生
演者ご所属：: 公益財団法人かずさDNA研究所ゲノム事業推進部
臨床オミックス解析グループ遺伝子分析チーム
日時：: 2019年12月3日（火）　12：10 ～ 13：00
会場：: 福岡国際会議場第6会場 (409 + 410)

要　旨

次世代シークエンス (NGS)技術の登場以来、10年が経過し、遺伝子発現の網羅的な解析にはRNA-Seqが広く利用されています。RNA-Seqは遺伝子全長のシークエンスを行うので、遺伝子発現だけでなく、融合遺伝子の検出・新規スプライシングバリアントの検出にも利用されています。データ解析に必要なリード数は、例えばヒトサンプルの場合は、paired-end（リードの両方向から読む）で2000万～3000万リードを要します。一方、3'mRNA-Seqは遺伝子の3'端だけを集中的に読むので、必要リード数は、single-read（リードの片方向から読む）で100万~150万リード読めば十分です。遺伝子発現解析が目的の場合は、3'mRNA-Seqの利用によってシークエンスコストを大幅に削減することが可能となります。我々は、Lexogen社のQuantSeqキットを使用して、3'mRNA-Seqを行っています。QuantSeqキットは、作業工程が比較的容易なので１日でライブラリー作製が可能であり、多検体を処理する時には96-wellプレートを使用してライブラリー作製を行なっています。また、プロトコールの条件検討を行った結果、1細胞の解析にも十分利用出来るようになりました。さらには、FFPEサンプルについての解析にも利用しています。これまでに、各種培養細胞、ヒトiPS細胞、臨床検体を含むヒト組織、マウス組織、ゼブラフィッシュ組織等、様々なサンプルについて解析を進めてきました。これまでのQuantSeqキットの活用例を紹介させていただきます。

コスモ・バイオ(株)より、次世代シークエンス関連製品および、3'mRNA-SeqとDIAプロテオーム解析を組み合わせたマルチオミックス解析受託サービスをご紹介いたします。

整理券	本学会ランチョンセミナーは整理券制です。配布日時：開催当日（12/3）　8：00～10：30 (無くなり次第終了) 配布場所：福岡国際会議場1F

お問合せ	コスモ・バイオ株式会社　製品情報部　セミナー事務局 TEL：　03-5632-9622 email：　seminar@cosmobio.co.jp

学会情報

コスモ・バイオ（株）第42回分子生物学会年会展示会にも出展します。
期間	2019年12月3日(火)～12月6日(金)
会場	マリンメッセ福岡　2F
当社ブース	展示ブース番号　７０
学会ホームページ	第42回日本分子生物学会年会

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