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DNAやRNAを抽出したとき、DNAを増幅したとき、遺伝子確認をするとき特集：アガロースゲル電気泳動

コスモ・バイオは、電気泳動装置、核酸（DNA/RNA）染色試薬、トランスイルミネーターなど、アガロースゲル電気泳動をトータルでサポートする製品を販売しています。

背景

アガロースゲル電気泳動は、寒天の主成分であるアガロースを使用する電気泳動で、核酸をその大きさに応じて分離する手法です。DNA、RNAなどの核酸分子はそれぞれに大きさ（長さ）と荷電を持っており、泳動距離は分子量の大きいものほど流れにくく、小さいものほど流れやすくなります。

TAEやTBEなどのバッファー（緩衝液）に高純度のアガロースを加え、加熱して溶かした後、型枠に入れて固めます（ゲルの作製）。
- アガロースの量は分離したい核酸の大きさに応じて変更しますが、濃度にして0.8-4%がよく用いられます。
- ゲル作製の際に樹脂製で櫛（くし）状になったパーツ（コームと呼ぶ）を型枠にさしておき、後にサンプル（核酸）溶液を注入するための穴（wellと呼ばれる）を作製します。
ゲルが固まったら同じバッファーの入った水槽（電気泳動槽）に入れ、サンプル（核酸）溶液を静かに注入します。準備ができたら一方から電圧をかけ、電気泳動を開始します。
一定時間後、ゲルを取り出し、臭化エチジウム（EtBr）などの核酸染色溶液に沈めます（後染め）。
- 染色液をあらかじめサンプル（核酸）溶液やアガロースゲルに添加しておく場合もあります（先染め）。
EtBrなど染色色素は二本鎖DNAの隙間に入り込み（インターカレート）、この状態で紫外線等の励起光を照射すると蛍光が発せられ、核酸の存在が確認できることになります。
- EtBrの量はDNAの分子の長さと量に比例することになるため、蛍光の強さによってDNA量を確認することもできます。