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記事ID : 13595
研究用

ChIP-seq ChIP シーケンシング (ChIP-seq)
マクロジェン社:ChIP Sequencing

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受託サービス
受託サービス

遺伝子の転写過程における後成的な調整メカニズムは、DNA メチル化やヒストン修飾が最もよく知られています。NGS を利用することで、 そのメカニズムをより効果的に解析できます。

Technology pipeline for MBD(Methyl-CpG binding domain)sequencing

シーケンシングプラットフォーム

・ HiSeq / MiSeq system (Single, Paired-end)

データ解析*

Methylation / MBD (Methyl-CpG Binding Domain) data analysis

  • Standard data analysis
    - Global Methylation Profiles
    - Specific Methylation Profiles
    - Differentially Methylation Regions (DMR)
  • Advanced data analysis
    - DMR-Associated Genes
    - Gene Set Analysis
    - Comparative Analysis

ChIP (Chromatin Immuno Precipitation) data analysis

  • Standard data analysis
    - Enrichment Peak Profiles and Gene Annotation
    - Differentially Enriched Peaks and Gene Annotation
    - Multiple Alignment and Consensus Motif
  • Advanced data analysis
    - Gene Set Analysis
    - Comparative Analysis
technology pipeline for ChIP sequencing

* Data Analysis may be varified by the availability of reference and the type of platform.

参考価格および標準納期

サービス項目 ChIP Sequencing
対象生物 リファレンスのある生物のみ
使用機種 HiSeq2500 NovaSeq6000
リード数 220-250 M リード 26 Mリード (paired-end なので実質は 13 M リード)
リード長 50 bp 150 bp
シーケンス方法 Single End, 1レーンに 4-8 サンプル Paired-End
価格(税抜)
  • ライブラリー作製:42,000 円/サンプル
  • シーケンス:21 万円/1レーン
  • データ解析:45,000 円
  • ライブラリ作製:42,000 円/サンプル
  • シーケンス:16,000円/サンプル
  • データ解析:45,000 円/サンプル
データ解析
ピーク解析
必要サンプル量 IPしたDNA(精製したDNA断片)の濃度は10ng/µL以上で 10µL以上必要です。sizeは500bp以下で300bp程度が適しています。
ご提供いただくサンプルについては、インフォームド・コンセントが取得されており、かつドナーの個人情報が特定できないように匿名化されたものである必要がございます。
納期(QC合格後) シーケンス: 6-8 週間
データ解析:1-2 週間
納品物
  1. シーケンシング結果(fastqフォーマットファイル)
  2. リファレンスゲノムへのマッピング結果
  3. ピークの検出およびアノテーション結果

 

お見積り・ご注文方法

お見積り依頼・ご注文の際は下記のオーダーシートに必要事項をご入力いただき、E­mail にてご送付をお願いいたします。ご注文の際はお取引のある代理店様に品番、数量をご指定の上ご発注下さい。またサンプルをご送付いただく際は本オーダーシートをサンプルに同封して下さい。

オーダーシート
送付先
コスモ・バイオ株式会社 創薬・受託サービス部
E-mail: jutaku_gr@cosmobio.co.jp

サンプルのご送付方法

  • サンプルは緩衝材と保冷剤を入れた発泡スチロール製保冷箱に入れ、サンプルがDNAの場合は保冷剤を、サンプルがRNAの場合はドライアイスを十分入れてご送付ください。チューブの破損やクロスコンタミネーションに十分ご注意下さい。
  • チューブには必ずラベルや油性マジックでサンプル名を記載し、他のチューブと判別できるようにご注意下さい。
  • ご送付は宅急便等で下記宛先まで着払いにてご送付ください。なお、サンプルの紛失を避けるために事前に jutaku_gr@cosmobio.co.jp までご送付日、配送業者名、お問合せ番号をお知らせください。
サンプル
送付先
〒135-0064
東京都江東区青海2-4-32 タイム24ビル16F
(株)マクロジェン・ジャパン NGSサービス係行き
TEL: 03-5962-1124

ご提供いただくサンプルについては、インフォームド・コンセントが取得されており、かつドナーの個人情報が特定できないように匿名化されたものである必要がございます。

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お問い合わせ先 : 創薬・受託サービス部

ご質問・ご不明の点は創薬・受託サービス部までお問い合せください。また、秘密保持契約のご希望につきましても、下記までご連絡をお願いいたします。

TEL
03-5632-9615
FAX
03-5632-9614
E-mail
jutaku_gr@cosmobio.co.jp

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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