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ヒストン修飾とクロマチン構造変換による転写制御特集：エピジェネティクス／epigenetics

背景

エピジェネティクスとは変化した活性化状態の維持、シグナル化、または永続的なものになるための染色体領域における構造適合として定義されています。アセチル化、メチル化、ユビキチン化を含むヒストンタンパク質への様々なクロマチン改変翻訳後修飾 (PTMs) が、DNAへの直接的な修飾と同様、遺伝子転写の on/off に関わっていることが知られています。今日まで、ヒストン・リジン残基のアセチル化/脱アセチル化やDNAのメチル化はエピジェネティックな PTMs の中で最も臨床的に重要であることが判明しています。

総説「エピジェネティクス epigenetics - ヒストン修飾とクロマチン構造変換による転写－」

1. クロマチン免疫沈降／ChIP assay
2. DNA のメチル化
3. ヒストン解析
4. ユビキチン化 / SUMO 化の解析
5. ヌクレオソーム / 核内高次構造の解析

1．クロマチン免疫沈降／ChIP assay　

クロマチン免疫沈降法（chromatin immunoprecipitation: ChIP）とは、ホルマリンでDNAとヒストンなどのDNA結合タンパク質を架橋した後、超音波処理により可溶性のクロマチンにし、これをアセチル化ヒストンや転写因子に対する抗体で免疫沈降するものです。免疫沈降物からDNAを精製し、PCR法にて目的とするDNA領域がどれだけ濃縮されているかを解析します。これにより、内在性のクロマチン領域にどれだけアセチル化されたヒストンや転写因子が結合しているかを調べることができます。ChIPは、このような利点からレポーター法やゲルシフト法と並んで、転写制御機構の解析において非常にポピュラーな方法となっています。

京都大学ウイルス研究所生体応答学研究部門生体防御研究分野教授生田宏一先生の総説
総説：エピジェネティクス epigenetics - ヒストン修飾とクロマチン構造変換による転写－より抜粋

ChIP用試薬

Chromatrap® ChIP Assays [PVS]
高性能固相カラムによるクロマチン免疫沈降アッセイ（ChIP）
ChIPアッセイ用関連試薬 [SCB]
各種バッファーを取り揃え
SNAP-ChIP K-MetStat Panel [ECY]
メチル化ヒストンのChIPアッセイ用に開発されたspike-in

ChIP-Seq

NEXTflex™ ChIP-seq キット [BIO]
Input 量わずか10μg のChIP DNA シーケシングキット
Chromatrap® ChIP-Seq キット [PVS]
次世代シーケンシング（NGS）ライブラリ調製用の高品質なDNAを精製

クロマチンＤＮＡの断片化(ソニケーション)

サンプル密閉式超音波破砕装置 BIORUPTOR® II
密閉式。ChIPでの使用文献多数あります！

ChIP用抗体

ChIP抗体商品の一覧

ChIPアッセイにお使いいただける抗体商品の一覧になります。一覧が表示されました後、「絞り込み検索項目」にターゲット名を入れていただくことで、目的の抗体をお探しいただけます。

その他、下記抗体商品にもご注目ください。

ヒストンH3バリアントモノクローナル抗体 [CAC]
世界初!コスモバイオから新発売！
修飾ヒストンH3/H2B抗体 [MCA]
ChIPグレードの修飾ヒストンH3抗体を多数ラインナップ！
修飾ヒストンH3/H4抗体 Epi-Plus®シリーズ [RKL]
バリデーション済みChIP用抗体
ショウジョウバエのクロマチン研究用抗体 [CAC]
転写調節やDNAの複写、ヒストン修飾等に有用な研究ツール

2．DNAのメチル化　

メチル化DNAの単離／濃縮

MethylAffinity™ メチル化DNA濃縮キット [GCP]
メチル化DNAの回収が簡単、2時間以内
BioArray™ メチル化DNA IP キット [ENZ]
5-メチルシトシンを含むDNAを免疫沈降技術を利用して濃縮

メチル化DNA-Seq

NEXTflex™ Methyl-Seq 1 キット
Illumina社次世代シーケンサー対応！ [BIO]
メチル化DNAシーケンシング用ライブラリ調製キット
NEXTflex™ Bisulfite-Seq キット [BIO]
Illumina社次世代シーケンサー対応！
BS-Seq もしくはRRBS用ライブラリ調製キット