| 容器：1.5mlチューブ | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| サンプル量 | 標的タンパク質 | ホルムアルデヒド 処理 |
UCD-250 使用条件 |
DNA 長 | ChIP assay Protocol |
| サンプル種：プラスミドDNAを磁気ビースに固定し、クロマチン作製 | |||||
| plasmid DNA 400 ng | 複製因子 | 5 min at RT in formaldehyde 1% final | 250 W, 30 sec ON/30 sec OFF/15 cycle (15 min) |
500-300 bp ladder | Upstate 社 protocol |
| サンプル種：Humnan B cell | |||||
| 200 ul, 3 x 106 cells |
アセチル化ヒストン | 5 min at RT in formaldehyde 1% final | 250 W, 30 sec ON/1 min OFF/11cycle (16.5 min) |
2 kbp 以下 ladder | Upstate 社 protocol |
| 容器：15mlチューブ | |||||
| サンプル量 | 標的タンパク質 | ホルムアルデヒド 処理 |
UCD-250 使用条件 |
DNA 長 | ChIP assay Protocol |
| サンプル種：Hela cells | |||||
| 1.4 ml, 2x107 cells |
TBP, RNA polymerase II, Suv39H1, Paf1 etc. |
10 min at RT in formaldehyde 0.75% final | 250 W, 30 sec ON/30 sec OFF/20 cycle (20 min) |
800-250 bp ladder | Abcam 社 protocol |
| サンプル種：U2OS cells | |||||
| 1.4 ml, 2x107 cells |
TBP, RNA polymerase II, Suv39H1, Paf1 etc. |
10 min at RT in formaldehyde 0.75% final | 250 W, 30 sec ON/30 sec OFF/7 cycle (7 min) |
800-250 bp ladder | Abcam 社 protocol |
| サンプル種：HL60 | |||||
| 1.4 ml, 2x107 cells |
TBP, RNA polymerase II, Suv39H1, Paf1 etc. |
10 min at RT in formaldehyde 0.75% final | 250 W, 30 sec ON/30 sec OFF/20 cycle (20 min) |
800-250 bp ladder | Abcam 社 protocol |
| サンプル種：MCF7 | |||||
| 1.4 ml, 2x107 cells |
TBP, RNA polymerase II, Suv39H1, Paf1 etc. |
10 min at RT in formaldehyde 0.75% final | 250 W, 30 sec ON/30 sec OFF/25 cycle (25 min) |
800-250 bp ladder | Abcam 社 protocol |
| 容器：− | |||||
| サンプル量 | 標的タンパク質 | ホルムアルデヒド 処理 |
UCD-250 使用条件 |
DNA 長 | ChIP assay Protocol |
| サンプル種：酵母 (超音波処理前にビーズで破砕) | |||||
| OD=10, 4 ml |
転写因子 | 30 min at RT in formaldehyde 4% final | 250 W, 30 sec ON/1 min OFF/5 cycle (7.5 min) |
1000-500 bp ladder | − |
技術情報
Bioruptor 使用文献＆参考資料リスト
記事ID ： 5383
5. 付録１ UCD-250型（出力250W）によるChIP assay処理例
