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記事ID : 11397
研究用

キャリーオーバー・クロスコンタミを防ぐUDG入りホットスタートプレミックス Bioneer社 AccuPower® HotStart PCR PreMix(with UDG)

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AccuPower® HotStart PCR PreMix(with UDG) は、PCRでDNAを増幅して検出するための、ready-to-useのPCRマスターミックスで、各種PCR検出に最適です。

ウラシルDNAグリコシラーゼ、dA、dG、dC、dTTP、dUTP、反応バッファーをプレミックスして凍結乾燥しています。ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、単一分子を何億倍以上に増幅することができますが、非常に小さなコンタミネーションも増幅されてしまい、偽陽性結果につながってしまいます。このようなコンタミネーションは、多くの場合過去に実施したPCR増幅産物に由来しています(キャリーオーバーコンタミネーション)。このようなコンタミネーションを防ぐために、ウラシルDNAグリコシラーゼ(UDG)を用います。ウラシルと糖の間のN-グリコシル結合の加水分解を触媒し、94℃の加熱でPCRミクスチャーの汚染(ウラシル含有DNA)を分解することができます。本製品では、このUDGキャリーオーバー防止技術と、操作が簡便で安定性の高いTop ポリメラーゼを組み合わせました。

AccuPower® PCR PreMix シリーズ

特長

  • キャリーオーバーコンタミネーションの防止
    UDGとdUTPが反応間のキャリーオーバーPCR産物の再増幅を防ぎます。dUTPが増幅DNAにウラシルを取り込ませる一方で、UDGは1本鎖又は2本鎖DNAからウラシル残基を除去し、将来のPCR実験の偽陽性結果を防ぎます。PCRサイクル前のUDGインキュベーションステップ(37℃、2分間)により、dUを含む以前の反応産物が分解されます。UDGは、その後の通常のPCRサイクルの高温で不活性化され、本来のターゲット配列の増幅を可能にします(図1)。
    キャリーオーバーコンタミネーションの防止
    図1 キャリーオーバーコンタミネーションの防止
  • 特異性
    Mg2+と強い親和性を持つピロリン酸をリアクションミクスチャーに加えることで、DNA ポリメラーゼ活性を阻害し、PCRサイクル前の非特異的産物の形成を防ぎます。サイクル開始時に、ミクスチャーに含まれるピロホスファターゼが活性化(>70℃)し、ピロリン酸を加水分解してMg2+を放出し、これによりDNAポリメラーゼが通常に反応できるようになります。
  • 簡単
    テンプレートDNA、プライマー、水を加えるだけでPCRが開始できます。電気泳動用のアガロースゲルへのロードに必要な試薬も添加されており、PCR完了後ローディングダイを加える必要はありません。
  • 再現性
    厳格な品質管理体制で製造され、エラーが発生した場合には製品の包装過程で確実に除外されます。Bioneer社のバッチ処理システムにより、正確で再現性の高い製品が製造されます。

アプリケーション

ゲノム、cDNA、低コピー数のターゲット、マルチプルプライマーペアのPCR、分子診断

仕様

  • 5' - 3' エキソヌクレアーゼ活性: No
  • 3' - 5' エキソヌクレアーゼ活性: No
  • 3' - A オーバーハング: Yes
  • フラグメントサイズ: 最大12kb

使用例

AccuPower(R) HotStart PCR PreMixとの特異性比較
図2 AccuPower® HotStart PCR PreMixとの特異性比較
p53遺伝子をターゲットとする7ペアのプライマーを用いて特異性をテストした。
反応条件:37℃2分間→95℃5分間→95℃20秒、55℃40秒、72℃1分間を30サイクル
DNAの量:10ng
PCR増幅サイズ:
レーン1:139bp、レーン2:211bp、レーン3:447bp、レーン4:618bp、レーン5:1082bp、レーン6:1296bp、レーン7:1561bp、レーンM:100bp DNA ラダー

AccuPower(R) HotStart PCR PreMixとの感度比較
図3 AccuPower® HotStart PCR PreMixとの感度比較
ヒトゲノムDNAを段階希釈して感度テストを行った。
反応条件:37℃2分間→95℃5分間→95℃20秒、55℃20秒、72℃30秒を30サイクル
DNAの量:
レーン1:10ng、レーン2:1ng、レーン3:100pg、レーン4:10pg、レーンM:100bp DNA ラダー

PCR産物(ウラシル塩基を含まない)の増幅品質
図4 PCR産物(ウラシル塩基を含まない)の増幅品質
ウラシル塩基を含まないPCR産物を段階希釈して、増幅品質テストを行った(コントロールとしてAccuPower® HotStart PCR PreMixも同様に操作した)。
反応条件:図3と同じ
PCR産物のコピー数:
レーン1:1011copy、レーン2:1010copy、レーン3:109copy、レーン4:108copy、レーン5:107copy、レーン6:106copy、レーン7:105copy、レーン8:104copy、レーンN:テンプレートなし、レーンM:100bp DNAラダー

PCR産物(ウラシル塩基を含む)に対するウラシルDNAグリコシラーゼ(UDG)の効果
図5 PCR産物(ウラシル塩基を含む)に対するウラシルDNAグリコシラーゼ(UDG)の効果
ウラシル塩基を含むPCR産物を段階希釈して、UDG効果をテストした(コントロールとしてAccuPower® HotStart PCR PreMixも同様に操作した)。
反応条件:図3と同様
PCR産物のコピー数:
レーン1:1011copy、レーン2:1010copy、レーン3:109copy、レーン4:108copy、レーン5:107copy、レーン6:106copy、レーン7:105copy、レーン8:104copy、レーンN:テンプレートなし、レーンM:100bp DNAラダー

AccuPower® HotStart PCR PreMix(with UDG)

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
AccuPower(R) HotStart PCR PreMix (with UDG)詳細データ BIN K-5050-1 96 TUBE
¥24,000
AccuPower(R) HotStart PCR PreMix (with UDG)詳細データ BIN K-5051-1 480 TUBE
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商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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