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研究用

NEXTflex™ DNA シーケシングキット(Ion Torrent 対応)

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Ion Torrent 専用のNEXTflex™ DNA シーケンシングキットはLife Tech 社のIon Torrent シーケンシングプラットフォームを使用してゲノムDNA もしくはChIP-Seq ライブラリーをシーケンシングするためのキットです。

本キットの特長 “Enhanced Adapter Ligation Technology” を採用したことにより、より多くのユニークなシーケンシングリードを含むライブラリーの作製を可能にしました。マスターミックス試薬やビーズベースのクリーンアップを使用することでワークフローが簡易化しています。さらに、96ウェルプレートでの反応が行えるように他の適用商品よりもさらに自動化に対応しています。

<特集ページはこちら>株式会社パーキンエルマージャパン NGS ライブラリ調製キット
 特集:次世代シーケンシング The NGS Experts™

背景

“Enhanced Ligation Adapter Technology”とは?

 従来市販されているT4 DNA リガーゼに比べて、極めて高い率(106 に比べて109 以上)でDNA ニックを修復するようにデザインされたリガーゼを用いることにより、株式会社パーキンエルマージャパンはライブラリ調製でのアダプターライゲーションを激変させました。アダプター配列への独自の修飾が、ダイマー形成を減らし、デュアルアダプターライゲーションを増加させます。NEXTflex™ ライゲーションミックスを使用することにより、ユニークリード、配列多様性、coverage が向上します。

NEXTflex™ と他社X 調製ライブラリのシーケンシングデータ概要
  サンプル ゲノムサイズ(Mb) リード長(bp) インサートサイズ(bp) リード数 リードCoverage Perfectly Mapped Reads # of Unknown Bases Contig N50
NEXTflex™ E.coli 5 36 200 29,718,673 115 0.96 3201 102,408
他社Xキット E.coli 5 36 200 19,311,940 75 0.89 6540 95,299

特長

  • フレキシブルなバーコードオプション- キットには8、16、32、64種類のユニークなバーコードが含まれています(別売品)
  • 96ウェルプレートに適したボリュームの簡易化ワークフロー
  • ChIP-Seq に準拠
  • Life Tech 社のIon Torrent シーケンシングプラットフォームに準拠

構成内容

  • NEXTflex™ エンドリペアーバッファーミックス
  • NEXTflex™ エンドリペアー酵素ミックス
  • NEXTflex™ ライゲーションミックス
  • NEXTflex™ アダプターミックス*
  • NEXTflex™ プライマーミックス
  • NEXTflex™ PCR マスターミックス
  • ローディング色素(6×)
  • MW ラダー(Ready-to-Liad 100 bp)
  • カラム溶出バッファー
  • Nuclease-free Water
  • 再懸濁バッファー
  • DNA 結合バッファー
  • 5 X DNA 洗浄バッファー
  • Clean-Up スピンカラム

*品番:4001-02 には含まれません。

プロトコール

NEXTflex DNA シーケシングキットのプロトコール

他社との比較

表1 Ion Torrent 用NEXTflex™ と他社DNA ライブラリー調製キットの比較
  NEXTflex™ DNA Seq Kit 従来のプロトコール
Enhanced Adapter Ligation Technology Yes No
96 ウェルプレートへの互換性 Yes No
自動化対応 Yes Less so
サイズ選別用試薬の構成品 Yes No
サンプル必要量 10ng-1μg 10ng-1μg

NEXTflex™ DNA シーケシングキット

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
NEXTflex(R) DNA-Seq Kit for Ion PGMTM and Ion ProtonTM PEJ NOVA-4001-01 8 RXN
¥37,400
NEXTflex(R) DNA-Seq Kit for Ion PGMTM and Ion ProtonTM PEJ NOVA-4001-02 48 RXN
¥177,300

※48 回分(品番:4001-02)にはDNA アダプターが含まれません。別途、Ion Torrent 対応NEXTflex™ DNA-Seq バーコードが必要です。

DNA-Seq マルチプレキシングオプション
Ion Torrent 用のNEXTflex™ DNA バーコードは改良したマルチプレキシングワークフローやフレキシブルなセットアップをご提供するインデックス配列を含んでいます。このフォーマットは64サンプルまでのマルチプレキシングを可能にします。NEXTflex™ DNA バーコードは8、16、32、64種類のユニークなアダプターのセットでご提供します。

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お問い合わせ

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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