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研究用

PCR不要のシーケンシングキット、バイアス低減 NEXTflex™ PCR-Free DNAシーケンシングキット(Illumina 社対応)

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NEXTflex™ PCR-Free DNA シークエンシングキットは、Illumina®/Solexa ® GAII、HiSeq 2000/1000等のシーケンサープラットフォームを使用して、single、paired-end、multiplexed ゲノミックDNAをシーケンスするためのキットです。

<特集ページはこちら>株式会社パーキンエルマージャパン NGS ライブラリ調製キット
 特集:次世代シーケンシング The NGS Experts™

使用目的

本キットは、同メーカーのNEXTflex™ DNA シーケンシングキットの特長を備え、かつ増幅ステップが必要ありません。

ATまたはGCリッチなゲノム領域の増幅は、しばしばシーケンスバイアスのあるヌクレオチド組成を招きます。特別な配合のマスターミックス酵素を使用することで、NEXTflex™ PCR-Free DNA シーケンシングキットは増幅ステップを取り除き、より良いリードマッピングやduplicate sequence の減少を可能にします。その結果シーケンシングコストの減少や、より代表的な塩基同定とより正しいde novo アセンブリのためのバイアスの低減がもたらされます。バイアス評価時に、低品質のリードやGCリッチなリードの存在は、リファレンスゲノムに対してアラインメントできない場合があります。GCリッチなプロファイルはより高いGC含有量にシフトする傾向があります。PCRステップがないことで、この含有量のバイアスを除きます。PCRはまた相当な量の重複遺伝子の原因となり、シーケンスコスト、アダプターダイマーおよびクラスター検出時のノイズを増大させます。

特長

  • PCR不要、バイアス低減
  • GCまたはATリッチな配列のシーケンシングに有用
  • リードマッピング向上
  • Duplicate sequenceを削減
  • SingleまたはPaired-end readsに利用可能
  • 自動化に対応
  • マスターミックス付きで、簡単なプロトコール
  • ビーズによる精製方法を採用

構成内容

  • NEXTflex™ PCR-Free エンドリペアーミックス
  • NEXTflex™ PCR-Free アデニレーションミックス
  • NEXTflex™ PCR-Free ライゲーションミックス
  • NEXTflex™ PCR-Free DNAアダプター*
  • 6×ローディング色素
  • MWラダー(Ready-to-Load-100bp)
  • Nuclease-free Water
  • 再懸濁バッファー
  • カラム溶出バッファー
  • DNA結合バッファー
  • DNA洗浄バッファー
  • Clean-Upスピンカラム

*品番:5142-02には含まれません。

NEXTflex™ PCR-Free DNAシーケンシングキットと、従来キットとの比較

  従来法 NEXTflex™PCR-Free DNAシーケンシングキット NEXTflex™ DNAシーケンシングキット
推奨増幅回数 10〜12 cycle NO 10〜12 cycle
実験時間 極短
自動化対応 NO YES YES
磁気ビーズによる精製 NO YES YES
1反応あたりの価格 +++ + +
改良アダプターライゲーション技術 NO YES YES
PCR-Free用酵素 NO YES NO

フローチャート

NEXTflex PCR-Free DNAシーケンシングキットのフローチャート

NEXTflex™ PCR-Free DNAシーケンシングキット

※48回分(品番:5142-02)にはDNAアダプターが含まれません。別途、NEXTflex™ PCR-freeバーコードアダプターが必要です。

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
NEXTflex(R) PCR-Free DNA Sequencing Kit PEJ NOVA-5142-01 8 RXN
¥86,300
NEXTflex(R) PCR-Free DNA Sequencing Kit PEJ NOVA-5142-02 48 RXN
¥400,200

NEXTflex™ PCR-Free DNAバーコード

NEXTflex™ PCR-Free DNA Sequencingキットと組み合わせてマルチプレックス解析に!

ハイスループットシーケンシングを可能にします。本キットはスケールを増幅し、一方で複数のライブラリーを1フローセルレーンにプールすることでコストを軽減しています。

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
NEXTflex(R) PCR-Free Barcodes - 6 PEJ NOVA-514110 48 RXN
¥99,000
NEXTflex(R) PCR-Free Barcodes - 12 PEJ NOVA-514111 96 RXN
販売終了
NEXTflex(R) PCR-Free Barcodes - 24 PEJ NOVA-514112 192 RXN
¥386,800
NEXTflex(R) PCR-Free Barcodes - 48 PEJ NOVA-514113 384 RXN
販売終了

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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