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研究用

Ion PGM™ と Ion Proton™ に対応したセルフリーDNAライブラリ調製キット NEXTflex™ Cell Free DNA Sequencing Kit for Ion PGM™ and Ion Proton™

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NEXTflex™ Cell Free DNA Sequencing Kit for Ion PGM™ and Ion Proton™はLife Technologies社のIon Torrent PGM and Ion Protonプラットフォームを使用したシーケンスのために、1-5ng のセルフリーDNAからDNA-seq用のNGSライブラリを調製するために設計されています。

NEXTflex Cell Free DNA Sequencing Kit はマスターミックス試薬と磁気ビーズ精製で、ライブラリ調製におけるピペッティングや煩雑な手順を削減し、ワークフローを簡易化します。さらに、最大64種類の独自のアダプターバーコードの利用により、ハイスループットなアプリケーションを可能にします。

シーケンスするためのゲノムDNAの調製には、5つの主要なステップがあります。それは、DNA抽出、 DNAエンドリペア、サイズ選択(オプション)、アダプターライゲーションおよびPCR増幅です。本キットには、エマルジョンPCRおよびその後のシーケンスのための精製DNAを調製するための必要な試薬がすべて含まれています。

NEXTflex™ Cell Free DNA Sequencing Kit for Ion PGM™ and Ion Proton™

<特集ページはこちら>株式会社パーキンエルマージャパン NGS ライブラリ調製キット

背景

セルフリーDNAは、血漿中にある独自のDNA分子であり、臨床応用で強力なマーカーとなっています。母体血漿からの胎児DNAの検出は、胎児の多様な特性を識別することが出来る非侵襲的な選択肢であることが証明されました。たとえば、性決定、性染色体連鎖疾患および異数性の検出が含まれます。また、患者の血漿から抽出された血中循環腫瘍DNAは、診断、予後、治療決定のための非侵襲的な試料として使用され、癌患者の経過を観察することができます。

特長

  • セルフリーインプットDNAの必要量はわずか1-5ng
  • 独自のアダプターライゲーション技術("Enhanced Adapter Ligation Technology")によってより大きなリード数を実現
  • フレキシブルなアダプターバーコード ‐8、16、32または64種類の独自バーコード
  • 96-well plateに対応したボリュームで簡易的なワークフロー
  • セルフリーDNAからのIon Torrent PGM & Ion Proton DNA-seq ライブラリ調製に最適

Ion PGM および Ion Proton Cell Free DNA-Seqに適応したマルチプレックスオプション

Ion PGM™とIon Proton™ のNEXTflex™ DNAバーコードは、インデックス付き配列を含むアダプタによって、フレキシブルな設定でマルチプレックスなワークフローを提供します。この方法は、最大64サンプルのマルチプレックスを可能にします。 NEXTflex™ DNAバーコードは8 、 16 、 32、 64の独自なアダプタをそれぞれセットでご利用いただけます。頑強なデータ品質を提供しながら、効率的な方法でプールサンプルの操作時間を大幅に短縮します。

構成内容

NEXTflex Ion PGM and Ion Proton Cell Free DNA-Seq ライブラリ調製キットはIon Torrent PGMとIon Protonに対応した次世代シーケンスするための8または48のゲノムDNAサンプル分の試薬が含まれています。

  • NEXTflex™ エンドリペアバッファーミックス
  • NEXTflex™ エンドリペア酵素ミックス
  • NEXTflex™ ライゲーションミックス
  • NEXTflex™ アダプターミックス(6.25 µM)
  • NEXTflex™ プライマーミックス(12.5 µM)
  • NEXTflex™ 5×PCR マスターミックス
  • Nuclease-free 水
  • NEXTflex™ Resuspension バッファー

<その他で必要な試薬・機械>

  • 40 µL Nuclease-free 水に溶解した1-5 ngのセルフリーDNA
  • NEXTflex™ DNA Barcodes for Ion PGM™ and Ion Proton™ – 8 / 16 / 32 / 64 (Cat # 4010-01, 4010-02, 4010-03, 4010-04)
  • 96 ウェルPCR プレート(ノンスカート) (Phenix Research, Cat # MPS-499 or similar)
  • 96 ウェルプレート(ライブラリ保存用) (Fisher Scientific, Cat # AB-0765 or similar)
  • PCR プレートシール (BioRad, Cat # MSB1001)
  • PCR反応産物精製キット‐Agencourt AMPure XP 5 mL (Beckman Coulter Genomics, Cat # A63880)
  • 磁気スタンド-96 (Ambion, Cat # AM10027 or similar)
  • サーマルサイクラ―
  • 2,10,20,200,1000 µL ピペット / マルチチャンネルピペット,ピペットチップ
  • Nuclease-free バリアピペットチップ
  • 微量遠心機
  • 1.5 mL Nuclease-free エッペンチューブ
  • ボルテックス

プロトコル‐概要‐

NEXTflex™ Cell Free DNA-Seq Kit プロトコル
図1.NEXTflex™ Cell Free DNA-Seq Kit プロトコル

NEXTflex™ Cell Free DNA Sequencing Kit for Ion PGM™ and Ion Proton™

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
NEXTflex(R) Cell Free DNA-Seq Kit for Ion PGMTM and Ion ProtonTM PEJ NOVA-4002-01 8 RXN
販売終了
NEXTflex(R) Cell Free DNA-Seq Kit for Ion PGMTM and Ion ProtonTM PEJ NOVA-4002-02 48 RXN
¥177,300

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