ホルマリン固定パラフィン包埋サンプルからクロマチン免疫沈降によりDNAを回収・精製 Chromatrap® FFPE ChIP-Seq キット

Chromatrap® FFPE ChIP-Seq キットは、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織からクロマチンを抽出し、クロマチン免疫沈降法（ChIP）により高品質なDNAを回収・精製するキットです。

本キットは、組織サンプル、生検材料、溶解が困難なサンプルに最適です。

磁気ビーズやアガロースビーズを使用しないため、非特異的なバックグラウンドが低く、操作ミスやサンプルのロスを減らすことができます。

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Chromatrap® とは？

Chromatrap® は、ChIP（クロマチン免疫沈降法）をより迅速・効率的に行うことのできる、固相フィルターを用いた技術です。

従来の方法と比較して、下記のような特長があります。

• 迅速
• 高い信頼性
• 簡単
• 高感度で、ターゲット量が少ない場合に最適

• 精製したDNAは、qPCR とシーケンシングの両方に使用できます
• 広範囲のクロマチン量に対応し、シーケンス用ライブラリー調製に十分な量を濃縮できます
• 少量のサンプルでも良好な結果が得られます
• キットに付属の Chromatrap® 精製カラムにより、DNAを簡単に精製
• 1キットで、最大10回のクロマチン調製と 、24回の ChIP アッセイ が可能です

キット構成品

• Chromatrap® spin column^※ （24個）
• Column Conditioning Buffer
• Wash Buffer 1
• Wash Buffer 2
• Wash Buffer 3
• FFPE Elution Solution
• 5 M NaCl
• 1 M NaHCO₃
• Protease Inhibitor Cocktail (PIC)
• Proteinase K stop solution
• Proteinase K
• 1.5 mL Collection tube
• Paraffin Removal Solution
• FFPE Lysis Buffer
• Digestion Buffer
• Enzymatic Shearing Cocktail
• Enzymatic Stop Solution
• FFPE Extraction Buffer
• Chromatrap® DNA purification column （24個）
• DNA binding buffer
• DNA wash buffer
• DNA elution buffer

※品番 500235 は「Chromatrap® Protein A spin column」、品番 500236 は「Chromatrap® Protein G spin column」です。

その他で必要となる試薬・機器

［試薬・消耗品］

• DNase フリー水
• 無水エタノール（molecular biology grade）
• 70% エタノール
• 50% エタノール
• 20% エタノール
• マイクロ遠心チューブ
• ピペットチップ（フィルターチップを推奨）
• 目的のタンパク質を認識する ChIP 検証済み抗体
• 目的遺伝子の qPCR プライマー
• PCR プレート
• ポジティブコントロール抗体
• ネガティブコントロール抗体
• フェノール：クロロホルム：イソアミルアルコール（25:24:1）
• クロロホルム：イソアミルアルコール（24:1）
• 3 M 酢酸ナトリウム pH 5.0
• Tris-HCl pH 8.0
• 100 bp DNA ラダー

［オプション］

• Linear Polyacrylamide (LPA)
• Low DNA binding マイクロ遠心チューブ
• PCR 精製キット

関連情報

• 特集：エピジェネティクス (分子機構 / 解析技術)

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