ネイティブ法により次世代シーケンシング（NGS）ライブラリ調製用の高品質なDNAを精製 Chromatrap® Native ChIP-seq キット

Chromatrap® ネイティブ ChIP-seq キットは、細胞を架橋剤で処理せずにクロマチンを抽出し、クロマチン免疫沈降法（ChIP）により高品質なDNAを回収・精製するキットです。

従来のクロスリンク法の代替としてご使用いただけます。

磁気ビーズやアガロースビーズを使用しないため、非特異的なバックグラウンドが低く、操作ミスやサンプルのロスを減らすことができます。

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Chromatrap® とは？

Chromatrap® は、ChIP（クロマチン免疫沈降法）をより迅速・効率的に行うことのできる、固相フィルターを用いた技術です。

従来の方法と比較して、下記のような特長があります。

• 迅速
• 高い信頼性
• 簡単
• 高感度で、ターゲット量が少ない場合に最適

ネイティブのクロマチンでは、タンパク質とヒストンに巻きついたDNAが自然に結合しており、従来の方法で断片化を行うと、DNA-タンパク質複合体が解離する可能性があります。そのため、クロマチンを酵素消化することで、DNAを断片化します。
本キットはヒストン修飾や、DNAに結合する可能性のある転写因子の研究にご使用いただけます。

• 精製したDNAは、qPCR とシーケンシングの両方に使用できます
• 広範囲のクロマチン量（1-50µg）に対応し、少量のサンプルでも良好な結果が得られます
• ヒストン修飾や少量の転写因子の濃縮に最適です
• キットに付属の Chromatrap® 精製カラムにより、DNAを簡単に精製
• 1キットで、10回のクロマチン調製と 24回の ChIP アッセイ が可能です

キット構成品

• Chromatrap® spin column^※
• Hypotonic Buffer
• N-ChIP Digestion Buffer
• ChIP Dialysis Buffer
• Resuspension Buffer
• Separating Solution 1
• Separating Solution 2
• Enzymatic Stop Solution
• Column Conditioning Buffer
• Wash Buffer 1
• Wash Buffer 2
• Wash Buffer 3
• N-ChIP Elution Buffer
• Shearing Cocktail
• Protease Inhibitor Cocktail (PIC)
• Proteinase K
• Proteinase K Stop Solution
• 1.5 mL Collection tube
• Chromatrap® DNA purification column （24個）
• DNA Binding Buffer
• DNA Wash Buffer
• DNA Elution Buffer

※品番 500237 は「Chromatrap® Protein A spin column」、品番 500238 は「Chromatrap® Protein G spin column」です。

その他で必要となる試薬・機器

［試薬・消耗品］

• PBS
• ヌクレアーゼフリー水
• 100bp ラダー
• セルスクレイパー
• マイクロ遠心チューブ
• PCR プレート
• ピペット、チップ（フィルターチップを推奨）
• ChIP 検証済み抗体
• 目的遺伝子の qPCR プライマーペア
• PCR 精製キット（例： Illustra GFX PCR DNA and Gel Band Purification Kit）
• 0.1% SDS 溶液
• エタノール（95-100%）

［オプション］

• フェノール・クロロホルム
• 3 M 酢酸ナトリウム pH 5.2
• Linear Polyacrylamide (LPA)

関連情報

• 特集：エピジェネティクス (分子機構 / 解析技術)

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