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記事ID : 16778
研究用

ネイティブ法により次世代シーケンシング(NGS)ライブラリ調製用の高品質なDNAを精製Chromatrap® Native ChIP-seq キット

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Chromatrap® ネイティブ ChIP-seq キットは、細胞を架橋剤で処理せずにクロマチンを抽出し、クロマチン免疫沈降法(ChIP)により高品質なDNAを回収・精製するキットです。

従来のクロスリンク法の代替としてご使用いただけます。

磁気ビーズやアガロースビーズを使用しないため、非特異的なバックグラウンドが低く、操作ミスやサンプルのロスを減らすことができます。

背景

Chromatrap® とは?

Chromatrap® は、ChIP(クロマチン免疫沈降法)をより迅速・効率的に行うことのできる、固相フィルターを用いた技術です。

従来の方法と比較して、下記のような特長があります。

  • 迅速
  • 高い信頼性
  • 簡単
  • 高感度で、ターゲット量が少ない場合に最適

使用目的

ネイティブのクロマチンでは、タンパク質とヒストンに巻きついたDNAが自然に結合しており、従来の方法で断片化を行うと、DNA-タンパク質複合体が解離する可能性があります。そのため、クロマチンを酵素消化することで、DNAを断片化します。
本キットはヒストン修飾や、DNAに結合する可能性のある転写因子の研究にご使用いただけます。

特長

  • 精製したDNAは、qPCR とシーケンシングの両方に使用できます
  • 広範囲のクロマチン量(1-50µg)に対応し、少量のサンプルでも良好な結果が得られます
  • ヒストン修飾や少量の転写因子の濃縮に最適です
  • キットに付属の Chromatrap® 精製カラムにより、DNAを簡単に精製
  • 1キットで、10回のクロマチン調製と 24回の ChIP アッセイ が可能です

構成内容

キット構成品

  • Chromatrap® spin column
  • Hypotonic Buffer
  • N-ChIP Digestion Buffer
  • ChIP Dialysis Buffer
  • Resuspension Buffer
  • Separating Solution 1
  • Separating Solution 2
  • Enzymatic Stop Solution
  • Column Conditioning Buffer
  • Wash Buffer 1
  • Wash Buffer 2
  • Wash Buffer 3
  • N-ChIP Elution Buffer
  • Shearing Cocktail
  • Protease Inhibitor Cocktail (PIC)
  • Proteinase K
  • Proteinase K Stop Solution
  • 1.5 mL Collection tube
  • Chromatrap® DNA purification column (24個)
  • DNA Binding Buffer
  • DNA Wash Buffer
  • DNA Elution Buffer

※品番 500237 は「Chromatrap® Protein A spin column」、品番 500238 は「Chromatrap® Protein G spin column」です。

その他で必要となる試薬・機器

[試薬・消耗品]

  • PBS
  • ヌクレアーゼフリー水
  • 100bp ラダー
  • セルスクレイパー
  • マイクロ遠心チューブ
  • PCR プレート
  • ピペット、チップ(フィルターチップを推奨)
  • ChIP 検証済み抗体
  • 目的遺伝子の qPCR プライマーペア
  • PCR 精製キット(例: Illustra GFX PCR DNA and Gel Band Purification Kit)
  • 0.1% SDS 溶液
  • エタノール(95-100%)

[オプション]

  • フェノール・クロロホルム
  • 3 M 酢酸ナトリウム pH 5.2
  • Linear Polyacrylamide (LPA)

Native クロマチン調製 概要

Native クロマチン調製 概要

Chromatrap® Native ChIP-seq Protein A

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
qPCR & Sequencing Chromatrap Native Pro-A ChIP kit for enzymatic shearing only詳細データ PVS 500237 24 ASSAY
¥215,000

Chromatrap® Netive ChIP-seq Protein G

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
qPCR & Sequencing Chromatrap Native Pro-G ChIP kit for enzymatic shearing only詳細データ PVS 500238 24 ASSAY
¥215,000

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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