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記事ID : 33779
研究用

短時間でChIP-seq ライブラリを調製Chromatrap® UniqSeq

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Chromatrap®UniqSeqキットは、8時間以内にクロマチン免疫沈降シーケンス (ChIP-Seq)用のライブラリを調整することができる画期的な商品です。さまざまなサンプル由来の少量の細胞から、高品質のライブラリを得ることができます。

背景

Chromatrap® とは?

Chromatrap® は、ChIP(クロマチン免疫沈降法)をより迅速・効率的に行うことのできる、固相フィルターを用いた技術です。

従来の方法と比較して、下記のような特長があります。

  • 迅速
  • 高い信頼性
  • 簡単
  • 高感度で、ターゲット量が少ない場合に最適

特長

  • ChIPアッセイからライブラリ調製に必要な試薬が全て揃ったキット品
    (24チップ、24ライブラリ、12インデックス)
  • 洗浄不要(1チューブ反応)
  • ChIPアッセイにより回収したサンプルから次世代シーケンシング用のライブラリ作製が可能(検証済)
  • 高感度・高効率・簡便なビーズフリーChIPアッセイが可能
  • GCバイアスを最小限に、ライブラリ収量を最大限にする正確性の高いPCR酵素mix
  • 重複率が低く複合的で高品質なライブラリを作製、イルミナ社機器に対応すindexプライマーを付属

構成内容

キット構成品

1.【ChIP試薬】

  • Chromatrap® spin columns※1
  • Column Conditioning Buffer
  • Wash Buffer 1〜3
  • 1.3 M Glycine
  • Lysis Buffer
  • Digestion Buffer (only in 500266 and 500267)
  • ChIP-seq Enzymatic Stop Solution (only in 500266 and 500267)
  • ChIP-seq Elution Buffer
  • 5 M NaCl
  • 1 M NaHCO3
  • Hypotonic Buffer
  • H3K4me3 antibody
  • Immunoglobulin G
  • Shearing Cocktail※2 (only in 500266 and 500267)
  • Protease Inhibitor Cocktail (PIC)
  • Proteinase K stop solution
  • Proteinase K
  • Forward primer
  • Reverse primer
  • 1.5 ml Collection tube
  • Chromatrap® DNA purification columns
  • DNA Binding Buffer
  • DNA Wash Buffer
  • DNA Elution Buffer

※1 品番 500264, 500266 は「Chromatrap® Protein A spin column」、品番 500265, 500267 は「Chromatrap® Protein G spin column」です。
※2 凍結融解サイクルの回数を最小限に抑え、カクテルの活性を維持するために、キットの受け取り時にShearing Cocktailを分注することが推奨されます。

2.【ライブラリ調製試薬】

  • End Prep and Tail Enzyme
  • End Prep and Tail Buffer
  • Ligation Mix
  • Adapter Ligase
  • Adapter for Illumina®
  • Loop Restriction Enzyme
  • Library Enrich and Index Mix
  • I5 primer for Illumina®
  • Index primer 1〜12 for Illumina®

*この1と2のキットはDNaseフリーで製造されており、最適温度で保存した場合、最大6ヶ月間安定です。

Chromatrap® ChIP-seq 概要

Chromatrap® ChIP-seq 概要

Chromatrap® ChIP-seq プロトコール

ステップ プロセス 所要時間
1 細胞固定・回収 0.5 時間
2 細胞溶解・クロマチン断片化 0.5 時間
3 免疫沈降 1 時間
4 リバースクロスリンク・DNA精製 3.5 時間
5 定量PCR解析 1 時間
6 Chromatrap®NGSライブラリーの調製 5 時間
7 ライブラリの定量と品質分析 2 時間

※Chromatrap®UniqSeqライブラリー調製キット(品番500264/500265)を使用する場合。
他キットをご使用の場合、所要時間は異なります。(最長で2日かかることがあります。)

製品データ

ChIP qPCRによる標的濃縮と感度
図.1 ChIP qPCRによるターゲットの濃縮と感度の比較

Chromatrap®UniqSeqからの高いライブラリ収量1 Chromatrap®UniqSeqからの高いライブラリ収量2

図.2 Chromatrap®UniqSeqからの高いライブラリ収量

UniqSeq Plus Library Prep Sonication Pro A

カラムタイプ:Chromatrap® Protein A spin column

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
UniqSeq Plus Library Prep Sonication Pro A詳細データ PVS 500264 1 KIT
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UniqSeq Plus Library Prep Sonication Pro G

カラムタイプ:Chromatrap® Protein G spin column

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
UniqSeq Plus Library Prep Sonication Pro G詳細データ PVS 500265 1 KIT
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UniqSeq Plus Library Prep Enzymatic Pro A

カラムタイプ:Chromatrap® Protein A spin column
※ Enzymatic Stop Solution, Shearing Cocktail が含まれます。

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
UniqSeq Plus Library Prep Enzymatic Pro A詳細データ PVS 500266 1 KIT
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UniqSeq Plus Library Prep Enzymatic Pro G

カラムタイプ:Chromatrap® Protein G spin column
※ Enzymatic Stop Solution, Shearing Cocktail が含まれます。

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
UniqSeq Plus Library Prep Enzymatic Pro G詳細データ PVS 500267 1 KIT
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商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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