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CK1εはセリンスレオニンタンパク質キナーゼのCK1ファミリーメンバーであり、DNA複製や修復をはじめとする多様な細胞プロセスにおいて重要な役割を担う。CK1εは、臓器サイズの主要な調節因子かつヒト癌遺伝子である可能性のあるYes関連タンパク質(YAP)転写活性化補助因子の調節因子である。CK1εはCCK2Rにより活性化され、その後、PKD2のSer244をリン酸化する。ヒト胃癌細胞では、PKD2はリン酸化により核内で蓄積され、核内PKD2基質を効率よくリン酸化する。CK1εは、トポイソメラーゼ(topo)II αのSer-1106をリン酸化し、これによりtopo II標的薬の酵素活性と感受性を調節する。