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研究用

ミスマッチ修復遺伝子の解析に NEXTflex™ Colon-1 Amplicon Panel（Illumina 社対応）

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メーカー名：株式会社パーキンエルマージャパン

NEXTflex™ Colon-1 Amplicon Panelは、56のPCRプライマーを使用し、MLH1およびMSH2遺伝子座の36エクソンを標的とした検証済の完全なソリューションです。解析に必要なDNA（新鮮／凍結サンプルから生成）量はわずか20 ngです。
デザイン済パネルなので、プライマー設計やターゲットセレクションに時間を浪費することなく、データ作成や解析に集中することができます。また、リキッドハンドラー（liquid handler）によるオートメーション化や、ワークフローをより簡易化することも可能です。

＜特集ページはこちら＞株式会社パーキンエルマージャパン NGS ライブラリ調製キット

特長

  • MLH1とMSH2を100%カバレッジ
    標的とするコーディングエクソン領域および隣接するイントロン-エクソン境界を100%カバレッジ
  • 0.2×カバレッジでアンプリコンの均一性は98%、0.1×平均カバレッジでアンプリコンを100%検出
  • 384種類の独自のバーコードを用意
  • ターゲットシーケンスのための完全なソリューション
    本キットは、遺伝子特異的プライマー、PCRマスターミックス、クリーンアップビーズ、最大384バーコードを含みます。
  • 少ないインプットDNA量
    DNAの最低必要量はわずか 20 ng
  • ISO 13485 準拠施設で製造

構成内容

「NEXTflex™ Colon-1 Amplicon Panel」は、新鮮／凍結サンプルから単離したDNAから、8、48または96サンプルを調製するために十分な試薬が含まれます。

NEXTflex™ Obesity-1 Amplicon Panel（Illumina 社対応）

  • NEXTflex™ Colon-1 Ampliconプライマーミックス 1
  • NEXTflex™ Colon-1 Ampliconプライマーミックス 2
  • NEXTflex™ PCR エンハンサー 1
  • NEXTflex™ PCR エンハンサー 3
  • NEXTflex™ PCR エンハンサー 4
  • NEXTflex™ Hot Start PCR I マスターミックス
  • NEXTflex™ ライゲーションミックス
  • NEXTflex™ Amplicon DNA アダプター
  • NEXTflex™ PCR II バーコード化プライマーミックス
  • NEXTflex™ PCR II マスターミックス
  • 水（Nuclease-free）
  • 再懸濁バッファー
  • NEXTflex™ クリーンアップビーズ

仕様

標的
  • 36のMLH1/MSH2のコーディングエクソン領域、隣接するイントロン-エクソン境界の配列を決定（9.7 kb）
  • 疾患変異をカバー
    （present in NCBI Clin Var database based on dbSNP build 147）
アンプリコン長 192-282 bp（with primers）
プライマープール 56 プライマーペアー（in 2 primer pair pools）
必要DNA量 20 ng（新鮮／凍結サンプルから単離したDNA）
アンプリコンカバレッジ
  • 均一性
    - 平均カバレッジ 0.1×以上で 100%、平均カバレッジ 0.2×以上で 98% のアンプリコンを検出
  • 高いターゲット特異性
    - 99%以上のオンターゲットリード
  • プライマーの3’ 側半分に、MAF（major allelic frequency）が1%以上のSNPは出現しない
マルチプレックス化 最大384サンプル

プロトコール

NEXTflex(TM) Colon-1 Amplicon Panelのプロトコール

製品データ

製品データ1

図1. 高感度のDNA Chip産生量
A）NEXTflex™ Colon-1 Amplicon Panel Library-20 ng インプット（バイオアナライザ ゲル画像）
B）NEXTflex™ Colon-1 Amplicon Panel Library-20 ng インプット（エレクトロフェログラム、電気泳動図）

製品データ2

図2. NEXTflex™ Colon-1 Amplicon Panel（Illumina 社対応）から56アンプリコンを解析

NEXTflex™ Colon-1 Amplicon Panel（Illumina 社対応）

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
NEXTflex(R) Colorectal Cancer-1 Amplicon Panel for Illumina platforms (8 Barcodes) PEJ NOVA-4234-01 8 RXN
 ￥129,100
NEXTflex(R) Colorectal Cancer-1 Amplicon Panel for Illumina platforms (48 Barcodes) PEJ NOVA-4234-02 48 RXN
 販売終了
NEXTflex(R) Colorectal Cancer-1 Amplicon Panel for Illumina platforms (Barcodes 1- 96) PEJ NOVA-4234-03 96 RXN
 販売終了
NEXTflex(R) Colorectal Cancer-1 Amplicon Panel for Illumina platforms (Barcodes 97 - 192) PEJ NOVA-4234-04 96 RXN
 お問い合わせ
NEXTflex(R) Colorectal Cancer-1 Amplicon Panel for Illumina platforms (Barcodes 193 -288) PEJ NOVA-4234-05 96 RXN
 お問い合わせ
NEXTflex(R) Colorectal Cancer-1 Amplicon Panel for Illumina platforms (Barcodes 289 - 384) PEJ NOVA-4234-06 96 RXN
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商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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