記事ID ： 34581

スルホン化/非スルホン化 Cyanine の両方をご用意シアニン色素

メーカー名：AAT Bioquest, Inc. (Former ABD Bioquest, Inc.)

背景

　シアニン色素は、蛍光色素として特にバイオメディカルイメージングに多く利用されています。
構造によって、可視領域や近赤外領域のスペクトルをカバーします。Cy3®、Cy5®、Cy7®は、最も一般的なシアニン系色素です。Cy3®はオレンジ色の蛍光（～550/570 nm）を持ち、Cy5®は赤色領域（～650/670 nm）で蛍光を発します。Cy3®とCy5®は、通常 2色検出のために組み合わされ使用されています。
これらは通常、核酸またはタンパク質分子に化学的に結合できるように、窒素側鎖の一方または両方に反応基を持つように合成されます。
標識は可視化や定量目的で行われます。Cy3® や Cy5®は、ゲノムハイブリダイゼーションやトランスクリプトミクスに使用される遺伝子チップなど、幅広い用途で使用されています。また、プロテオミクスやRNA局在を含む様々な研究のためのタンパク質や核酸の標識にも使用されています。

スルホン化 vs 非スルホン化シアニン

スルホン化シアニン色素と非スルホン化シアニン色素は非常によく似た蛍光特性を示すので、多くの用途で互換性を持って使用することができます。
両者の違いは、主にその溶解性にあります。非スルホン化シアニン色素 (図2) は、生体分子を標識する前に、DMFやDMSOなどの有機共溶媒に溶解させる必要があります。一方、スルホン化シアニン (図1) は水系溶媒で使用できます（帯電したスルホン酸基が色素やコンジュゲートの凝集を抑制します）。
水または水系バッファーを用いた透析による精製では、未反応色素を効率的に除去するためにスルホン化シアニンを使用する必要がございます。ゲルろ過、クロマトグラフィー、電気泳動による精製は、スルホン化シアニン、非スルホン化シアニンのいずれでも可能です。

図1 オリゴヌクレオチドを標識するためのスルホン化シアニン色素の化学構造。
(左：Cy3®：n=1、Cy5®：n=2、Cy7®：n=3。右図 Cy3.5®: n=1; Cy5.5®: n=2; Cy7.5®: n=3)。

図2a. オリゴヌクレオチドを標識するための代表的な非スルホン化シアニン色素の化学構造
（Cy3NS：n=1; Cy5NS：n=2; Cy7NS：n=3）

図2.b. オリゴヌクレオチドを標識するための代表的な非スルホン化シアニン色素の化学構造
(Cy3.5NS: n=1; Cy5.5NS: n=2; Cy7.5NS: n=3)

Cy3®、Cy5®、Cy7® の特徴
	Cy3®		Cy5®		Cy7®
Form	Sulfo	Non-Sulfo	Sulfo	Non-Sulfo	Sulfo	Non-sulfo
Ex/Em (nm)	554/568		650/669		754/778
Filter Set	Cy/TRITC		Cy5		Cy7
ε	150,000	140,000	250,000	230,000	250,000	250,000
φ	0.1	0.07	0.27	0.16	0.12	0.2
品番	263	191	268	195	161	198

ε: is the extinction coefficient (cm^-1M^-1).
φ: is the fluorescence quantum yield.

図3.他社Cy®3標識との比較
HeLa細胞をTublin（+）またはTublin（-）マウス抗チューブリンIgG抗体でインキュベート後、AATバイオクエスト社及び他社のCy®3標識ヤギ抗マウスIgG抗体を用いて検出した。核はHoechest33342で染色した。

Succinimidyl Ester/NHS esters	抗体、タンパク質、ペプチド、アミン修飾オリゴヌクレオチドのアミン (-NH₂) への標識
maleimide	抗体、タンパク質、ペプチドのスルフヒドリル基 (-SH) への標識
Azides	クリックケミストリーを使ったエチレン基への標識
Alkynes	クリックケミストリーを使った azide への標識
Hydrazides	アルデヒド基やケトン基への標識
Carboxylic acids	カルボジイミドによる活性化後のアミンまたはアルコールのシュテークリヒエステル化への標識用に
Amines	活性エステルなどのさまざまな求電子性化合物への標識

非スルホン化シアニン

品番	品名	サイズ	Ex (nm)	Em (nm)	EC (cm^-1 M^-1)	CF @260 nm	CF @280 nm
190	Cy3NS Acid	100 mg	549	565	145,000	0.033	0.073
191	Cy3NS, Succinimidyl Ester	25 mg	549	565	145,000	0.033	0.073
194	Cy5NS Acid	100 mg	644	665	230,000	0.088	0.03
195	Cy5NS, Succinimidyl Ester	25 mg	644	665	230,000	0.088	0.03
197	Cy7NS Acid	100 mg	750	780	250,000	0.053	0.036
198	Cy7NS, Succinimidyl Ester	25 mg	750	780	250,000	0.053	0.036
181	ICG-ATT [3-ICG-acyl-1,3-thiazolidine-2-thione]	1 mg	780	800	240,000	0.114	0.076
182	ICG-OSu	1 mg	780	800	240,000	0.114	0.076
180	ICG-Sulfo-OSu	1 mg	780	800	240,000	0.114	0.076

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
Cy3NS acid	ABD	190	100 MG	￥96,000
Cy3NS succinimidyl ester	ABD	191	25 MG	￥72,000
Cy5NS acid	ABD	194	100 MG	￥96,000
Cy5NS succinimidyl ester	ABD	195	25 MG	￥72,000
Cy7NS acid	ABD	197	100 MG	￥96,000
Cy7NS succinimidyl ester	ABD	198	25 MG	販売終了
ICG-ATT [3-ICG-acyl-1,3-thiazolidine-2-thione]	ABD	181	1 MG	￥96,000
ICG-OSu	ABD	182	1 MG	￥36,000
ICG-Sulfo-OSu	ABD	180	1 MG	￥72,000

スルホン化シアニン

品番	品名	サイズ	Ex (nm)	Em (nm)	EC (cm^-1 M^-1)	CF @260 nm	CF @280 nm
144	Cyanine 3 Alkyne [equivalent to Cy3® Alkyne]	1 mg	555	565	150,000	0.042	0.073
145	Cyanine 3 Amine [equivalent to Cy3® Amine]	1 mg	555	565	150,000	0.042	0.073
143	Cyanine 3 Azide [equivalent to Cy3® Azide]	1 mg	555	565	150,000	0.042	0.073
146	Cyanine 3 Hydrazide [equivalent to Cy3® Hydrazide]	1 mg	555	565	150,000	0.042	0.073
142	Cyanine 3 Maleimide [equivalent to Cy3® Maleimide]	1 mg	555	565	150,000	0.042	0.073
140	Cyanine 3 Monoacid [equivalent to Cy3® Acid]	5 mg	555	565	150,000	-	0.073
141	Cyanine 3, Monosuccinimidyl Ester [equivalent to Cy3® NHS Ester]	1 mg	555	565	150,000	0.042	0.073
139	Cyanine 3.5 Amine [equivalent to Cy3.5® Amine]	1 mg	581	596	125,000	0.151	0.178
149	Cyanine 3.5 Maleimide [equivalent to Cy3.5® Maleimide]	1 mg	581	596	125,000	0.151	0.178
148	Cyanine 3.5, Monosuccinimidyl Ester [equivalent to Cy3.5® NHS Ester]	1 mg	581	596	125,000	0.151	0.178
154	Cyanine 5 Alkyne [equivalent to Cy5® Alkyne]	1 mg	649	665	250,000	0.026	0.03
155	Cyanine 5 Amine [equivalent to Cy5® Amine]	1 mg	649	665	250,000	0.026	0.03
153	Cyanine 5 Azide [equivalent to Cy5® Azide]	1 mg	649	665	250,000	0.026	0.03
156	Cyanine 5 Hydrazide [equivalent to Cy5® Hydrazide]	1 mg	649	665	250,000	0.026	0.03
152	Cyanine 5 Maleimide [equivalent to Cy5® Maleimide]	1 mg	649	665	250,000	0.026	0.03
151	Cyanine 5, Monosuccinimidyl Ester [equivalent to Cy5® NHS Ester]	1 mg	649	665	250,000	0.026	0.03
179	Cyanine 5.5 Alkyne [equivalent to Cy5.5® Alkyne]	1 mg	678	701	230,000	0.094	0.101
176	Cyanine 5.5 Amine [equivalent to Cy5.5® Amine]	1 mg	678	701	230,000	0.094	0.101
178	Cyanine 5.5 Azide [equivalent to Cy5.5® Azide]	1 mg	678	701	230,000	0.094	0.101
177	Cyanine 5.5 Hydrazide [equivalent to Cy5.5® Hydrazide]	1 mg	678	701	230,000	0.094	0.101
175	Cyanine 5.5 Maleimide [equivalent to Cy5.5® Maleimide]	1 mg	678	701	230,000	0.094	0.101
173	Cyanine 5.5 Monoacid [equivalent to Cy5.5® Acid]	5 mg	678	701	230,000	-	0.101
174	Cyanine 5.5 Monosuccinimidyl Ester [equivalent to Cy5.5® NHS Ester]	1 mg	678	701	230,000	0.094	0.101
164	Cyanine 7 Alkyne [equivalent to Cy7® Alkyne]	1 mg	749	776	275,000	0.025	0.036
165	Cyanine 7 Amine [equivalent to Cy7® Amine]	1 mg	749	776	275,000	0.025	0.036
163	Cyanine 7 Azide [equivalent to Cy7® Azide]	1 mg	749	776	275,000	0.025	0.036
166	Cyanine 7 Hydrazide [equivalent to Cy7® Hydrazide]	1 mg	749	776	275,000	0.025	0.036
162	Cyanine 7 Maleimide [equivalent to Cy7® Maleimide]	1 mg	749	776	275,000	0.025	0.036
160	Cyanine 7 Monoacid [equivalent to Cy7® Acid]	5 mg	749	776	275,000	-	0.036
161	Cyanine 7, Monosuccinimidyl Ester [equivalent to Cy7® NHS Ester]	1 mg	749	776	275,000	0.025	0.036

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
Cyanine 3 alkyne [equivalent to Cy3^(R) alkyne]	ABD	144	1 MG	￥24,000
Cyanine 3 amine [equivalent to Cy3^(R) amine]	ABD	145	1 MG	￥48,000
Cyanine 3 azide [equivalent to Cy3^(R) azide]	ABD	143	1 MG	￥24,000
Cyanine 3 hydrazide [equivalent to Cy3^(R) hydrazide]	ABD	146	1 MG	￥48,000
Cyanine 3 maleimide [equivalent to Cy3^(R) maleimide]	ABD	142	1 MG	￥48,000
Cyanine 3 monoacid [equivalent to Cy3^(R) acid]	ABD	140	5 MG	￥48,000
Cyanine 3 monosuccinimidyl ester [equivalent to Cy3^(R) NHS ester]	ABD	141	1 MG	￥24,000
Cyanine 3.5 amine [equivalent to Cy3.5^(R) amine]	ABD	139	1 MG	￥72,000
Cyanine 3.5 Maleimide [equivalent to Cy3.5^(R) Maleimide]	ABD	149	1 MG	￥72,000
Cyanine 3.5 monosuccinimidyl ester [equivalent to Cy3.5^(R) NHS ester]	ABD	148	1 MG	￥24,000
Cyanine 5 alkyne [equivalent to Cy5^(R) alkyne]	ABD	154	1 MG	￥24,000
Cyanine 5 amine [equivalent to Cy5^(R) amine]	ABD	155	1 MG	￥48,000
Cyanine 5 azide [equivalent to Cy5^(R) azide]	ABD	153	1 MG	￥24,000
Cyanine 5 hydrazide [equivalent to Cy5^(R) hydrazide]	ABD	156	1 MG	￥48,000
Cyanine 5 maleimide [equivalent to Cy5^(R) maleimide]	ABD	152	1 MG	￥48,000
Cyanine 5 monosuccinimidyl ester [equivalent to Cy5^(R) NHS ester]	ABD	151	1 MG	￥24,000
Cyanine 5.5 alkyne [equivalent to Cy5.5^(R) alkyne]	ABD	179	1 MG	￥60,000
Cyanine 5.5 amine [equivalent to Cy5.5^(R) amine]	ABD	176	1 MG	￥60,000
Cyanine 5.5 azide [equivalent to Cy5.5^(R) azide]	ABD	178	1 MG	￥60,000
Cyanine 5.5 hydrazide [equivalent to Cy5.5^(R) hydrazide]	ABD	177	1 MG	￥60,000
Cyanine 5.5 maleimide [equivalent to Cy5.5^(R) maleimide]	ABD	175	1 MG	￥60,000
Cyanine 5.5 monoacid [equivalent to Cy5.5^(R) acid]	ABD	173	5 MG	￥48,000
Cyanine 5.5 monosuccinimidyl ester [equivalent to Cy5.5^(R) NHS ester]	ABD	174	1 MG	￥24,000
Cyanine 7 alkyne [equivalent to Cy7^(R) alkyne]	ABD	164	1 MG	￥60,000
Cyanine 7 amine [equivalent to Cy7^(R) amine]	ABD	165	1 MG	￥60,000
Cyanine 7 azide [equivalent to Cy7^(R) azide]	ABD	163	1 MG	￥60,000
Cyanine 7 hydrazide [equivalent to Cy7^(R) hydrazide]	ABD	166	1 MG	￥60,000
Cyanine 7 maleimide [equivalent to Cy7^(R) maleimide]	ABD	162	1 MG	￥60,000
Cyanine 7 monoacid [equivalent to Cy7^(R) acid]	ABD	160	5 MG	￥60,000
Cyanine 7 monosuccinimidyl ester [equivalent to Cy7^(R) NHS ester]	ABD	161	1 MG	￥24,000