記事ID ： 17148

抽出したDNAはダウンストリームの各種アプリケーションに適用可能 FFPE組織DNA抽出キット

メーカー名：BIOCHAIN INSTITUTE INC.

本商品は、ホルマリン固定パラフィン包埋組織サンプルからDNA抽出を行うキットです。
オプションとして、DNA濃縮用のカラムや磁性ビーズを含むキットもご用意しております。

【関連商品】バイオチェーン社　組織いろいろ（凍結切片・パラフィン切片・組織アレイ）

背景

ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織サンプルは、病理学の遡及的研究において非常に有用な情報源ですが、FFPE組織からの核酸（DNA）抽出は、困難である場合が多々あります。これは、保存工程でDNAとタンパク質が架橋形成（クロスリンク）し、分解されてしまうことが原因です。また保存工程を経て得られるDNAは、断片化しているか化学的修飾を受けている場合がほとんどです。

使用目的

FFPE組織DNA抽出キットは簡便かつ効果的にFFPE組織からDNA抽出を行うことができ、またハイスループットでの使用やqPCRなどダウンストリームのアプリケーションにも適用可能です。
熱とProteinase Kで処理し、パラフィン除去やDNAとタンパク質の脱架橋、固定化組織からのDNA遊離を行うのに最適なキットです。

特長

FFPEサンプルからDNAを抽出
高収量・高品質
キシレン等の有毒な溶媒は不使用
DNA抽出に必要な試薬（約100サンプル分）をすべて含む
キット構成品はすべてDNase、RNase、プロテアーゼフリー
抽出したDNAはダウンストリームのアプリケーションに適用可能

適用可能なアプリケーション例

PCRによるDNA増幅
アレイCGH解析
コピー数多型解析
DNA次世代シーケンシング

構成内容

品番	K5019100	K5011350	K5011450
構成内容	Proteinase K FFPET Lysis Buffer Control Actin Primer	Dewaxil Proteinase K FFPE Lysis Buffer Binding Buffer Wash Buffer 1 Wash Buffer 2 Elution Buffer Column Actin control primer	Dewaxil Proteinase K FFPE Lysis Buffer Binding Buffer Wash Buffer 1 Wash Buffer 2 Elution Buffer Beads Particles Actin control primer
構成内容

製品データ

品番：K5019100

図1. FFPE組織からDNA抽出
(A)4種類のヒト細胞株のFFPEサンプルからゲノムDNAを抽出した。
(B)A549細胞から分離したFFPE由来のゲノムDNAでテロメアの増幅を行った。
(Courtesy from Hui Wang et al. 2012)

品番：K5011350／品番：K5011450

図2. 他社品との比較
ヒト膵臓組織から抽出したDNAで、β-actinをターゲットとしてqPCRを行った。
(左）品番：K5011350　（右）品番：K5011450

参考文献

Doleshal M, Magotra AA, Choudhury B Cannon BD, Labourier E, Szafranska AE. “Evaluation and validation of total DNA extraction methods for microRNA expression analyses in formalin-fixed, paraffin-embedded tissues” J Mol Diagn 2008 May; 10(3) : 203-11.
Haller AC, Kanakapalli D, Walter R, Alhasan S, Eliason JF, Everson RB. “Transcriptional profiling of degraded RNA in cryopreserved and fixed tissue samples obtained at autopsy” BMC Clin Path 2006 Dec; 6(9).