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記事ID : 35712
研究用

プロテインプロファイリングとRNAプロファイリングを同一検体から実現マルチオミックス解析受託サービス
プロテインプロファイリングとRNAプロファイリングを同一検体から実現

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サンプルを送るだけ! サンプルの前処理から解析までのワンストップサービス

一つの検体からタンパク質画分と RNA 画分の分離・精製をおこない、プロテオーム解析とRNA シーケンスを同時に実施する統合的な解析サービスです。

解析装置
● RNA-Seq:HiSeq、NextSeq(Illumina)
● 質量分析:Q-Exactive HF-X(Thermo Fisher Scientific

ご送付いただくもの(1 サンプルから承ります)
● フェノールグアニジン系の試薬*、もしくは RNA 保護試薬**で作製したサンプル
*ISOGEN(ニッポンジーン社)、TRIzol(ThermoFisher 社)、QIAzol(QIAGEN 社)など
**RNAlater(ThermoFisher 社)など
● サンプル種:組織、細胞、その他(ご相談ください)
● 生物種:ゲノムが解析されている生物

マルチオミックス解析受託サービス

RNA-Seqとプロテオーム解析で観測されたmRNAとタンパク質をコードする 遺伝子の重複

RNA-Seqとプロテオーム解析で観測されたmRNAとタンパク質をコードする 遺伝子の重複
RNA-SeqとQ-Eactive HF-X導入以前のデータ依存型分析法(DDA)によるプロテオーム解析(左図)とRNA-Seqと本受託サービスのQ-Eactive HF-Xを用いた高深度DIAプロテオーム解析(右図)との比較を示す。分析したサンプルはHEK293F 細胞を用い、RNA-Seqとプロテオーム解析のそれぞれの解析で用いたデータベースに共通して存在した遺伝子のみを対象とした。以前のプロテオーム解析ではRNA-Seqで観測できる遺伝子数との差が大きかったが、本受託サービスの高深度DIAプロテオーム解析ではその点が大きく改善され、マルチオミクス解析を行う上で対象となる分子が大幅に増加した。

解析メニュー

■マルチオミックス
解析メニュー
(納期)
分析方法と取得データ目安 必要サンプル量
下段:目安(表示量以上必要です)
サンプル数
RNA
プロファイリング
(納期:8週間)
mRNAの3'末端配列決定 ● HiSeq (50 bp Single-Read)
…1.86億リード
または
● NextSeq (75 bp Single-Read)…4億リード
total RNA:2 μg程度
細胞:2x105 個程度
組織(マウス肝臓):1 mg程度
1
2〜5
6以上
プロテイン
プロファイリング
(納期:4週間)
DIAプロテオーム解析 ● LC-MS/MS (DIA)
● 4,000〜6,000タンパク質
タンパク質:40 μg以上
細胞 5x105 個 組織 10mg
血清/血漿 1μL 尿 200μL
1〜5
6以上
高深度DIAプロテオーム解析 ● GPF+LC-MS/MS (ライブラリ作製用)、LC-MS/MS (DIA)
● 5,000〜8,000タンパク質
1〜2
3〜5
6以上
DIAリン酸化プロテオーム解析 ● LC-MS/MS (DIA)
● 4,000〜8,000リン酸化ペプチド
タンパク質:40 μg以上
細胞:5×106 個 組織:10 mg
1〜5
6以上
高深度DIAリン酸化プロテオーム解析 ● GPF+LC-MS/MS (ライブラリ作製用)LC-MS/MS (DIA)
● 8,000〜15,000リン酸化ペプチド
1〜2
3〜5
6以上
サンプル前処理
(納期:約1週間)
● タンパク質画分とRNA画分の分離、精製、QC (KGT社で実施) 1

お見積もり依頼

下記の解析依頼書に必要事項をご入力いただき、jutaku_gr@cosmobio.co.jp宛にご送付をお願いいたします。またサンプルをご送付いただく際は本依頼書をサンプルに同封して下さい。

ご注意事項

  • 依頼書記載のサンプル名称と、送付検体に記載されている名称は統一してください。
  • ヒト由来サンプルは提供者のインフォームド・コンセントが得られていることが前提となります。
  • 提供者の個人情報が特定できないようにサンプル名を匿名化して下さい。

サンプルのご送付方法

  • 記入済み弊社依頼書をプリントアウトしてお荷物(サンプル)に同梱して下さい。(1番目のシート)
  • 紛失等の事故防止のため、サンプル発送の際は『jutaku_gr@cosmobio.co.jp』までメールでご連絡いただき、サンプルの到着日、配送業者名、送り状番号をお知らせ下さい。
  • 金・土曜日のご送付はご遠慮下さい。平日着の便でご送付をお願い致します。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
  • サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、凍結状態を維持するために、十分量のドライアイスを同梱し、冷凍便、平日午前着指定でご送付ください。

ご送付先:

〒292-0818
千葉県木更津市かずさ鎌足2-6-7
株式会社かずさゲノムテクノロジーズ
Tel: 0438-52-2001

お問い合わせ先 : 創薬・受託サービス部

ご質問・ご不明の点は創薬・受託サービス部までお問い合せください。また、秘密保持契約のご希望につきましても、下記までご連絡をお願いいたします。

TEL
03-5632-9615
FAX
03-5632-9614
E-mail
jutaku_gr@cosmobio.co.jp

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

お問い合わせ

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