商品情報

記事ID : 34685
研究用

SPLIT RNA Extraction Kit

このエントリーをはてなブックマークに追加

LEX_00848_1.jpg

SPLIT RNA Extraction Kit は、RNA-Seq に使用するRNA を精製するためにデザインされたキットです。本キットでは、ゲノムDNA のコンタミネーション無く、迅速に高収量でRNA を精製可能です。加えて、本キットでは、RNA にダメージを与える可能性のあるDNase 処理が不要です。結果として、total RNA の回収や、small RNA とlarge RNA の分離が可能となっています。

 

特長

  • 17 〜 10,000 nt のtotal RNA を精製
  • オプション:large RNA とsmall RNA の分離が可能(150 nt 以下Cutoff)
  • 30 分の簡単なプロトコル(組織:最大RIN 8、培養細胞:最大RIN 10)
    ※ RIN:RNA integrity number
  • ゲノムDNA のコンタミネーション無し(DNase を使用せず、またDNase 処理不要)
  • 高収量(> 100 µg)
  • 少量の検体から抽出可能(細胞1 × 102 cells 以上、組織0.5 mg 以上)

ワークフロー

SPLIT RNA extraction Kit は、ほ乳類や植物、昆虫、菌類、細菌など、各種生物からRNA を迅速、容易に抽出可能です。用いる検体を、RNase の不活性化や可溶性を高めるためのChaotropic Isolation Buffer でホモジナイズします。ホモジナイズ後、Phase Lock gel チューブを用いた酸性フェノールクロロホルム抽出を行い、水相(RNA を含む)を有機相・中間相(DNA やタンパク質を含む)から分離します。RNA画分はtotal RNA またはlarge RNA、small RNA を回収するためのシリカカラムを通して精製されます。

LEX_00848_2.jpg

図.1 SPLIT RNA extraction Kit のワークフロー

 

パフォーマンス

SPLIT RNA extraction Kit により抽出された試料RNA は、microRNA から1 万塩基以上と、RNA-Seq に適したサイズになります。抽出したRNA はゲノムDNA のコンタミネーションは無く、また、DNase 処理、不活性化のため熱処理、ゲノムDNA 除去カラムなどによるRNA の分解やRNA サイズのバイアスがありません。total RNA やsmall RNA 画分内の17 塩基までのsiRNA やmicroRNA の回収効率は、small RNA マーカーを用いたスパイクイン実験で確認されました(図3)。

LEX_00848_3.jpg

図.2 SPLIT RNA extraction Kit によるゲノムDNA コンタミネーション無しのRNA 抽出法
A)マウス肝臓から抽出したRNA を変性ホルムアルデヒドアガロースゲルで電気泳動した。TRIzol で抽出したRNA はゲノムDNA のコンタミネーションが見られたが、SPLIT RNA extraction Kit で抽出したRNA にはゲノムDNA はコンタミネーションが無かった。
B)各ゲノムDNA 除去方法でゲノムDNA 除去後、RNA のクオリティ(RIN)評価をAgilent 社TapeStation で行った。SPLIT RNA extraction Kit で精製したRNA(DNase処理無し)は、他のゲノムDNA 除去手法に比べてRNA のクオリティ(完全性)、サイズ分布のバイアスの面で優れていた。

LEX_00848_4.jpg

図.3 microRNA、siRNA サイズのRNA はtotal RNA 溶出画分やsmall RNA 画分に効率よく回収される。
マウスの肝臓からSPLIT RNA extraction Kit でRNA 精製し、一本鎖microRNA マーカーと二本鎖siRNAマーカーをスパイクインして、変性ポリアクリルアミドゲルで電気泳動した。比較のため、理論上の最大回収量(スパイクインRNA)をレーン1 とレーン5 にロードした。

 

構成内容

  • Buffers and Purification Columns
  • Phase-Lock Gel Columns

※詳細はUser Guideをご確認ください。(User Guide PDF

SPLIT RNA Extraction Kit

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
SPLIT RNA Extraction Kit詳細データ LEX 008.48 48 RXN
¥68,000
pagetop

【関連情報】

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

お問い合わせ

「SPLIT RNA Extraction Kit」は、下記のカテゴリーに属しています。

商品検索

商品情報

サポート情報

メーカー・代理店一覧

企業情報

関連サイト


© COSMO BIO