記事ID ： 33291

唾液などのDNAサンプルを簡単に採取・保存できます！ Swab Collection and DNA Preservation Kit

メーカー名：Norgen Biotek Corp.

綿棒を用いてサンプルを容易に採取し、常温でのDNA長期保存が行えるキットです。

使用目的

Swab Collection and DNA Preservation Kit

鼻腔や口腔、唾液、糞便、皮膚や表層などから採取する際に利用できます。本キットには、保存液が含まれています。綿棒を用いてサンプルを採取した後、綿棒を保存液に入れるだけです。綿棒の保存液は、グラム陰性菌およびグラム陽性菌や真菌類の増殖を防ぎ、ウイルスを不活性化するため、非感染の状態でサンプルを安全に持ち運ぶことが可能です。加えて、綿棒保存液を使用することで、サンプルの迅速な処理や凍結の必要がなくなるため、常温で一つの試験施設へと送ることが可能です。常温でDNAサンプルを綿棒保存液中で保存した場合、2年以上保存可能です。

サンプル採取および保存方法

保存後の DNA 抽出について

本キットを用いて採取・保存されたサンプルは、多くのDNA抽出方法に適しています。チューブに保存されたサンプルは Norgen Biotek (NOG)社のDNA 抽出キットや試薬の使用にも適しており、Microbiome DNA Isolation Kit（品番：64100）用の抽出プロトコル情報も提供しております。

特長

鼻腔や口腔、唾液、糞便、皮膚や表層などから採取に利用可能
採取当初の微生物特性を保持しての保存できます
NGS（メタゲノム/バイオーム）や PCR、マイクロアレイでの解析データの偏りが最小限
非感染の状態でサンプルを安全に持ち運ぶことが可能
多くのDNA抽出キットやプロトコルとの互換性あり

製品データ

図1. 保存したDNAの安全性
本製品の保存液中で DNA サンプルを室温で最長75ヵ月で保存した。複数ドナーから採取した唾液を混合し、そこへ等量の本製品の DNA 保存液を添加後、室温で保存した。サンプルは最長で75ヵ月間保存し、1週間、3週間、1ヵ月、2ヵ月、4ヵ月、6ヵ月、8ヵ月、12ヵ月、20ヵ月、32ヵ月、40ヵ月、52ヵ月、75ヵ月のタイミングで 0.5 mL 唾液/保存液のサンプルを用いて NOG 社唾液中DNA抽出キット（品番：RU45400）により DNA 抽出した。抽出した各 DNA サンプルは 100 µL/well にてアガロース TAE ゲルで電気泳動した。その結果、75ヵ月常温保存した唾液サンプルでも DNA 分解は検出されず、24 kb 以上のDNAサイズを維持していた。
使用マーカー：NOG社 UltraRanger 1kb DNA Ladder（品番：12100）

図2. 保存したDNAの品質
1週間～75ヵ月間室温で保存した唾液サンプル中の GAPDH の Taqman? Real-time PCR により検出した。各唾液DNAサンプルのCt値が一定であったことから、いずれの期間保存したサンプルの場合でも DNA の品質に変化がなかったことが示唆された。図2の赤色で示す Ct 値では、唾液 DNA 抽出キット（品番：RU45400）を用いた抽出方法の改善による影響も示唆された。

図3.保存した DNAのPCR 増幅
1週間～75ヵ月間室温で保存した唾液 DNA サンプル（計13点）を Real-time PCR により増幅した。すべてのサンプルにおいて PCR 阻害の影響を受けることなく、良好に DNA 増幅された。
青：NOG 社唾液 DNA抽出キット（品番：RU45400）を使用
黒：コントロール（鋳型DNAなし）

唾液でのMiSeq 16s rRNAメタゲノム解析データ
本製品を用いて回収し、6年以上室温保存した唾液サンプルを NOG社唾液DNA抽出キット（品番：RU45400）を使用してDNA抽出した。Illumina MiSeq により抽出DNA の16s rRNAメタゲノム解析を行った。
A) 12種類の唾液マイクロバイオームの主座標分析データ。サンプル間の”界”レベルの分類分布を示す。
B) 12種類の唾液マイクロバイオームの階層的クラスタリングデータ。樹状図では、各サンプルの相対的存在量の棒グラフを含む属レベルの分布を示す。