Eurofins 社；複雑ながんの微小環境下での薬効評価が可能な Phenotypic Profiling サービス" data-hatena-bookmark-layout="standard-balloon" data-hatena-bookmark-lang="ja" title="このエントリーをはてなブックマークに追加"> |
BioMAP サービスは、ヒト由来の初代培養細胞（正常細胞）をベースにした様々な疾患モデル (BioMAP Systems)、独自のリファレンス化合物データベースによる臨床治療相関性の分析 (BioMAP Database)、さらにコンピューター処理によるデータ解析システムによって構成されています。
BioMAP Systems は、各種ヒト由来初代培養細胞に様々な刺激を加え疾患特異的シグナル経路を活性化させた細胞レベルの疾患モデルを樹立し、これらのモデルに対する薬物の反応性を測定できます。更に各細胞疾患モデルにおいて臨床的相関性が証明されたタンパク質や低分子物質等のバイオマーカーを測定することにより、ヒトに対する作用機序 (MOA)、薬効または薬理安全性の予測を可能にします。BioMAP Database では、試験化合物と独自のリファレンス化合物データベースを自動的に照合し相関分析を行うため、既知阻害剤や現段階の臨床治療法と比較することができ、臨床試験の効率化が大いに期待できます。
Pembrolizumab および Nivolumab のプロファイルデータ例
BioMAP Colorectal Cancer Oncology Panel における Pembrolizumab (赤) と Nivolumab (青)のプロファイルデータ。x軸がバイオマーカーのリードアウトを示しており、y軸が各マーカーのタンパク発現の log比率（薬剤/コントロール）を示す。グラフ上でバイオマーカーの注釈がついたマーカーではコントロールと比較して、有意にタンパク量が変化しており、Pembrolizumab と Nivolumab でともにタンパクの増減が確認された。なお、灰色のエリアは、過去のコントロールデータの変動範囲を示している。
| Symbol | Primary Human Cell Types |
Disease / Tissue Relevance | Readout Parameters | # of Readouts | Readouts# that are Soluble |
|---|---|---|---|---|---|
| PanelSystem | |||||
| Colorectal Cancer(CRC) Panel | |||||
 StroHT29 |
HT-29 colon adenocarcinoma cell line / Primary human fibroblasts / PBMC | 大腸がん/免疫腫瘍学： 間質性腫瘍微小環境生物学・組織再構築 創傷治癒・炎症 |
VCAM-1, uPAR, Collagen I, Collagen III, IP-10, MMP-9, PAI-1, PBMC Cytotoxicity, sGranzyme B, sIFNγ, sIL-10, sIL-17A, sIL-2,sIL-6, SRB, sTNFα, sVEGF, TIMP2, tPA,uPA, CEACAM5, Keratin 20 | 22 | 8 |
 VascHT29 |
HT-29 colon adenocarcinoma cell line / Primary human endothelial cells / PBMC | 大腸がん/免疫腫瘍学：血管腫瘍微小環境生物学・炎症 | MCP-1, VCAM-1, CD40, CD69, uPAR, Collagen IV, IP-10, MIG, PBMC Cytotoxicity, sGranzyme B, sIFNγ, sIL-10, sIL-17A, sIL-2, sIL-6, SRB, sTNFα, CEACAM5, Keratin 20 | 19 | 7 |
| Non-Small Cell Lung Cancer(NSCLC) Panel | |||||
 StroNSCLC |
NCI-H1299 NSCLC cell line / Primary human fibroblasts / PBMC | 非小細胞肺がん / 免疫腫瘍学：間質性腫瘍微小環境生物学・ 組織再構築 創傷治癒・炎症 |
VCAM-1, uPAR, Col-III, IP-10, EGFR, HGF,
PAI-1, PBMC Cytotoxicity, SRB, tPA, uPA, sGranzymeB, sPGE2, sVEGF, sIFNγ, sIL-10,
sIL-13, sIL-17A, sIL-2, sIL-4, sIL-6, sMDC, sTNFα |
23 | 12 |
 VascNSCLC |
NCI-H1299 NSCLC cell line / Primary human endothelial cells / PBMC | 非小細胞肺がん/ 免疫腫瘍学： 血管腫瘍微小環境生物学・炎症 |
MCP-1, VCAM-1, CD40, CD69, uPAR, IP-10, PAI-1, PBMC Cytotoxicity, SRB, sGranzymeB, sIFNγ, sIL-10, sIL-13, sIL-17A, sIL-2, sIL-4, sIL-6, sMDC, sTNFα | 19 | 10 |
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