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コスモバイオのエピトープデザイン

抗体を作製する際、抗原ペプチドのデザインは成功のカギを握る最も重要な要素です。作製した抗体が抗原ペプチドには反応するけれど、目的のタンパク質には反応しないといったことは、ペプチドを抗原とする場合は残念ながら珍しい話ではありません。タンパク質は立体構造を取っているため、抗原とした部位がタンパク質の内側に位置し抗体がアクセスできない、またタンパク質では翻訳後修飾を受けていて、それが邪魔で抗体が反応できない、など様々な理由が考えられます。
そのようなリスクを極力少なくするように、当社ではオリジナルのエピトープ予測ツールなど複数の情報を用い、専門のスタッフが最善の抗原ペプチドをご提案します。

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レポート例

エピトープデザインの結果は分かり易く詳細を記載した報告書に、デザインを担当したスタッフのコメントを付けてお渡しいたします。

１つのタンパク質につき5 配列程度をご提案しますので、内容をご確認のうえ、実際に使用する配列をお選びください。
　※タンパク質によっては1 配列しかご提案できない場合もございます。

サービス内容

■ コンサルティングデザイン　（モデラゴン使用）

AI 搭載全自動ペプチド抗原デザインシステム「MODELAGON™/ モデラゴン」を使用したデザインです。マルチプルアライメントの結果を考慮した予測や、対象タンパク質が膜タンパク質である場合、細胞内、あるいは細胞外領域を指定して解析することが可能です。

また Linear で表面上に露出している部位を選定するため、合成ペプチドとネイティブ構造の差が極力生じない抗原ペプチド配列をご提案します。モデラゴンはモバイル端末でも使用できますので、当社スタッフがお客様にご希望の条件等をヒアリングし、抗原配列のご提案からご注文までをスピーディに行えるのも特長です。

【モデラゴンの特長】

ネイティブ構造と極力差が生じない
AIを搭載したエピトープ解析
お客様のもとでコンサルティング　～抗原配列の提示までが可能
わずか数秒でのスピーディーな解析

選択した部位を化学合成してもネイティブ構造と極力差が生じない抗原ペプチド配列をデザインする
対象配列
予測結果

デザインサービスの無償対応可能な受託サービス：
コスモ・バイオ（メーカー略号：CPA）のポリクローナル／モノクローナル抗体作製
※ ペプチド合成受託のみの場合には、1解析あたり10,000円でご注文いただけます。また、AQUAグレードペプチド合成は対象外です。

■ コスモ・バイオにお任せデザイン

お客様からの抗原情報を元に、経験豊富な専門スタッフが当社オリジナルソフトにてデザインを行います。さまざまな条件（交差反応を避けたい、特定のドメインを避けたいなど）にも対応いたします。UniProtやNCBIなどのタンパク質情報を元に、抗体を作製する上でリスクのある部位はすべて除外いたしますので、抗体価が得られないというリスクは低くなります。また、ご希望の方には各種パラメーターの解説やblastサーチの手順書も準備しております。

【コスモ・バイオにお任せデザインは、このような方におすすめ！】

抗体作製をお願いしたいけど初めてなので良く分からない・・・
抗原配列に対する条件が多い・・・
デザイン結果の詳細が見たい
報告書を見てじっくりと検討したい

エピトープデザインで使用する主なパラメーター

Antigenicity	抗原性
Hydrophobicity	疎水性度
Chou-fasman secondary structure	二次構造予測
Garnier-Osguthorpe-Robson secondary structure	二次構造予測
Disordered region	Disorder領域（構造を取らない領域）
Solvent accessibility	溶媒露出度（各アミノ酸側鎖の表面露出）