DIAプロテオーム解析では、最新鋭の質量分析計であるtimsTOF-HT(Burker社)を用いて分析深度と定量性に定評のあるData-independent acquisition (DIA)分析法でプロテオーム解析を実施いたします。エクソソーム蛋白について、発現量の多いものから最大8,000種類のタンパク質を網羅解析し、サンプル間で個々のタンパク質の量的比較を行うことが可能です。また、本サービスはエクソソーム調製からDIAプロテオーム解析までを一貫して行うワンストップサービスとなっておりますので、お客様はサンプルを送付するだけで高深度なプロテオーム解析データを手に入れることができます。
図1. timsTOF-HT(Burker社)
高深度プロテオーム解析を行う利点
1種類の哺乳類細胞の中には10,000〜12,000種類のmRNAが発現し、タンパク質の種類も同等数存在するだろうと想像されています。その中でも生体システムの様々なパスウェイを構成するキナーゼや転写因子などのタンパク質は微量ながら、生命維持に極めて重要な働きをすることが知られています。これらのタンパク質の変動は疾患に直結し様々な疾患の創薬ターゲットやバイオマーカーとなるため、それらの蓄積量の定量解析への期待は非常に大きいものです。しかしながら、これまでの一般的なプロテオーム解析では分析深度が足らず(およそ3,000タンパク質程度前後)、細胞内の微量タンパク質を観測するには不十分な感度でした。そのため、
サービスメニュー
品番 | メニュー | 試験内容 | 最良結果を得るための サンプル必要量 |
1サンプルあたりの解析費用 ![]() |
納期 |
---|---|---|---|---|---|
EP-1 | サンプルからの エクソソーム調製 |
超遠心法による エクソソーム調製 |
細胞培養上清: 無血清培地で100mL 血清・血漿:0.5mL |
細胞培養上清(EP1-A):14万円 血清・血漿(EP1-B):50,000円 (エクソソームが十分取れなかった場合も同じ金額) |
都度相談 |
MS-2 | エクソソームの 次世代プロテオミクス解析 |
〜8,000種類の蛋白質の 同定と相対定量解析 |
蛋白量として 5µg以上 |
1〜5検体:98,000円(MS2-A) 6〜15検体:92,000円(MS2-B) 16検体以上:90,000円(MS2-C) |
4週間 |
MS-4 | オプション: サンプルクリーンアップ処理(純水あるいはPBS以外の溶媒に懸濁されている場合) |
- | - | 25,000 円 | オプションを加えても納期に影響なし |
MS-5 | オプション: 繰り返し測定(通常は1サンプルに対して1測定) |
- | - | 1測定追加ごとに40,000円(MS5-A) | オプションを加えても納期に影響なし |
注意:
*サンプルのタンパク量が十分量に達してない場合はこちらからお客様に連絡し、解析中止もしくは解析続行かを選ぶことができます。
*タンパク量が少なくても解析を続行される場合は同定・定量できるタンパク質が減少することをご了承ください。
*解析中止の場合はその時点までの作業料を請求させていただきます。
サンプルの必要最低量
エクソソーム抽出を行う場合:
・細胞培養上清:無血清培地で100mL
・血清・血漿:0.5mL
エクソソームペレットをご送付頂く場合:
ペレットをPBSあるいは純水で懸濁し、BCAアッセイ等でタンパク定量を行ってください。
その結果、タンパク総量として5µg以上に相当するエクソソーム懸濁液をご送付ください。
(純水あるいはPBS以外の溶媒に懸濁されている場合、サンプルクリーンアップ処理の要否についてご相談ください。)
アプリケーションノート
国立がん研究センター研究所 分子細胞治療研究分野 東京医科大学産学連携講座細胞外小胞創薬研究講座 小坂 展慶 先生にDIAプロテオーム解析法をご利用いただきました。詳細は下記のリンクをご参照下さい。
DIAプロテオーム解析法によるがん転移特異的エクソソーム表面タンパク質の同定
お見積もり依頼
下記の解析申込書に必要事項をご入力いただき、jutaku_gr@cosmobio.co.jp宛にご送付をお願いいたします。またサンプルをご送付いただく際は本申込書をサンプルに同封して下さい。
ご注意事項
- ヒト臨床検体由来の場合、HIV, HBV, HCV 陰性であることを確認している検体のみ受け入れ可能です。未確認、あるいは陽性の検体由来のサンプルはお受けできませんのでご注意ください。
- 申込書記載のサンプル名称と、送付検体に記載されている名称は統一してください。
- ヒト由来サンプルは提供者のインフォームド・コンセントが得られていることが前提となります。
- 提供者の個人情報が特定できないようにサンプル名を匿名化して下さい。
サンプルのご送付方法
- 記入済み申込書をプリントアウトしてお荷物(サンプル)に同梱して下さい。(1番目のシート)
- 紛失等の事故防止のため、サンプル発送の際は『jutaku_gr@cosmobio.co.jp』までメールでご連絡いただき、サンプルの到着日、配送業者名、送り状番号をお知らせ下さい。
- 金・土曜日のご送付はご遠慮下さい。平日着の便でご送付をお願い致します。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
- サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、凍結状態を維持するために、十分量のドライアイスを同梱し、冷凍便、平日午前着指定でご送付ください。
ご送付先:
〒567-0085
茨木市彩都あさぎ7-7-18
彩都バイオヒルズセンター306号室
株式会社ハカレル 宛
電話:072-657-9980