記事ID ： 7845

フミン酸を多量に含む肥料やコンポストにも利用可能土壌試料からのDNA／RNA抽出キット

メーカー名：Norgen Biotek Corp.

Norgen社の土壌DNA抽出キットは使い勝手がよく、迅速なDNA抽出を可能とします。フミン酸を含めPCR阻害物質を除く工程を経てDNA抽出が進められるため、一般的な土壌サンプル以外にフミン酸を有する堆肥・肥料を含んだ土壌サンプルも使用可能です。

ハイスループットの精製が可能な96ウェルタイプもご用意しています。

特長

スピンカラムフォーマットで扱いやすく、迅速にDNAまたはRNAを抽出
多くの土壌サンプルが使用可能
構成品OSR Solutionによってフミン酸等PCRを阻害する物質の除去が可能
細菌、菌類、藻類といった土壌中の様々な微生物のtotalDNAまたはRNAを高品質で抽出
高速で簡単なハイスループット処理 (→Soil DNA Isolation 96 Well Kit)
RNA精製は、Norgen社独自の樹脂を分離マトリックスとして使用(→Soil RNA Isolation Kit)

キットの仕様

	Soil DNA Isolation 96 Well Kit	Soil DNA Isolation Plus Kit	Soil RNA Isolation Kit
品番	26560	64000、64060	27750
最大サンプル投入量	250 mg	250 mg	500 mg
カラム結合容量	50 μg	50 μg	50 μg
最大充填容量	500 μl	650 μl	650 μl
精製までの所要時間	50分	30分	30分

使用方法

操作方法概要

土壌試料からのDNA／RNA抽出キットの使用方法
図1　プロトコール

実際の操作動画

＊旧バージョンの操作動画ですので、添加量等が異なります。操作概要の参考にご利用ください。

製品データ

図2 土壌サンプルから抽出したDNAサンプルを用いた電気泳動結果の比較
250 mgの土壌サンプル（Clay・Top Soil）からDNAを抽出。溶出液100 µL中の10 µLを1%TAEアガロースゲルに充填、電気泳動を実施。M ： 1 kb DNA ladder

図3 土壌サンプルから抽出したDNA濃度の比較
250 mgの土壌サンプル（Top Soil・Clay）から抽出したDNAの濃度を比較、どちらのサンプルにおいてもより高い濃度のDNAを得ることができた。

図4 抽出したDNAを用いたqPCR結果［16s rRNA Detection（TaqMan）］
Norgen社、競合品のキットを用いて、250 mg のclay（フミン酸含有量：少）・top soil（フミン酸含有量：多）サンプルからDNAを抽出、16S rRNA領域を対象にqPCRを実施。他社品で抽出したDNAサンプルを用いた際よりCt値が低く、高クオリティのDNAを抽出できたことが示された。

図5　細菌叢の分布
Norgen社のキットと競合品で抽出したサンプルを用い、16SrRNA遺伝子を対象とした配列解析を実施。門レベルの分類が豊富であることから、DNA抽出の効率の良さ・DNAの品質が優れていることが示されている。

図6 門レベルに基づく細菌属の存在量に関するヒートマップ
競合品で抽出したDNAサンプルとの間で含まれる細菌数の比較を実施。

DNA抽出キット

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
Soil DNA Isolation Kit	NOG	26560	2*96 WELL	￥236,000
Soil DNA Isolation Plus Kit	NOG	64000	50 PREP.	￥72,000
Soil DNA Isolation Plus Kit	NOG	64060	100 PREP.	お問い合わせ