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記事ID : 46292
研究用

青枯病菌を qPCR法で時短測定 青枯病菌種複合体 (RSSC) 検出用 qPCRセット

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本キットは、青枯病菌種複合体 (RSSC) の 3つの種と亜種すべて、および多様な宿主植物におけるそれぞれの系統型を検出するために開発され、検証されています。

背景

Ralstonia solanacearum(青枯病菌) (1,2)は土壌に生息する病原性細菌で、世界中の多くの植物種に対する農業上の脅威としてよく知られています。この細菌は宿主範囲が広く、タバコ、トマト、ジャガイモなどのナス科の野菜作物をはじめ、バナナ、ショウガ、クワ、およびゼラニウム種やバラなどの観賞植物を含む50科以上、250種を超える植物に感染します (3)。
R. solanacearumは傷、根の先端、または側根の亀裂を通して植物に感染し、茎の傷や灌漑用水からも侵入することができます (3)。細菌は根の導管部分にコロニーを形成し、維管束系と水供給を遮断します。その結果、葉が萎凋して黄色くなり、収量が減少し、最終的には植物が枯死してしまいます(2,4)。

BRA_qPCR_Rs_kit_background_01.jpg

近年、Ralstonia solanacearum種の複合体(RSSC)は、3つの異なる種 R. solanacearum(系統II)、R. pseudosolanacearum(系統IおよびII)、およびR. syzygiiの3つの亜種(系統IV)に分類されました(6)。後者は、以下の3つの亜種:subsp. syzygii, subsp. celebesensis, subsp. indonesiensisに分類されます。種によって、宿主範囲、代謝要件、発生源、感染に最適な環境条件が異なります。

特長

  • Duplex リアルタイムPCR
  • RSSCの全ての種を検出
  • 18s rRNAゲノム配列が内部ポジティブコントロール(IPC)として含まれます。
  • BIOREBA社により開発・検証されています。
  • 迅速かつ信頼性の高いプロトコール
  • ロット間差がなく、試験の安定性が向上

構成内容

  • Taq Master Mix(2x)
  • Primer/probe Mix Rs/18S(10x)
  • Nuclease Free water
  • Rs DNA positive control
  • Plant DNA negative control

測定波長

品名 品番 色素 ウイルス/コントロ−ル 最大Ex (nm) 最大Em (nm)
qPCR Rs set 869600、869600 HEX Rs 535 556
ROX 18S宿主遺伝子 (IC) 576 601

データ

BRA_qPCR_Rs_kit_fig01.png
図. R.solanacearumに感染したジャガイモ試料のHEX(R)に対する増幅曲線
Plant DNA ネガティブ コントロールおよび「テンプレートなしコントロール」(NTC) では増幅は検出されなかった。
ROX (18S) の増幅は、RS に感染したジャガイモと Plant DNA ネガティブ コントロールで検出されたが、NTC では検出されなかった。

参考文献
  1. Smith E. F. A Bacterial Disease of the Tomato, Eggplant, and Irishpotato (Bacillus solanacearum nov.sp.). US Department of Agriculture, Washington, DC. 1896
  2. Yabuuchi E, Yano I, Hotta H, Nishiuchi Y, Kosako Y. Transfer of Two Burkholderia and An Alcaligenes Species to Ralstonia Gen. Nov. Microbiol Immunol [Internet].1995 Nov1 [cited 2024 Sep 13];39(11):897-904.
  3. García RO, Kerns JP, Thiessen L. Diagnostic Guide Ralstonia solanacearum Species Complex :A Quick Diagnostic Guide. Plant Health Prog [Internet].2019[cited 2023Aug29];20:7-13
  4. Mansfield J, Genin S, Magori S, Citovsky V, Sriariyanum M, Ronald P, et al. Top 10 plant pathogenic bacteria in molecular plant pathology. Vol.13, Molecular Plant Pathology.2012.p.614-29.
  5. PM7/21(3) Ralstonia solanacearum, R. pseudosolanacearum and R.syzygii (Ralstonia solanacearum species complex). EPPO Bulletin. 2022 Aug 1;52(2):225-61.
  6. Safni I, Cleenwerck I, De Vos P, Fegan M, Sly L, Kappler U. Polyphasic taxonomic revision of the Ralstonia solanacearum species complex : International Journal of Systemic and Evolutionary Microbiology.2014;64:3087-103.

青枯病菌種複合体 (RSSC) 検出用 qPCRセット

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
qPCR Rs set 96 new詳細データ BRA 869600 1 SET
¥132,000
qPCR Rs set 192 new詳細データ BRA 869200 1 SET
¥249,000

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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