- トランスクリプトームシーケンシングでは、RNA 解析によりサンプル間の 発現量の差 (Expression profile) を見ることができ、リファレンスデー タベースがない種でも新規トランスクリプトーム解析を行えます。
- 21〜23個のヌクレオチドで構成されている非翻訳領域の small RNA (small non-coding RNA) が siRNA や miRNA として作用するメカニ ズムはよく知られています。
Transcriptome Sequencing(RNA-seq) トランスクリプトームシーケンシング (RNA-seq)
マクロジェン社:Transcriptome Sequencing
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データ解析*
Transcriptome data analysis
- Standard data analysis
- de novo Assembly / Alignment and Statistics
- Gene expression profile
- Differentially Expressed Genes (DEGs)
- SNPs and Indel calling by mapping to reference genome - Advanced data analysis
- Gene Annotations / Gene Set Analysis
- Comparative analysis
- Customized analysis
Small RNA data analysis
- Small RNA data Analysis
- Expression Profiles, Novel smRNA, Differentially Expressed miRNA
- Target Prediction of Known miRNA
- Gene Set Analysis
- Comparative analysis
* Data Analysis may be varified by the availability of reference and the type of platform.
納品データ例
参考価格および標準納期
サービス項目 | RNA-seq | small RNA-seq |
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使用機種 | NovaSeq 6000 or NovaSeq X plus | HiSeq2500 |
対象生物 | ヒト、マウス、ラット等 | ヒト、マウス、ラット等 |
データ量 | 4 Gb or 6Gb (リード数:4,000 万) | 1 レーン使用:約 8 Gb |
リード長 | 100 bp or 150bp | 50 bp |
シーケンス方法 | Paired End | Single End |
必要サンプル量 | Total RNA 1 µg 以上(mRNA Library Prep) Total RNA 0.5 µg 以上(Total RNA Library Prep) |
Total RNA 3 µg 以上 |
価格(税抜) |
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納期(QC合格後) | 約 4〜6 週間 | 約 8 週間(データ解析まで) |
納品物 |
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※1 Human, Mouseサンプルで5比較以上は追加費用が必要となります。
サンプルのご送付方法
- サンプルは緩衝材と保冷剤を入れた発泡スチロール製保冷箱に入れ、サンプルがDNAの場合は保冷剤を、サンプルがRNAの場合はドライアイスを十分入れてご送付ください。チューブの破損やクロスコンタミネーションに十分ご注意下さい。
- チューブには必ずラベルや油性マジックでサンプル名を記載し、他のチューブと判別できるようにご注意下さい。
- ご送付は宅急便等で下記宛先まで着払いにてご送付ください。なお、サンプルの紛失を避けるために事前に jutaku_gr@cosmobio.co.jp までご送付日、配送業者名、お問合せ番号をお知らせください。
サンプル 送付先 |
〒135-0064 東京都江東区青海2-4-32 タイム24ビル16F (株)マクロジェン・ジャパン NGSサービス係行き TEL: 03-5962-1124 |
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ご提供いただくサンプルについては、インフォームド・コンセントが取得されており、かつドナーの個人情報が特定できないように匿名化されたものである必要がございます。
お見積り・ご注文方法
お見積り依頼・ご注文の際は下記のオーダーシートに必要事項をご入力いただき、Email にてご送付をお願いいたします。ご注文の際はお取引のある代理店様に品番、数量をご指定の上ご発注下さい。またサンプルをご送付いただく際は本オーダーシートをサンプルに同封して下さい。
オーダーシート 送付先 |
コスモ・バイオ株式会社 創薬・受託サービス部 E-mail: jutaku_gr@cosmobio.co.jp |
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次世代シーケンシング受託サービス (MACROGEN)一覧
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- 全ゲノムシーケンシング (NovaSeq6000)
- PacBio® SequelⅡ ロングリードシーケンシング
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- エクソーム/ターゲットシーケンシング
- キャンサーパネルシーケンシング
- メタゲノムシーケンシング
お問い合わせ先 : 創薬・受託サービス部
ご質問・ご不明の点は創薬・受託サービス部までお問い合せください。また、秘密保持契約のご希望につきましても、下記までご連絡をお願いいたします。
- TEL
- 03-5632-9615
- FAX
- 03-5632-9614
- jutaku_gr@cosmobio.co.jp
商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。