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同一のFFPEサンプルからDNAとRNAの両方を抽出 CELLDATA DNAstorm™/RNAstorm™ 2.0 コンビネーションキット

メーカー名：Biotium, Inc.

独自のCAT5™テクノロジーを採用した、同一のFFPEサンプルからDNAとRNAの両方を抽出できるコンビネーションキットです。

ホルマリン固定された組織サンプルからの核酸抽出はこれまでの難題であり、増幅可能なDNA/RNAの収率は低く、逆転写やシーケンスライブラリー調製を含む酵素操作を伴うその後の工程でパフォーマンスが低下することがよくあります。独自のCAT5™ テクノロジーにより、CELLDATA DNAstorm™/RNAstorm™ 2.0 Combination Kitは、ホルムアルデヒドによる損傷を軽減し、より高い収量と品質でDNAとRNAの二重抽出の提供を可能にします。これにより、RNA-seq、qPCR、マイクロアレイ、その他の遺伝子発現解析などのアプリケーションにおけるDNA/RNAの増幅能が向上します。

特長

1つのFFPE組織サンプルからDNAとRNAを高収率で抽出
ホルムアルデヒド架橋を外すCAT5™ テクノロジー
刺激の強い溶媒を使用しない緩やかな条件
断片化が少なく、より高品質のDNA/RNAを精製
PCR、マイクロアレイ、次世代シーケンシングのようなダウンストリーム解析でより良い結果が得られる
シンプルなワークフロー

このキットは品番CD503の代替品です。新しいDewaxing Solution（キットに付属）を使用し、改良された脱パラフィン化プロトコルを使用しています。本キットはオリジナルのキットと同様、ホルムアルデヒド架橋を高効率で外す独自のCAT5™触媒技術が用いられています

FFPE 組織からの RNA または DNA 抽出には、CELLDATA RNAstorm™ 2.0 FFPE RNA Extraction Kit (品番：CD506) および CELLDATA DNAstorm™ 2.0 FFPE DNA Extraction Kit (品番：CD507) をご参照ください。また、フレッシュまたは凍結細胞/組織サンプルからRNAを精製するためのRNAstorm™ RNA Isolation Kitも提供しています。

構成内容

Dewaxing Solution
RNAstorm™ FFPE CAT5™ Reagent
RNAstorm™ FFPE Lysis Buffer
DNase A buffer
RNAstorm™ FFPE Protease
DNase I
DNAstorm™ FFPE CAT5™ Lysis Buffer
DNAstorm™ FFPE Proteinase K
RNase A
CELLDATA FFPE Binding Buffer
CELLDATA Wash Buffer
CELLDATA Spin Columns

ワークフロー

商品データ

図2 FFPE組織からの定量的RT-PCRによるRNA回収の比較。
「Q」は他社のFFPE抽出キットを示す。

図3 RNAstorm™ キットを用いて抽出した RNA は、市販の一般的なキットと比較して DV200 値が増加している。DV200 は、Agilent Bioanalyzer RNA 6000 nano キットを用いて測定した、200 nt 以上の長さの RNA の割合を示しています。

図4 同じサンプルからRNAstor™キットとKit QのRNAを用いて周出したRNAのBioAnalyzerトレースのオーバーレイ

図5 DNAstorm™ FFPEキットと一般的な競合キットを用いて、4種類のFFPE腫瘍サンプル（結腸直腸、肺、膀胱、食道）からDNAを抽出した。等量（500 ng）のDNAをロードし、パルスフィールドゲル上で分析した。DNAstorm™ キットを用いた場合、平均 DNA サイズの有意な向上が見られた。Kit R は他社の DNA FFPE 抽出キットを示す。

参考文献

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