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FFPEサンプルのRNA抽出に CELLDATA RNAstorm™ 2.0 FFPE RNA 抽出キット

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メーカー名：Biotium, Inc.

FFPE（ホルマリン固定パラフィン包埋）組織切片からのRNA抽出に優れ、他の方法と比較して収量が3～30倍、DV200（200塩基より長いRNA）が2倍増加します。

ホルマリン固定された組織サンプルからのRNA抽出は難しく、その後の工程での増幅可能なRNAの収量が低く、逆転写やシーケンスライブラリー調製など、酵素的操作を伴う後続工程でのパフォーマンスが低下していました。独自のCAT5™ テクノロジーにより、RNAstorm™ 抽出キットはホルムアルデヒドによるダメージの損傷を軽減し、より高いRINスコアとより高いDV200（% RNA >200nt）に示されるように、より高い収量と完全性を持つRNAを提供します。RNA-seq、qPCR、マイクロアレイ、その他の遺伝子発現解析などのアプリケーションにおいてより増幅可能なRNAを得るには、RNAstorm™ 2.0 FFPE RNA Extraction kitを使用することで成功の可能性を広げます。

特長

ホルムアルデヒド架橋を外すCAT5™ テクノロジー
他の方法と比較して、増幅可能なRNAを高い収率で抽出
刺激の強い溶媒を使用しない緩やかな条件
断片化が少なく、より高品質のRNAを精製
PCR、マイクロアレイ、次世代シーケンシングのようなダウンストリーム解析でより良い結果が得られる
シンプルなワークフロー

このキットは品番CD501の代替品です。新しいDewaxing Solution（キットに付属）を使用し、改良された脱パラフィン化プロトコルを使用しています。本キットはオリジナルのキットと同様、ホルムアルデヒド架橋を高効率で外す独自のCAT5™触媒技術が用いられています

FFPE組織サンプルから高品質のDNAを抽出には、CELLDATA DNAstorm™ 2.0 FFPE DNA Extraction Kit (品番：CD507)も提供しています。RNAstorm™ と DNAstorm™ キットを組み合わせることで、同じ組織切片から純粋な DNA と RNA の両方を得ることができます。RNAstorm™ 2.0キット(品番：CD506）とDNAstorm™ 2.0キット（品番：CD507）がセットになったDNAstorm™/RNAstorm™ 2.0 FFPE Combination Kit（品番：CD508）をご参照ください。詳細なプロトコールについては、App Note - Dual DNA and RNA Extraction from a Single FFPE Sample 外部リンクをご参照ください。また、フレッシュまたは凍結細胞/組織サンプルからRNAを精製するためのRNAstorm™ RNA Isolation Kitも提供しています。

構成内容

Dewaxing Solution
RNAstorm™ FFPE CAT5™ Reagent
RNAstorm™ FFPE Lysis Buffer
CELLDATA FFPE Binding Buffer
CELLDATA Wash Buffer
DNase A
RNAstorm™ FFPE Protease
CELLDATA Spin Columns

ワークフロー

商品データ

図2 FFPE組織からの定量的RT-PCRによるRNA回収の比較。
「Q」は他社のFFPE抽出キットを示す。

図3 RNAstorm™ キットを用いて抽出した RNA は、市販の一般的なキットと比較して DV200 値が増加している。DV200 は、Agilent Bioanalyzer RNA 6000 nano キットを用いて測定した、200 nt 以上の長さの RNA の割合を示しています。

図4 同じサンプルからRNAstor™キットとKit QのRNAを用いて周出したRNAのBioAnalyzerトレースのオーバーレイ

参考文献

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