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E.coli由来の断片化DNAはCleavage Under Targets and Release Using Nuclease (CUT&RUN)の標準化のためのspike-inコントロールとして用いられます。
EpiCypher社では、CUT&RUNに適したCUTANA™ E.coli spike-in DNAを提供しています。
商品情報
図1 電気泳動データ
Lane 1：E.coli JM101 のゲノムDNA 500ng
Lane 2：消化・精製したCUTANA™ E.coli Spike-in DNA 500 ng
泳動には2% E-Gel™ EX Agarose Gelを用いた。
図2 CUT&RUNシークエンス解析
CUTANA™ E.coli spike-in DNA（0.5ngおよび1.0 ng）を、少量のターゲット（H3K4me3, EpiCypher社品番13-0041）、大量のターゲット（H3K27me3, EpiCypher社品番13-0030）、およびIgGネガティブコントロール（EpiCypher社品番13-0042）用に濃縮されたK562細胞（5.0 x105 cells）を用いたCUT&RUNサンプルに加えた。ペアエンドシークエンスリードの合計数、E.coliとアラインしたリード数、E.coli spike-in DNAにアラインした全シークエンスリードのパーセンテージを表にした。緑のボックスは、各ターゲットに対し推奨されるE.coli spike-in DNAの量を示す。
CUTANA™ E. coli Spike-in DNA
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 |
|---|---|---|---|---|
CUTANATM E. coli Spike-in DNA |
ECY | 18-1401 | 100 NG |
￥39,000 |
Histone H3K27me3抗体
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 |
|---|---|---|---|---|
| Anti Histone H3K27me3 (Rabbit) |
ECY | 13-0030 | 100 UG |
販売終了 |
Histone H3K4me3リコンビナント抗体
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 |
|---|---|---|---|---|
| Anti Histone H3K4me3, Recombinant Antibody (Rabbit) |
ECY | 13-0041 | 100 UG |
￥126,000 |
CUTANA™ CUT&RUN ネガティブコントロール
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 |
|---|---|---|---|---|
| CUTANATM Negative Control for CUT&RUN and CUT&Tag (Rabbit) |
ECY | 13-0042 | 100 UG |
￥24,000 |
商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。
※ 表示価格について
- 「CUTANA™ E.coli Spike-in DNA」は、下記のカテゴリーに属しています。
