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本商品は、マルチプレックス RT-PCR と次世代シーケンシング（NGS）のプロトコルを組み合わせた、T 細胞受容体（TCR）と B 細胞受容体（BCR）の両方のレパートリーを単一の反応で同時にプロファイリングできるキットです。
記事ID ： 47042
低発現のクロノタイプ検出に最適！TCR/BCRレパトア解析用キット DriverMap™ Adaptive Immune Receptor (AIR) TCR-BCR プロファイリングキット
- カテゴリから探す > 分子生物 > DNAシーケンシング > 次世代シーケンシングキット
特長
- TCR 4鎖（TRA/B/G/D）およびBCR 3鎖（IGH/K/L）を同時解析可能
- 非特異的結合を最小限に抑えた特定配列の Validator Barcodes（VBC）を使用することにより、バックグラウンドを抑え、低発現のクロノタイプを検出
- 同一サンプルから細胞数（DNA）と転写量（RNA）を解析することで、抗原活性化クローンを同定
- クローン多様性解析等に適したCDR3と、抗体開発等に適した全長可変領域から選択可能
- 全血、PBMC、癌生検、組織サンプル、FFPE、乾燥血スポットなど、さまざまなサンプルに対応
ワークフロー
DriverMap™ AIR RNAアッセイ
DriverMap™ AIR DNAアッセイ
図1：DriverMap™ AIRのワークフロー
PCRでの増幅前に、VBCを含むRNAまたはDNAのターゲット領域のプライマーを反応させ、ターゲット分子にVBCを組み込む。これにより、ライブラリ調製過程での増幅バイアスを補正可能にし、高精度かつ再現性の高いレパトア解析を実現する。
データ例
図2： TCR/BCR鎖の各クロノタイプ数
RNAから全7種類のTCR/BCR鎖を同時に解析可能。
図3：プライマーのバーコードで最も一般的なUnique Molecular Identifier（UMIs）とVBCの比較
左図：PBMC由来のDNA でUMIを用いたプライマーとVBCを用いたプライマーでPCR後に増幅産物を比較したところ、UMIを使用したレーン6、8と比較して、VBCを使用したレーン5、7はバックグラウンドが低く、増幅された遺伝子の収量が向上した。
右図： VBCとUMIを使用した場合のNGSリードカウント数を比較したところ、VBCは、低発現のクロノタイプの検出率が高く（緑）、UMIアッセイでは検出されなかったクロノタイプを検出した（赤矢印）。
図4：同一サンプルからのRNAとDNAの解析
転移性脳腫瘍由来のRNAとDNAでTCR/BCRクローンの頻度を比較すると、5〜10％の腫瘍活性化TCR/BCRクローン（括弧で示す）が存在することが分かった。
CDR3と全長可変領域のプロファイリングの比較
| CDR3のみ | 全長可変領域 | |
| 解析領域 | CDR3 | FR1、FR2、FR3、CDR1、CDR2、CDR3 |
| 主な解析目的 |
|
|
| 解析対象サンプル | RNAまたはDNA | RNAのみ |
| プライマー設計領域 |  |
 |
| アンプリコン長（bp） | 約300bp | 約600bp |
| 対応NGSシーケンサー | Illumina NextSeq500/550、NextSeq 2000、NovaSeq | Illumina NextSeq 2000（×2 300 cycles） |
商品情報
各キットは96reactionsもご用意しています。詳細はお問い合わせください。
DiverMap™ AIR CDR3 TCR-BCR Profiling Kit (Human RNA)
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 | 在庫 |
|---|---|---|---|---|---|
DriverMapTM AIR RNA CDR3 TCR-BCR Profiling Reagent Kit, V2, Human  |
CLT | DMAIR2-HTBR-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥400,000 | なし |
| DriverMapTM AIR RNA CDR3 BCR Profiling Reagent Kit, V2, Human |
CLT | DMAIR2-HBR-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥360,000 | なし |
| DriverMapTM AIR RNA CDR3 TCR Profiling Reagent Kit, V2, Human |
CLT | DMAIR2-HTR-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥360,000 | なし |
DiverMap™ AIR CDR3 TCR-BCR Profiling Kit (Human DNA)
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 | 在庫 |
|---|---|---|---|---|---|
| DriverMapTM AIR DNA CDR3 BCR Profiling Reagent Kit, V2, Human | CLT | DMAIR2-HBD-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥360,000 | なし |
| DriverMapTM AIR DNA CDR3 TCR Profiling Reagent Kit, V2, Human | CLT | DMAIR2-HTD-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥360,000 | なし |
DiverMap™ AIR CDR3 TCR-BCR Profiling Kit (Mouse RNA)
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 | 在庫 |
|---|---|---|---|---|---|
| DriverMapTM AIR RNA CDR3 TCR-BCR Profiling Reagent Kit, V2, Mouse |
CLT | DMAIR2-MTBR-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥400,000 | なし |
| DriverMapTM AIR RNA CDR3 BCR Profiling Reagent Kit, V2, Mouse |
CLT | DMAIR2-MBR-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥360,000 | なし |
| DriverMapTM AIR RNA CDR3 TCR Profiling Reagent Kit, V2, Mouse |
CLT | DMAIR2-MTR-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥360,000 | なし |
DiverMap™ AIR CDR3 TCR-BCR Profiling Kit (Mouse DNA)
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 | 在庫 |
|---|---|---|---|---|---|
| DriverMapTM AIR DNA CDR3 BCR Profiling Reagent Kit, V2, Mouse |
CLT | DMAIR2-MBD-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥360,000 | なし |
| DriverMapTM AIR DNA CDR3 TCR Profiling Reagent Kit, V2, Mouse |
CLT | DMAIR2-MTD-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥360,000 | なし |
DiverMap™ AIR Full-length TCR-BCR Profiling Kit (Human RNA)
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 | 在庫 |
|---|---|---|---|---|---|
| DriverMapTM AIR RNA Full-length TCR-BCR Profiling Reagent Kit, V2, Human |
CLT | DMAIR2-HTBR-F-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥440,000 | なし |
| DriverMapTM AIR RNA Full-length TCR Profiling Reagent Kit (Human), V2 |
CLT | DMAIR2-HTR-F-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥390,000 | なし |
| DriverMapTM AIR RNA Full-length BCR Profiling Reagent Kit, V2, Human |
CLT | DMAIR2-HBR-F-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥390,000 | なし |
DiverMap™ AIR Full-length TCR-BCR Profiling Kit (Mouse RNA)
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 | 在庫 |
|---|---|---|---|---|---|
| DriverMapTM AIR RNA Full-length TCR A/B & BCR Profiling Reagent Kit, V2, Mouse |
CLT | DMAIR2-MTBR-F-24-B1 | 1 KIT [for 24 reactions] |
￥440,000 | なし |
NGS Index Plate (Universal for EXP/AIR)
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 | 在庫 |
|---|---|---|---|---|---|
| Unique Dual Index Set A for DriverMap EXP or AIR (1-96) | CLT | DM-NGS-SETA-B2 | 1 PLATE [1x 96-Well Plate (4 rxn/well)] |
￥70,000 | なし |
DriverMapシリーズのキットを使用して調製されたライブラリのシーケンスを行う際、本キットが必要になります。
各プレートには、フォワードおよびリバースDNA/RNAプライマーを組み合わせた96種類のユニークなインデックスが含まれています。
DriverMap AIR RNA Spike-in コントロール
| 品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 | 在庫 |
|---|---|---|---|---|---|
| DriverMap AIR BCR Spike-in Premixed Controls (Human RNA) | CLT | DMAIR-HBR-SC-M | 1 KIT |
￥260,000 | なし |
| DriverMap AIR BCR Spike-in Isoform Pools (Human RNA) | CLT | DMAIR-HBR-SC-P | 1 KIT |
￥330,000 | なし |
| DriverMap AIR TCR Spike-in Premixed Controls (Human RNA) | CLT | DMAIR-HTR-SC-M | 1 KIT |
￥260,000 | なし |
| DriverMap AIR TCR Spike-in Isoform Pools (Human RNA) | CLT | DMAIR-HTR-SC-P | 1 KIT |
￥330,000 | なし |
関連商品・サービス
- 簡便かつ低コスト！シングルセルTCR/BCRレパトア解析キット
DriverMap™ Single-Cell Adaptive Immune Receptor（AIR）TCR-BCR アッセイキット - Cellecta社 DriverMap™ 解析受託サービス
- DriverMap™ Expression (EXP) ヒトゲノムワイド発現プロファイリングキット
受託サービスに関するご相談
商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。
※ 表示価格について
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