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低発現のクロノタイプ検出に最適！TCR/BCRレパトア解析用キット DriverMap™ Adaptive Immune Receptor (AIR) TCR-BCR プロファイリングキット

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メーカー名：Cellecta, Inc.

本商品は、マルチプレックス RT-PCR と次世代シーケンシング（NGS）のプロトコルを組み合わせた、T 細胞受容体（TCR）と B 細胞受容体（BCR）の両方のレパートリーを単一の反応で同時にプロファイリングできるキットです。

特長

TCR 4鎖（TRA/B/G/D）およびBCR 3鎖（IGH/K/L）を同時解析可能
非特異的結合を最小限に抑えた特定配列の Validator Barcodes（VBC）を使用することにより、バックグラウンドを抑え、低発現のクロノタイプを検出
同一サンプルから細胞数（DNA）と転写量（RNA）を解析することで、抗原活性化クローンを同定
クローン多様性解析等に適したCDR3と、抗体開発等に適した全長可変領域から選択可能
全血、PBMC、癌生検、組織サンプル、FFPE、乾燥血スポットなど、さまざまなサンプルに対応

ワークフロー

DriverMap™ AIR RNAアッセイ

DriverMap™ AIR DNAアッセイ

図1：DriverMap™ AIRのワークフロー
PCRでの増幅前に、VBCを含むRNAまたはDNAのターゲット領域のプライマーを反応させ、ターゲット分子にVBCを組み込む。これにより、ライブラリ調製過程での増幅バイアスを補正可能にし、高精度かつ再現性の高いレパトア解析を実現する。

データ例

図2： TCR/BCR鎖の各クロノタイプ数
RNAから全7種類のTCR/BCR鎖を同時に解析可能。

図3：プライマーのバーコードで最も一般的なUnique Molecular Identifier（UMIs）とVBCの比較
左図：PBMC由来のDNA でUMIを用いたプライマーとVBCを用いたプライマーでPCR後に増幅産物を比較したところ、UMIを使用したレーン6、8と比較して、VBCを使用したレーン5、7はバックグラウンドが低く、増幅された遺伝子の収量が向上した。
右図： VBCとUMIを使用した場合のNGSリードカウント数を比較したところ、VBCは、低発現のクロノタイプの検出率が高く（緑）、UMIアッセイでは検出されなかったクロノタイプを検出した（赤矢印）。

図4：同一サンプルからのRNAとDNAの解析
転移性脳腫瘍由来のRNAとDNAでTCR/BCRクローンの頻度を比較すると、5～10％の腫瘍活性化TCR/BCRクローン（括弧で示す）が存在することが分かった。

CDR3と全長可変領域のプロファイリングの比較

	CDR3のみ	全長可変領域
解析領域	CDR3	FR1、FR2、FR3、CDR1、CDR2、CDR3
主な解析目的	T細胞の多様性とクローン性の追跡自己免疫疾患のマーカー探索	抗体とワクチンの開発 T細胞エピトープの探索
解析対象サンプル	RNAまたはDNA	RNAのみ
プライマー設計領域
アンプリコン長（bp）	約300bp	約600bp
対応NGSシーケンサー	Illumina NextSeq500/550、NextSeq 2000、NovaSeq	Illumina NextSeq 2000（×2 300 cycles）

商品情報

各キットは96reactionsもご用意しています。詳細はお問い合わせください。

DiverMap™ AIR TCR-BCR Profiling Kit (Human RNA)

・TCR/BCR両方

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
DriverMap^TMAIR TCR-BCR Profiling Kit (Human RNA), V2	CLT	DMAIR2-HTBR-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥420,000
DriverMap^TMAIR TCR-BCR Full-length Profiling Kit (Human RNA), V2	CLT	DMAIR2-HTBR-F-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥450,000

・TCR

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
DriverMap^TMAIR TCR Profiling Kit (Human RNA), V2	CLT	DMAIR2-HTR-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥370,000
DriverMap^TMAIR TCR Full-length Profiling Kit (Human RNA), V2	CLT	DMAIR2-HTR-F-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥400,000

・BCR

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
DriverMap^TMAIR BCR Profiling Kit (Human RNA), V2	CLT	DMAIR2-HBR-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥370,000
DriverMap^TMAIR BCR Full-length Profiling Kit (Human RNA), V2	CLT	DMAIR2-HBR-F-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥400,000

DriverMap™ AIR TCR-BCR Profiling Kit (Human DNA)

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
DriverMap^TM AIR TCR Profiling Kit (Human DNA), V2, Human	CLT	DMAIR2-HTD-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥370,000
DriverMap^TM AIR BCR Profiling Kit (Human DNA), V2	CLT	DMAIR2-HBD-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥370,000

DriverMap™ AIR TCR-BCR Profiling Kit (Mouse RNA)

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
DriverMap^TM AIR TCR-BCR Profiling Kit (Mouse RNA), V2	CLT	DMAIR2-MTBR-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥420,000
DriverMap^TM AIR TCR Profiling Kit (Mouse RNA), V2	CLT	DMAIR2-MTR-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥370,000
DriverMap^TM AIR BCR Profiling Kit (Mouse RNA), V2	CLT	DMAIR2-MBR-24	1 KIT [for 24 reactions]	￥370,000

DriverMap AIR RNA Spike-in コントロール

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
DriverMap AIR TCR Spike-in Premixed Controls (Human RNA)	CLT	DMAIR-HTR-SC-M	1 KIT	￥260,000
DriverMap AIR TCR Spike-in Isoform Pools (Human RNA)	CLT	DMAIR-HTR-SC-P	1 KIT	￥330,000
DriverMap AIR BCR Spike-in Premixed Controls (Human RNA)	CLT	DMAIR-HBR-SC-M	1 KIT	￥260,000
DriverMap AIR BCR Spike-in Isoform Pools (Human RNA)	CLT	DMAIR-HBR-SC-P	1 KIT	￥330,000