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研究用

高い信頼性と分解能で解析可能! エピトープ・パラトープマッピング解析サービス ~Rapid HDX-MS™~

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Rapid Novor 社では、HDX-MS 技術を用いたエピトープマッピング解析やパラトープマッピング解析を高い信頼性と分解能で行う Rapid HDX-MS™ を提供いたします。

HDX-MS 技術は、抗体および抗原に存在するアミド水素原子の「重水素への置換効率」の違いを利用して結合部位 (エピトープ) を特定する手法です。タンパク質表面の水素原子は容易に重水素に置き換わりますが、抗原抗体複合体の結合部位のような内部に埋もれている水素原子は置き換わりにくいという性質を利用しています。

なお、本サービスには解析対象となる抗体や抗原の配列情報が必要となります。配列情報をお持ちでないお客様は REmAb® de novo 抗体・プロテインシーケンス解析サービスを併せてご検討ください。

特長

  • Rapid Novor 社保有の多種多様な酵素から適切な酵素を選択し、最適な消化条件での処理により、高いカバレッジでの解析が可能
  • 最大 1〜5 アミノ酸残基での高い解像度で解析が可能
  • リニアエピトープ、コンフォメーショナルエピトープの解析に対応
  • Waters 社の「Cyclic IMS (イオンモビリティ質量分析計)」および Trajan 社のオートサンプラーを採用した最新のシステム環境で測定を実施

サービスフロー

Rapid HDX-MS™ による解析プロセス
図1.Rapid HDX-MS™ による解析プロセス

Step1: サンプル送付

お客様より分析用サンプル (抗原・抗体等) および配列情報をご提供いただく

Step2: HDX-MS による実験プロセスの実施

(1) 水素・重水素交換: 重水 (D2O) 環境下でタンパク質をインキュベートし、アミド水素を重水素に交換
(2) クエンチ: 低温 (0℃) かつ酸性 (pH 2.5) 条件を適用し、交換反応を停止
(3) 消化/断片化: 液相での酵素消化、または MS 装置内でのフラグメンテーションでペプチド断片へ分解
(4) 冷却 LC-MS 分析: 重水素の逆交換を防ぐため、冷却された流路を通り LC-MS にて高精度測定

Step3: データ解析

得られた質量分析データを高度なアルゴリズムで解析

Step4: 納品

  • エピトープもしくはパラトープ領域の解析結果
  • 重水素取り込みのヒートマップ及びプロットデータ
  • アミノ酸配列および 3 次元構造上における重水素取り込み領域の解析結果

サンプル要件 (エピトープマッピング・パラトープマッピング)

  • 抗原: 200 µg (濃度: 0.5 mg/mL 以上)
  • 抗体: 200 µg (濃度: 2 mg/mL 以上) *1
  • 抗体配列情報 (パラトープ解析の場合)
  • 抗原情報: 分子量、バッファー情報など
  • 抗体と抗原の結合親和性情報 *2

*1: アイソタイプにより、必要量が異なる場合がございいます。
*2: 結合親和性情報を持ち合わせていない場合、RapidNovor 社では SPR kinetic analysis の対応も可能です。ご希望の場合は、遠慮なくご相談ください。

関連サービス: Custom HDX-MS による様々な解析

その他、柔軟な解析アプローチにより幅広いタンパク質研究に対応いたします。詳細はお問い合わせください。

  • 抗体結合の評価
  • コンフォメーション変化/立体配座変化の検出
  • 多タンパク質複合体の解析
  • 天然変性タンパク質の測定
  • 膜タンパク質および糖鎖修飾タンパク質の解析
  • ジスルフィド結合タンパク質の解析
  • リガンド結合の検証
Custom HDX-MS™ の解析領域
図2.Custom HDX-MS™ の解析領域

お見積もり依頼・お問い合わせ

お見積もりをご希望のお客様は、以下の解析依頼書に必要事項をご記入の上、下記の問い合わせ先へご連絡ください。
■解析依頼書 Word
問合せ先: jutaku_gr@cosmobio.co.jp

受託サービスに関するご相談
電話でのお問い合わせ
03-5632-9615
受付時間:平日(9:00~17:30)

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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お問い合わせ

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