• ホーム
  • 商品情報
  • CRISPR ヒト/マウスゲノムワイド sgRNA ライブラリー(Cellecta社) Cellecta社:低コストでゲノムワイドな遺伝子探索を実現!!

商品情報

記事ID : 16213
研究用

低コストでゲノムワイドな遺伝子探索を実現!!CRISPR ヒト/マウスゲノムワイド sgRNA ライブラリー(Cellecta社)
Cellecta社:低コストでゲノムワイドな遺伝子探索を実現!!

Cellecta社:低コストでゲノムワイドな遺伝子探索を実現!!" data-hatena-bookmark-layout="standard-balloon" data-hatena-bookmark-lang="ja" title="このエントリーをはてなブックマークに追加">このエントリーをはてなブックマークに追加

Cellecta 社のゲノムワイドなヒト/マウスプール型レンチウイルス sgRNA ライブラリーは標的遺伝子分野が異なる 3 つの Module から構成されており、機能欠損スクリーニングにご利用いただけます。各 Module には約 6,500 種類の遺伝子を標的とする約 55,000 種類の sgRNA が含まれています。またゲノムワイドな Single Module もご用意しており、約1 9,000種類の遺伝子を標的とする約 80,000 種類の sgRNA が含まれています。各 Module には 1 標的遺伝子に対して最大 8 種類の sgRNA が設計されています。本ライブラリーは sgRNA ごとに異なるバーコード配列が発現カセットに挿入されているため、スクリーニング後に次世代シーケンス解析することでノックアウトされた標的遺伝子を特定可能です。
スクリーニング実験後の細胞をご送付いただき、次世代シーケンスを行う受託サービスもご用意しております。

 

プール型レンチウイルス sgRNA ライブラリー実験概要

プール型レンチウイルス sgRNA ライブラリー実験概要

 


シングルモジュールのライブラリーも販売開始!

  • 1つのライブラリーで19,000protein-coding geneをカバーしており、各遺伝子について4つのsgRNAデザイン、約80,000sgRNAがプールされております。
 

sgRNA ライブラリーの特徴

  • 各標的遺伝子に対して 4-8 種類の sgRNA
  • 全てのライブラリーを合わせるとほぼ全ての遺伝子をカバー(19,000 以上)
  • Illumina HiSeq および GAIIx、NextSeq により標的遺伝子を特定可能
CRISPR Human Genome Knockout Library 標的分野 標的遺伝子数 sgRNA 数
Module 1 シグナル伝達 6,555 約 55,000
Module 2 疾患関連
既知薬剤ターゲット
6,262 約 55,000
Module 3 細胞表面マーカー
細胞外マトリックス
DNA 結合
6,184 約 55,000
Single-module (80K)NEW ゲノムワイド 約19,000 約80,000

詳細

各 sgRNA ライブラリーの標的遺伝子リストやマニュアル等は下記のリンクからダウンロードして下さい。

納品形態 sgRNA Library 標的遺伝子リスト Product Analysis Certificate User Manual
プラスミドライブラリー Module 1 Excel PDF PDF
Module 2 Excel PDF
Module 3 Excel PDF
Single Module (80K)NEW Excel PDF
パッケージ済みウイルスフォーム Module 1 Excel PDF
Module 2 Excel PDF
Module 3 Excel PDF
Single Module (80K)NEW Excel PDF

本ライブラリーは U6 プロモーターで sgRNA を発現し、ヒトユビキチンC プロモーター下に TagRFP(Evrogen)とピューロマイシン耐性遺伝子を配置した下記ベクターを使用しております。

CRISPR Library Vector NGS Cassette Sequence (.txt | .gbk | .dna*)
pRSG16-U6-sg-HTS6C-UbiC-TagRFP-2A-Puro HTS6C-noBCPDF FASTA | GenBank | SnapGene

※ dna フォーマットファイルを開くために SnapGene® Viewer 外部リンク をダウンロードして下さい。

 

pRSG16-U6-sg-HTS6C-UbiC-TagRFP-2A-Puro

 

本ライブラリーは広く使用されている第二、または第三世代の VSV-G 偽型ウイルス粒子や、Cellecta 社の第二世代の psPAX2/pMD2.G packaging plasmid mix(Ready-to-use Packaging Plasmid Mix, 品番: CPCP-K2A, 250 μg)によりパッケージすることができます。Cellecta 社のパッケージ済みライブラリーのタイターは 293T 細胞にトランスダクションし、RFP 陽性細胞の FACS により決定可能です。

参考価格及び標準納期

◯ プラスミドライブラリー
品番 品名 標的分野 包装 価格 納期
KOHGW-M1-P CRISPR Human Genome Knockout Library,
Module 1
シグナル伝達 200 ug お問合せ 約3週間
KOHGW-M2-P CRISPR Human Genome Knockout Library,
Module 2
疾患関連
既知薬剤ターゲット
KOHGW-M3-P CRISPR Human Genome Knockout Library,
Module 3
細胞表面マーカー
細胞外マトリックス
DNA 結合遺伝子
KOHGW-80K-PNEW CRISPR Human Genome 80K Knockout Library , Single Module ゲノムワイド
KOMGW-80K-PNEW CRISPR Mouse Genome 80K Knockout Library (plasmid) ゲノムワイド

営利団体のお客様と非営利団体のお客様で品番と価格が異なります。詳細はお問合せください。

◯ パッケージ済みウイルスフォーム
品番 品名 標的分野 包装 価格 納期
KOHGW-M1-V8 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 1 シグナル伝達 2 x 108 TU お問合せ 約5週間
KOHGW-M2-V8 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 2 疾患関連
既知薬剤ターゲット
KOHGW-M3-V8 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 3 細胞表面マーカー
細胞外マトリックス
DNA 結合遺伝子
KOHGW-80K-V9NEW CRISPR Human Genome 80K Knockout Library , Single Module ゲノムワイド
KOMGW-80K-V8NEW CRISPR Mouse Genome 80K Knockout Library (virus) ゲノムワイド
KOHGW-M1-V9 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 1 シグナル伝達 1 x 109 TU
KOHGW-M2-V9 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 2 疾患関連
既知薬剤ターゲット
KOHGW-M3-V9 CRISPR Human Genome Knockout Library, Module 3 細胞表面マーカー
細胞外マトリックス
DNA 結合遺伝子
KOHGW-80K-V9NEW CRISPR Human Genome 80K Knockout Library , Single Module ゲノムワイド
KOMGW-80K-V9NEW CRISPR Mouse Genome 80K Knockout Library (virus) ゲノムワイド

営利団体のお客様と非営利団体のお客様で品番と価格が異なります。詳細はお問合せください。

◯ Cas9発現用ベクター及びパッケージング済ウイルス粒子
品番 品名 包装 希望販売価格
SVC9-PS CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Hygro (plasmid) 25 ug ¥68,000
SVC9B-PS CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Blast (plasmid) 25 ug ¥68,000
SVC9-VS CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Hygro (packaged virus) 1 x 106 TU ¥116,000
SVC9B-VS CRISPR Cas9 Expression Vector pR-CMV-Cas9-2A-Blast (packaged virus) 1 x 106 TU ¥116,000
◯ パッケージング用製品
品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
293LTV Cell Line, CBL LTV-100 1 VIAL ¥81,000
Ready-to-Use Packaging Plasmid Mix (250ug), CLT CPCP-K2A 1 EACH ¥68,000

sgRNA ライブラリースクリーニングの次世代シーケンス解析受託サービス

本サービスは、CLT 社ライブラリーを使用して調製した各サンプルの凍結ペレット(細胞・組織)または gDNA (200 µg/sample, 0.5 -1.0 µg/µL) をご提供いただき、CLT 社にてDNA 抽出・増幅、次世代シークエンシングデータ取得・解析を行い、sgRNA 配列のリストをご提供するものです。サンプルは、フェノール- クロロホルム耐性の15-mL サイズのポリプロピレン遠心用チューブに保管し、黒色または青色のアルコール耐性マーカーで各チューブにサンプル名をご記入いただき、チューブラベルとサンプル詳細とを記載したリストと共にドライアイス便でご発送ください。

受託サービスの流れ
1. お申込書類記載  Word
2. CLT 社へ細胞・組織ペレット(品番 CANA-SQ)、またはゲノムDNA(品番 CANA-SQD)の送付
3. CLT 社にて実験・解析作業
  1. 各サンプルからゲノムDNAを抽出する(細胞、組織ペレットの場合)
  2. 抽出したゲノムDNA のバーコードを増幅後、ハイスループットシークエンシング調製する
  3. 各サンプルの増幅されたバーコードをシークエンス(> 20 x 106 リード)
  4. 各バーコードを sgRNA 配列と照合させ、解析する
    (ア) 各 sgRNA 配列の相対存在量の算出(バーコード/sgRNA 数)
    (イ) サンプル間の差異計算(お客様より何れのサンプル間を比較するという情報をいただいた場合に限ります)
  5. 報告書を作成
4. コスモ・バイオより報告書(電子データ)を納品

 

関連商品・受託サービス

お問い合わせ先 : 創薬・受託サービス部

ご質問・ご不明の点は創薬・受託サービス部までお問い合せください。また、秘密保持契約のご希望につきましても、下記までご連絡をお願いいたします。

TEL
03-5632-9615
FAX
03-5632-9614
E-mail
CLT@cosmobio.co.jp

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

お問い合わせ

「CRISPR ヒト/マウスゲノムワイド sgRNA ライブラリー(Cellecta社) Cellecta社:低コストでゲノムワイドな遺伝子探索を実現!!」は、下記のカテゴリーに属しています。

商品検索

商品情報

サポート情報

メーカー・代理店一覧

企業情報

関連サイト


© COSMO BIO