空間遺伝子発現解析は組織上位置情報を保持したまま遺伝子発現解析が可能ですが、マルチプレックス化するほど検出感度が低下し、ノイズが増加することで低発現の遺伝子を検出や、正確なセグメンテーションができないことが課題でした。
MERSCOPE Ultra™は高精度に遺伝子検出ができるMERFISH2.0技術とサンプル調製の最適化により、これらの課題を解決し、ハイプレックスと高感度・高い特異性を両立した唯一の in situ 空間遺伝子発現解析プラットフォームです。
本装置を使用した国内での受託サービスも開始いたしました。
図1：MERSCOPE Ultra™
RNAを固定し、組織の透明化処理によりバックグラウンドを最小化した後に、 標的遺伝子へプローブをハイブリダイゼーションします。 各遺伝子に予め割り当てたバーコードを光学的に検出するイメージングラウンドを繰り返し、 組織上の数百の遺伝子を同時に検出します。
| 解析領域 | 1.25 cm2 または 3 cm2 |
|---|---|
| マルチプレックス数 | 最大960遺伝子 |
| 光学解像度 | 油浸、高開口数対物レンズ |
| 横解像度 | 100 nm |
完全カスタムで1から遺伝子を選択するカスタムパネルに加え、既製品パネルにご希望の遺伝子を追加できるAdd-Onパネルをご用意しております。既製品パネル＋Add-Onパネルにより、カスタマイズ性は保ったまま、パネル設計の手間や時間を削減することが可能です。
| Human | Brain | Pan Human | Metabolic | Inflammation | Cardiovascular |
|---|---|---|---|---|---|
| ImmunoOncology | Breast Cancer | Colon Cancer | Lung Cancer | Liver Cancer | |
| Kidney Cancer | Skin Cancer | ||||
| Mouse | Pan Neuro | Pan Mouse | ImmunoOncology | Liver | Kidney |
| Cardiovascular | Lung | Transcription | Transcription Factor B |
弊社の札幌ラボに導入したMERSCOPE Ultra™を使用して、お客様のサンプルを評価いたします。
| 実施内容 | Verification（RNAのQuality checkおよび実験条件の検討） 、 本染色 |
|---|---|
| 実施場所 |
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| 受け入れ可能サンプル |
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| 価格 | お問い合わせ |
| 納期 | サンプル到着後、1〜2ヶ月程度 |
| 納品物 | 専用ソフトウェアVizualizerで閲覧可能な解析データ一式 |
A：全体の細胞
B：グルタミン酸作動性ニューロン
図２：実験概要とクラスタリング解析
健常者とAD患者の脳から作製した凍結切片を同一スライドガラス上に配置してMERSCOPE Ultra™で解析し、960種類のRNAとAD関連タンパク質を同時にプロファイリングした（上図）。
全細胞のUMAP解析および空間分布の特定（下図A）に加え、グルタミン酸作動性ニューロンのサブタイプ解析（下図B）も可能。
図３：Amyloid beta（Aβ）抗体との共染色および周辺細胞の分布
Aβプラーク周辺のグルタミン酸作動性ニューロン（SLC17A7）、オリゴデンドロサイト（Mog）の遺伝子発現を可視化した（左図）。
Aβプラークから各発現細胞からまでの距離を算出し、近傍に存在する細胞種の分布を示した（右図）。
参照：Vizgen 社 SFN 2025ポスター（Unlocking Insights in Alzheimer's Disease from Archived Brain Tissue Samples with High Sensitivity Spatial Transcriptomics）
文献は こちら
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