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研究用

シングルセルレベルの空間トランスクリプトーム解析 シングルセル空間解析:Xenium In Situ Panel受託解析サービス
マクロジェン社:シングルセルレベルの空間トランスクリプトーム解析

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受託サービス
受託サービス


マクロジェン社 トランスクリプトーム解析サービス 応援キャンペーン 期間:2025年1月31日(金)サンプル到着分まで

10x Genomics社のXenium In Situ Analyzerを使用し、シングルセルレベルで組織内の位置情報を保持したまま遺伝子発現解析が可能な受託サービスです。

特長

  • 既存パネルを使用し、ヒトまたはマウス組織において主要な細胞の種類や状態をプロファイリング可能
  • 一度の解析で約5,000種類のRNAを同時に検出可能
  • 既存パネルに最大100遺伝子を追加することで、プロジェクトに特化したバイオマーカーや細胞種のプロファイリング可能

サービスの流れ

サービスの流れ 1.サンプル準備 2.Probeハイブリダイゼーション&増幅 3.蛍光Probeハイブリダイゼーション&イメージング 4.データ解析

対象パネル

ヒトまたはマウス組織において主要な細胞の種類や状態をプロファイリングできます。既存のパネルに最大100遺伝子を追加することで、ご自身のプロジェクトに特化したバイオマーカーや細胞種のプロファイリングが可能です。また、480種類の遺伝子から独自のカスタムパネルの構築も承ります。

生物種 Panel 研究対象 ターゲット数
ヒト Immuno-Oncology Profiling Panel 主要な免疫細胞タイプの遺伝子マーカー、チェックポイントマーカーなど 380
Multi Panel 乳房、結腸、心臓、腎臓、肝臓、肺、膵臓 377
Brest Panel 乳腺腺細胞、上皮細胞、脂肪細胞、腫瘍 280
Brain Panel 星状細胞、ミクログリア、膠芽腫、アルツハイマー病、パーキンソン病 266
Lung Panel I型&II型肺胞上皮細胞、線毛細胞、内皮細胞、COVID-19 289
Skin Panel 角化細胞、メラノサイト、血管内皮細胞、免疫細胞、メラノーマ 282
Colon Panel 吸収性腸細胞、腸管内分泌細胞、杯細胞、パネート細胞、線維芽細胞 322
マウス Brain Panel 星状細胞、介在ニューロン、ミクログリア、オリゴデンドロサイト 247
Multi Panel 膀胱、骨髄、脳、心臓、腎臓、四肢筋、肺、膵臓、胸腺 379

5,000を超える遺伝子の網羅的解析のパネルが加わりました。

生物種 Panel 研究対象 ターゲット数
ヒト 5K Pan Tissue & Pathways Panel 生物学的パスウェイ、レセプター-リガンドペア、生物間相互作用、バイオマーカーなど 5,001
マウス 5K Pan Tissue & Pathways Panel 生物学的パスウェイ、レセプター-リガンドペア、生物間相互作用、バイオマーカーなど 5,006

※ターゲットリストは創薬・受託サービス部(jutaku_gr@cosmobio.co.jp)までお問い合わせください。

解析データ例

解析データ例 Total Counts. Genes by Count. Leiden.
図1. UMAP plot


図2. Gene X Cell Heatmap

サンプルレポート

サンプルレポートはこちらをご参照ください。

価格および納期

Xenium In Situ Panel 受託解析サービス
使用機種 Xenium In Situ Analyzer
対象生物種 ヒト、マウス
対象サンプル FFPE検体、FF検体※
データ解析 Dimension reduction、UMAP/tSNE、Moran's I score、発現差、細胞近接、Spatial Scatter Plot、Cell Heatmap
価格 お問い合わせ
納期 6〜8週間
納品物 Raw dataおよび解析データ一式

※切片を貼り付けたXenium専用スライドの状態でお送りいただく必要がございます。

サンプルの送付方法

以下の宛先まで着払いにてご送付ください。
発送の際はオーダーシート(印刷物)の同梱をお願いいたします。
なお、サンプルの紛失を避けるために事前に(jutaku_gr@cosmobio.co.jp)までご送付日、配送業者名、お問合せ番号をお知らせください。

サンプル送付先 〒135-0064
東京都江東区青海2-4-32 タイム24ビル16F
(株)マクロジェン・ジャパン NGSサービス係行き
TEL: 03-5962-1124

ご提供いただくサンプルについては、インフォームド・コンセントが取得されており、かつドナーの個人情報が特定できないように匿名化されたものである必要がございます。

お見積り・ご注文方法

お見積り依頼・ご注文の際は下記のオーダーシートに必要事項をご入力いただき、E-mail にてご送付をお願いいたします。ご注文の際はお取引のある代理店様に品番、数量をご指定の上ご発注ください。またサンプルをご送付いただく際は本オーダーシートをサンプルに同封してください。

受託サービスに関するご相談
メールでの問い合わせ
jutaku_gr@cosmobio.co.jp
電話でのお問い合わせ
03-5632-9615
受付時間:平日(9:00~17:30)

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

お問い合わせ

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