マクロジェンでは、Agilent および Affymetrix(現:Thermo Fisher Scientific社) のシステムを用いた遺伝子発現解析サービスを提供します。また、バイオインフォマティクス分野に精通したスタッフによる高品質なデータを提供します。
Agilent および Affymetrix社製のマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析サービス マイクロアレイ受託解析サービス:遺伝子発現解析
マクロジェン社:Agilent および Affymetrix社製のマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析サービス
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各社アレイの特長
Agilent | affimetrix | |
対応可能な種 | Human, Mouse, Rat, Arabidopsis, Cotton, Zebra Fish, etc | Human, Mouse, Rat, Arabidopsis, etc |
アレイにスポットされたオリゴの長さ | 60 mer | 25 mer |
特長 |
|
|
ご送付いただくRNAのQC基準
アプリケーション | プラット フォーム | サンプル タイプ | 純度 (A260/280) | 純度 (A260/230) | 濃度 (ng/uL) | 総量 (ug) | rRNA比 | RIN | その他 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
mRNA Expression | Agilent GeneExpression | トータルRNA | >1.5 | >1.0 | >70ng/uL | >0.1 ug | >1.0 | >7.0 | without DNA contamination without Trizol contamination |
Affymetrix GeneExpression | >34ng/uL | ||||||||
miRNA Expression | Agilent miRNA | トータルRNA | >1.5 | >1.0 | >50ng/uL | >0.1 ug | >1.0 | >7.0 | Vsible small RNA peak |
Affymetrix miRNA | トータルRNA または スモールRNA |
>17ng/uL | >0.13 ug |
解析内容
● 発現量比較解析
- 標準的な統計解析(Fold change, 群平均, SD 等) A
- 異なる発現遺伝子の同定(T-test, LPE test, ANOVA 等)
- 多重検定補正(FDR, Bonferroni 等)
- 発現変動遺伝子(DEG)のクラスタリング分析
(階層的クラスタリング、k-平均法等)
● 機能解析
- Gene Ontology アノテーション
- Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)
● カスタム解析
- 統合解析
(mRNA-miRNA, methylation-mRNA, mRNA-CNV 等) - 追加プロッティング、アノテーション
*KEGG 解析は別途費用がかかりますので、ご希望の場合はお問い合わせください。
納品データ例
■ Agilent 社 SurePrint G3 Mouse GE 8 x 60k v2 Microarray
■ Affimetrix社 GeneChip™ Human Gene 2.0 ST Array
価格と納期
○ 参考価格
※1 解析を含まないサービスのご注文の際は、品番末尾に「W」を入れて下さい(例: MAG-0001W)
下記の金額は全て税抜価格です。
プラットフォーム | 最低注文 サンプル数 |
希望販売価格 | 品番※1 | |||
---|---|---|---|---|---|---|
解析含む | 解析含まない | |||||
Agilent Gene Expression |
Human |
SurePrint G3 Human Gene Expression 8 x 60k v3 Microarray |
8 |
¥497,000 |
¥471,000 |
MAG-0001 |
Mouse |
SurePrint G3 Mouse GE 8 x 60k v2 Microarray |
8 |
¥497,000 |
¥471,000 |
MAG-0002 |
|
Rat |
SurePrint G3 Rat GE 8 x 60k Microarray |
8 |
¥497,000 |
¥471,000 |
MAG-0003 |
|
Other Organisms |
Model Org/Non-Human GeneEx Microarrays 4 x 44k |
4 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0004 |
|
Custom |
SurePrint G3 Custom Gene Expression Microarray, 4 x 180k |
4 |
¥323,000 |
¥310,000 |
MAG-0005 |
|
SurePrint HD Custom Gene Expression Microarray, 4 x 44k |
4 |
¥277,000 |
¥264,000 |
MAG-0006 |
||
SurePrint G3 Custom Gene Expression Microarray, 8 x 60k |
8 |
¥497,000 |
¥471,000 |
MAG-0007 |
||
SurePrint HD Custom Gene Expression Microarray, 8 x 15k |
8 |
¥369,000 |
¥343,000 |
MAG-0008 |
||
Affymetrix Clariom Array |
Human |
Clariom S Array |
2 |
¥120,000 |
¥114,000 |
MAG-0200-H |
Mouse |
Clariom S Array |
2 |
¥120,000 |
¥114,000 |
MAG-0200-M |
|
Rat |
Clariom S Array |
2 |
¥120,000 |
¥114,000 |
MAG-0200-R |
|
Human, Mouse, Rat |
Clariom D Array |
2 |
¥191,000 |
¥186,000 |
MAG-0201 |
|
Affymetrix 3' IVT |
Human |
PrimeView™ Human Gene Expression Array |
10 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0046 |
Human Genome U133 Plus 2.0 Array |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0047 |
||
Mouse |
Mouse Genome 430 2.0 Array |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0048 |
|
Rat |
Rat Genome 230 2.0 Array |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0049 |
|
Human (FFPE) |
Almac Xcel Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0050 |
|
Arabidopsis |
Arabidopsis |
5 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0051 |
|
Barley |
Barley |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0053 |
|
Bovine |
Bovine |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0054 |
|
C. elegans |
C. elegans |
5 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0055 |
|
Canine |
Canine 2.0 |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0056 |
|
Chicken |
Chicken |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0057 |
|
Citrus |
Citrus |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0058 |
|
Cotton |
Cotton |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0059 |
|
Drosophila |
Drosophila 2.0 |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0060 |
|
E.coli |
E.coli 2.0 |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0061 |
|
Maize |
Maize |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0062 |
|
Medicago |
Medicago |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0063 |
|
P.aeruginosa |
P.aeruginosa |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0064 |
|
Plasmodium/Anopheles |
Plasmodium/Anopheles |
5 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0065 |
|
Poplar |
Poplar |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0066 |
|
Porcine |
Porcine |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0067 |
|
Rhesus Macaque |
Rhesus Macaque |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0068 |
|
Rice |
Rice |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0069 |
|
S.aureus |
S.aureus(Staphylococcus aureus) |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0070 |
|
Soybean |
Soybean |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0071 |
|
Sugar |
Sugar |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0072 |
|
Tomato |
Tomato |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0073 |
|
Vitis |
Vitis |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0074 |
|
Wheat |
Wheat |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0075 |
|
Xenopus laevis |
Xenopus laevis 2.0 |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0076 |
|
Xenopus tropicalis |
Xenopus tropicalis |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0077 |
|
Yeast |
Yeast 2.0 |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0078 |
|
Affymetrix Gene ST |
Human |
Human Gene 2.0 ST Array |
1 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0081 |
Mouse |
Mouse Gene 2.0 ST Array (6array) |
1 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0082 |
|
Rat |
Rat Gene 2.0 ST Array |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0083 |
|
Human |
Human Exon 1.0 ST Array |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0084 |
|
Mouse |
Mouse Exon 1.0 ST Array |
2 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0085 |
|
CHO |
CHO Gene 2.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0086 |
|
Arabidopsis |
Arabidopsis Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0087 |
|
Bovine |
Bovine Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0088 |
|
C. elegans |
C. elegans Gene 1.0 ST Arrray |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0089 |
|
Canine |
Canine Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0090 |
|
Chicken |
Chicken Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0091 |
|
Cynomolgus |
Cynomolgus Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0092 |
|
Cynomolgus + Rhesus |
Cynomolgus + Rhesus Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0093 |
|
Rhesus |
Rhesus Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0094 |
|
Drosophila |
Drosophila Gene 1.0 ST Arrray |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0095 |
|
Equine |
Equine Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0096 |
|
Feline |
Feline Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0097 |
|
Guinea Pig |
Guinea Pig Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0098 |
|
Marmoset |
Marmoset Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0099 |
|
Medicago |
Medicago Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0100 |
|
Ovine |
Ovine Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0101 |
|
Porcine |
Porcine Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0102 |
|
Rabbit |
Rabbit Gene 1.0 ST Array |
6 |
ご照会 |
ご照会 |
MAG-0103 |
○ 標準納期
サンプルが Macrogen 社に到着しサンプル QC 完了後の標準納期は下記になります。
メーカー | 標準納期 | |
---|---|---|
解析含む | 解析含まない | |
Agilent 社 | 約 4 週間 | 約 3 週間 |
Affymetrix 社 | 約 4 週間 | 約 3 週間 |
*繁忙期にチップの在庫がない場合は上記よりも長く納期がかかります。
お見積依頼・ご注文方法
お見積り依頼・ご注文の際は下記のオーダーシートに必要事項をご入力いただき、FAX か Email にて創薬・受託サービス部宛にご送付をお願いいたします。ご注文の際はお取引のある代理店様に品番、数量をご指定の上ご発注下さい。またサンプルをご送付いただく際は本オーダーシートをサンプルに同封して下さい。
オーダーシート 送付先 |
コスモ・バイオ株式会社 創薬・受託サービス部 FAX: 03-5632-9614 E-mail: jutaku_gr@cosmobio.co.jp |
---|
ご提供いただくサンプルについては、インフォームド・コンセントが取得されており、かつドナーの個人情報が特定できないように匿名化されたものである必要がございます。
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商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。
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