記事ID ： 47428

超高感度なクロマチンプロファイリングをシングルセルレベルで実現 Single-Cell CUT&Tag（ scCUT&Tag ）アッセイキット

メーカー名：Epigenome Technologies

Epigenome Technologies 社の scCUT&Tag アッセイキットは、抗体指向性 Tn5 タグメンテーションを用いて、特定のヒストン修飾や転写因子の結合部位をシングルセルレベルで高感度に検出する革新的なキットです。
従来の scATAC-seq が示すオープンクロマチン領域の間接的な推測にとどまらず、DNA に結合する特定の制御タンパク質の存在や修飾状態を直接捉えることで、細胞運命の決定や疾患プロセスにおける高解像度なエピゲノム解析が可能となり、細胞集団内の不均一性(ヘテロジェネティ）の解析を実現します。

特長

優れたデータ品質と高いシグナル/ノイズ（ S/N ）比
細胞あたりのリード数が少ない場合でもバックグラウンドノイズを劇的に抑え、バルク解析のデータと高い相関（相関係数 > 0.89）を示します。
多様なプラットフォームに対応
10x Genomics 社の Chromium^®、BD 社の Rhapsody™、Illumina 社の PIPseq™ などの主要なシングルセルプラットフォームに対応するキットを展開しています。
ソート不要の簡便なワークフロー
FACS などの高額な細胞分取装置を必須とせず、新鮮・凍結組織、PBMC、培養細胞、オルガノイド、脳組織など、様々なサンプルから調製した核や細胞からアッセイを開始できます。
幅広い標的プロファイリング
検証済みの各種抗体を使用でき、遺伝子の転写（活性化）を促進するヒストン修飾マーカー（ H3K27ac、H3K4me3 等）や抑制性ヒストン修飾マーカー（ H3K27me3 等）のみならず、転写因子（ TF ）やポリコーム複合体（ PRC2 ）にも再現性高く適用可能です。

ワークフロー

核の調整
細胞または組織サンプルから核を単離調整します。
抗体反応
解析ターゲットであるヒストン修飾または結合タンパク質に対する特異的抗体を反応させます。
TAG 酵素（ pA-Tn5 ）反応
抗体結合部位に TAG 酵素を局在化させ、標的領域の近傍 DNA をタグメンテーションし、アダプター配列を導入します。
シングルセル化＆バーコード付加
10x Genomics 社の Chromium^®、BD 社の Rhapsody™ 等のプラットフォームにより、シングルセル化し、セルバーコードを付加します。
ライブラリ調製＆ NGS シーケンス
調製したシーケンスライブラリを用いて次世代シーケンサー（ NGS ）で網羅解析を行います。

データ例

scCUT&Tagによる細胞タイプ別のヘテロジェネティシティ（多様性）の可視化 — **図 2：scCUT&Tag による細胞タイプ別のヘテロジェネティシティ（多様性）の可視化** 免疫細胞の細胞タイプごとの H3K4me1 修飾（エンハンサー領域の活性化マーカー）のゲノムトラックを示しており、バルク解析データ（最下部のグレー）と比較し、特定の細胞系統（例：T 細胞系や B 細胞系）においてどの制御領域が機能しているかが 1 細胞由来の解析により明らかになった。

キット構成品

構成品	用途
・Permeabilizer	抗体・TAG 酵素反応用
・Stabilizer	抗体・TAG 酵素反応用
・TAG Enzyme	抗体・TAG 酵素反応用
・Incubation Buffer	抗体・TAG 酵素反応用
・Activator	Tagmentation 反応用
・Quench Buffer	Tagmentation 反応停止用

※適用のプラットフォームにより、一部の構成品が異なる場合がございます。

商品情報

品名	プラットフォーム	品番	包装	希望販売価格
Droplet Single-Cell Cut&Tag Kit - 8rxn	10x Chromium	SCT8101	1KIT（8rxn）	¥ 500,000
BD Rhapsody scCUT&Tag - 8rxn	BD Rhapsody	BCT8101	1KIT（8rxn）	¥ 500,000
Emulsion Single-Cell Cut&Tag Kit - 4rxn	Illumina PIPseq	ECT4101	1KIT（4rxn）	¥ 750,000