記事ID ： 43394

染色体領域6q22.1が関与する転座を検出するためのハイブリダイゼーションプローブ ZytoLight® SPEC ROS1 Dual Color Break Apart Probe

メーカー名：ZytoVision GmbH

ZytoLight® SPEC ROS1 Dual Color Break Apart Probeは、受容体型チロシンキナーゼ遺伝子であるROS癌原遺伝子1（ROS1、MCF3としても知られる）を含む染色体6q22.1が関与する転座を検出するためのプローブです。

ZytoLight® FISH プローブシリーズ詳細

背景

ROS1遺伝子は6q22.1に位置し、受容体型チロシンキナーゼをコードしています。神経膠芽腫、胆菅細胞癌、および非小細胞肺癌（NSCLC）においてROS1に影響を及ぼす転座が検出されています。
NSCLCでは複数のROS1転座パートナーが検出されており、不定に切断されたPM3、SDC4、SLC34A2、CD74、EZR、LRIG3とROS1のキナーゼドメインとが融合体を形成しています。GOPCもまた、NSCLCにおいてROS1に融合することが確認されています。GOPC-ROS1融合体は6q22.1上のおよそ240kbにおよぶ中間部欠損により生じます。
ROS1転位はNSCLCの分子サブセットを明確化すると考えられており、ALK転位NSCLCを有する患者において認められたものと類似した臨床的特徴を有します。活性化ROS1転位を有するNSCLC患者においてROS1キナーゼ阻害剤投与が非常に効果的な治療戦略となる可能性が示唆されています。

特長

高い選択性と特異性

ZytoLight® FISH プローブは、ZytoLight® Direct Label System II を使用して直接標識したプローブで、これによりシグナル強度が改良されています。ZytoLight® の単一プローブ（SPEC）は、全て ZytoLight® Repeat Subtraction Technique により加工されており、特異性の向上や低バックグラウンドを得ることができます。繰り返し配列を更にブロッキングする必要はありません。

使用例

（A）

（B）

（C）

（D）

図1. プローブの概要
（A）第6染色体のハイブリダイゼーション部位
（B）SPEC ROS1 プローブマップ（not to scale）
SPEC ROS1 Dual Color Break Apart Probeは、6q22.1バンドに結合する2種の直接標識されたプローブが混合されています。橙色蛍光色素が直接標識されたプローブは6q22.1のROS1切断点領域の遠位にハイブリダイズし、緑色蛍光色素が直接標識されたプローブはその近位にハイブリダイズします。
（C） SPEC ROS1 Dual Color Break Apart Probeを用いて検出した正常間期細胞
（D）ROS1を含む6q22.1座位に影響を及ぼす転座を有するNSCLC細胞株のパラフィン包埋切片
橙/緑色融合蛍光、橙色蛍光、および緑色蛍光が検出された

参考文献

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Takeuchi K, et al. (2012) Nat Med 18: 378-81.

ZytoLight® SPEC ROS1 Dual Color Break Apart Probe

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