CancerSeq™ Plus ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)腫瘍組織は、CNV(コピー数多形)・SNP(一塩基多型)・既知の癌遺伝子ホットスポット領域の挿入/欠失について、プレスクリーニングされています。本組織は、アッセイの検証・ジェノタイピング(遺伝子型判定)・新しい疾患関連変異の同定に最適です。
FFPE組織からゲノムDNAを抽出し、ArcherDx社の VariantPlex Solid Tumor Panel を使用して、次世代シーケンシングによりスクリーニングしています。67種類の癌関連遺伝子の CNV・SNP・挿入/欠失についての詳細をご提供しております。
プレスクリーニングした組織を、切片厚さ7um-10umで切り出し、スライドに張り付けず、エッペンチューブに入れた状態にして販売しております(1切片/1チューブで計5本)。
CNV変異については、コントロールとして正常組織を使用し、コピー数多型の検証に厳しい基準を採用しています。記載した以外のCNVを含むサンプルをご用意できる場合がありますので、お問い合わせください。
67種類の癌遺伝子
ABL1 | CDK4 | EZH2 | H3F3A | MAP2K1 | PDGFRA | SMARCB1 |
AKT1 | CDKN2A | FBXW7 | HNF1A | MDM2 | PIK3CA | SMO |
ALK | CSF1R | FGFR1 | HRAS | MET | PIK3R1 | SRC |
APC | CTNNB1 | FGFR2 | IDH1 | MLH1 | PTEN | STK11 |
ATM | DDR2 | FGFR3 | IDH2 | MPL | PTPN11 | TERT |
AURKA | EGFR | FLT3 | JAK2 | MYC | RB1 | TP53 |
BRAF | ERBB2 | FOXL2 | JAK3 | MYCN | RET | VHL |
CCND1 | ERBB3 | GNA11 | KDR | NOTCH1 | RHOA | |
CCNE1 | ERBB4 | GNAQ | KIT | NPM1 | ROS1 | |
CDH1 | ESR1 | GNAS | KRAS | NRAS | SMAD4 |