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カスタムプール型レンチウイルスbar-code化shRNAライブラリーの遺伝子スクリーニングサービスハイスループットRNAi遺伝子スクリーニングサービス HT RNAi Genetic Screens
Cellecta社：カスタムプール型レンチウイルスbar-code化shRNAライブラリーの遺伝子スクリーニングサービス

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メーカー名：Cellecta, Inc.（略号：CLT）

Cellecta（CLT）社ではデザイン＆検証済みまたは非検証のカスタムプール型レンチウイルスbar-code化shRNAライブラリーを用いたハイスループットRNAi遺伝子スクリーニングサービスをご提供しています。お客様のニーズに沿ったカスタムスクリーニングサービスを目指しており、カスタムプール型shRNAライブラリー、ライブラリー導入細胞、サブライブラリー、個別のベクター構築、生データ、バイオインフォマティックスを駆使した解析やシグナル経路解析など、さまざまなサービスをご提供しています。最も人気の高いカスタムサービスのひとつに、実験ステップの一部もしくは全てをCellecta（CLT）社にて行うものがあります。Cellecta（CLT）社のカスタムサービスの概要は「ハイスループットRNAiスクリーニング技術」のページをご参照ください。また、ハイスループットRNAiスクリーニングの一例として、TGF-βならびにFAS誘導型HeLa細胞の実験データをご紹介しています。

オプションA （品番： CANA-SQ）

本サービスは、CLT 社ライブラリーを使用してスクリーニングを行った細胞から抽出したDNAをご提供いただき、DNA増幅、次世代シークエンシングデータ取得・解析を行い、shRNA 配列のリストをご提供するものです。サンプルは、フェノール- クロロホルム耐性の15-mL サイズのポリプロピレン遠心用チューブに保管し、黒色または青色のアルコール耐性マーカーで各チューブにサンプル名をご記入いただき、チューブラベルとサンプル詳細とを記載したリストと共にドライアイス便でご発送ください。

**受託サービスの流れ**
1.	お申込書類記載
2.	CLT 社へスクリーニング細胞から抽出したゲノムDNA（品番 CANA-SQD）の送付 *オプションでゲノムDNA抽出を追加可能
3.	CLT 社にて実験・解析作業
3.	各サンプルからゲノムDNA 抽出する（オプション）抽出したゲノムDNA のバーコードを増幅後、ハイスループットシークエンシング調製する各サンプルの増幅されたバーコードをシークエンス（＞ 20 x 10⁶ リード）各バーコードをshRNA 配列と照合させ、解析する (ア) 各shRNA 配列の相対存在量の算出（バーコード/shRNA 数） (イ) サンプル間の差異計算（お客様より何れのサンプル間を比較するという情報をいただいた場合に限ります）報告書を作成
4.	コスモ・バイオより報告書（電子データ）を納品

オプションB（品番： CRGS-X）

本サービスは、CLT 社がプール型バーコード化shRNA ライブラリーを使用したスクリーニングの全作業を実施するサービスです。必要な作業のみを受託することも可能ですのでお問合せください。

**受託サービスの流れ**
1.	お申込書類記載
2.	実験内容の打合せ
3.	お客様のご希望の遺伝子リストにてカスタムプール型レンチウイルスshRNAライブラリーをデザインし構築（2-3ヶ月）、デザイン済みshRNAライブラリーを指定
4.	必要に応じてお客様独自のRNAi スクリーニング実験に適したレポーター細胞株を構築します。（3-4ヶ月、3.の作業と並行作製）
5.	お客様のターゲット細胞へプール型 shRNA ライブラリーをトランスダクション、特異的な表現型や細胞応答性をもとに機能テストを実施（1-2ヶ月）
6.	スクリーニングデータ解析：CLT 社にて下記作業を行います。（1-2ヶ月）ゲノムDNA 抽出 shRNA 特異的バーコード配列の増幅ハイスループット（次世代）シークエンシングおよび統計解析報告書作成
7.	コスモ・バイオより報告書（電子データ）を納品

本オプションでは、サンプル調製からハイスループット（次世代）シークエンシング、データ統計解析までの一連の作業を、最低７サンプルから承ります（Cellecta（CLT）社推奨：３回繰り返し実験を２セット、コントロール１つ）。

オプションBは、一連のハイスループットRNAiスクリーニングをご提供するサービスですが、プロジェクトの完了には4～8ヶ月程度のお時間を頂きます（オプションにより変動）。また、RNAiスクリーニングの複雑度により価格が異なります。Cellecta（CLT）社における作業が少ない場合やスクリーニング数が多い場合、より低い単価でお承り致します。

Cellecta（CLT）社ではさらに下流の実験サービスもご提供しています。

シグナル経路解析： 同定した各shRNAクローンが関与するシグナル経路を解析
デジタル遺伝子発現プロファイリングサービス：抽出したRNAサンプルを使用して実施
ライブラリースクリーニング結果検証サービス：　ライブラリーを用いた1次スクリーニング結果に基づいてサブライブラリーを構築し、2次RNAiスクリーニングを実施
shRNAコンストラクト構築サービス：スクリーニング結果の検証用に各shRNAコンストラクトを構築

サービスお申込書

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
NGS of DNA from Genetic Screen (screening done with Cellecta or GeCKO Library)	CLT	CANA-SQD	1 SERV.	お問い合わせ
NGS of DNA from Genetic Screen (screening done with Cellecta or GeCKO Library), Academic	CLT	CANA-SQD-A	1 SERV.	お問い合わせ
DNA isolation from Cell peletts for Sequencing	CLT	CANA-DNA	1 SERV.	お問い合わせ
RNAi Functional Genetic Screens with Pooled shRNA Libraries	CLT	CRGS-X	1 SERV.	お問い合わせ

DECIPHER ライブラリー

■ 非営利団体ユーザー様

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
DECIPHER Human Module 1, Pathway Targets (5,043 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), Academic user	CLT	DHPAC-M1-PA	1 EACH [200 ug]	お問い合わせ
DECIPHER Human Module 2, Disease Targets (5,412 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), Academic user	CLT	DHDAC-M2-PA	1 EACH [200 ug]	お問い合わせ
DECIPHER Human Module 3, Cell Surface, Extracellular, and DNA Binding Targets (4,922 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), Academic user	CLT	DHCSC-M3-PA	1 EACH [200 ug]	お問い合わせ
DECIPHER Mouse Module 1, Pathway Targets (4,625 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), Academic user	CLT	DMPAC-M1V2-PA	1 EACH [200 ug]	お問い合わせ
DECIPHER Mouse Module 2, Disease Targets (4,520 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), Academic user	CLT	DMDAC-M2V2-PA	1 EACH [200 ug]	お問い合わせ

■ 営利団体ユーザー様

品名	メーカー	品番	包装	希望販売価格
DECIPHER Human Module 3, Cell Surface, Extracellular, and DNA Binding Targets (4,922 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), for corporate user	CLT	DHCSC-M3-PC	1 EACH [200 ug]	販売終了
DECIPHER Human Module 2, Disease Targets (5,412 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), for corporate user	CLT	DHDAC-M2-PC	1 EACH [200 ug]	販売終了
DECIPHER Human Module 1, Pathway Targets (5,043 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), for corporate user	CLT	DHPAC-M1-PC	1 EACH [200 ug]	販売終了
DECIPHER Mouse Module 2, Disease Targets (4,520 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), for corporate user	CLT	DMDAC-M2V2-PC	1 EACH [200 ug]	お問い合わせ
DECIPHER Mouse Module 1, Pathway Targets (4,625 targets, 27,500 shRNAs) (plasmid), for corporate user	CLT	DMPAC-M1V2-PC	1 EACH [200 ug]	お問い合わせ