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記事ID : 11831
研究用

生細胞内の微小環境下における、リード化合物の標的タンパク質への結合能を評価 InCELL Hunter™ Intracellular Binding Assay
DiscoverX社:リード化合物と標的タンパク質の結合を測定可能な細胞ベースアッセイ

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創薬研究ツール
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背景

細胞内標的タンパク質に対する化合物の有効性評価

創薬研究において、リード化合物が細胞膜の透過性を持っているか、また、細胞内微小環境下において標的タンパク質とどの様に結合しているかを判定することは、リード化合物の構造探索と最適化の点において重要な意味を持っています。DiscoverX社のInCELL Hunter技術は、生細胞内における標的タンパク質の安定性の変化を検出することにより、Hit-to-LeadからLead Optimizationまで様々な研究用途において、リード化合物の細胞膜透過性を含めた標的タンパク質への結合能の評価を可能とします。

幅広い標的タンパク質に対応可能な柔軟なセルベースアッセイ

InCELL Hunter™プラットフォームは下表のターゲットクラスを始め、様々な細胞内タンパク質を評価することが可能です。

ターゲットクラス 製品 カスタム対応
ブロモドメインタンパク質
メチルトランスフェラーゼ
セリン/スレオニンキナーゼ
チロシンキナーゼ
タンパク質間相互作用
ユビキチン化酵素 開発中
脱ユビキチン化酵素 開発中
チトクロームP450 開発中

 

原理

本アッセイでは、DiscoverX社独自の技術;Enzyme Fragment Complementation (EFC)技術を応用し、細胞内における標的タンパク質量を検出します。酵素β-ガラクトシダーゼをEnzyme donor (enhanced ProLabel; ePL) とEnzyme acceptor (EA)とに2分割し、ePLと標的タンパク質の融合タンパク質を細胞内に発現導入します。この細胞にEAおよびβ-ガラクトシダーゼ基質を含む専用の検出用試薬を添加すると、ePLとEAは相補的に結合し活性型β-ガラクトシダーゼを形成するので、β-ガラクトシダーゼ基質の化学発光量シグナルを検出することにより標的タンパク質量を定量することが可能となります(Fig.1)。

EFC技術によるタンパク質安定性の評価
Fig1. EFC技術によるタンパク質安定性の評価

細胞内における標的タンパク質量は、タンパク質の発現と分解のバランスにより、定常状態に保たれます。細胞膜を透過可能なリード化合物は、細胞内において標的タンパク質と結合することにより、標的タンパク質の半減期を変化させます(Fig.2)。細胞あたりのePL融合タンパク質量の増減を検出することにより、細胞内微小環境下におけるリード化合物の標的タンパク質への結合や作用を評価することが可能となります。

リード化合物の添加によるタンパク質半減期の変化
Fig2. リード化合物の添加によるタンパク質半減期の変化

特長

  • 標的タンパク質の生理的機能に影響しないePLタグを利用
  • High-throughput(HTS)対応かつ簡便なホモジニアスアッセイプロトコール(下記「プロトコール」参照)
  • 生細胞内における化合物の有効性を評価(Fig.3)
  • 化合物の特異性および濃度依存的結合を評価可能(Fig.4)
  • ATP結合部位やアロステリック結合部位などの多様なタンパク質部位に対する化合物の結合を評価(Fig.5)
  • 未構築ターゲットの細胞株をカスタムで作成可能

InCELL Hunterによるアッセイデータ例
Fig.3 InCELL Hunterによるアッセイデータ例

化合物の標的タンパク質に対する特異性および濃度依存的結合の検証
Fig.4 化合物の標的タンパク質に対する特異性および濃度依存的結合の検証

ATP結合部位認識化合物およびアロステリック部位認識化合物の評価
Fig.5 ATP結合部位認識化合物およびアロステリック部位認識化合物の評価

プロトコール

  1. 細胞を播種(37℃)
  2. 被験物質溶液を加える(最適時間反応、37℃)
  3. 検出試薬を加える (遮光で30分、室温)
  4. 化学発光シグナルを検出(検出機器:Viewlux, Victor, Turnerなど)

プロトコール

ターゲットリスト

TARGET PRODUCT DESCRIPTION Pool 細胞株 キット サービス
カスタム
InCELL Hunter Compound Binding Assays - Bromodomain
ATAD2B InCELL Hunter™ HEK 293 ATAD2B Bromodomain Cell Pool      
BAZ1A InCELL Hunter™ HEK 293 BAZ1A Bromodomain Cell Pool      
BAZ1B InCELL Hunter™ HEK 293 BAZ1B Bromodomain Cell Pool      
BAZ2A InCELL Hunter™ HEK 293 BAZ2A Bromodomain Cell Pool      
BRD2(1) InCELL Hunter™ HEK 293 BRD2(1) Bromodomain Cell Line  
BRD2(1,2) InCELL Hunter™ HEK 293 BRD2(1,2) Bromodomain Cell Line      
BRD3(1) InCELL Hunter™ HEK 293 BRD3(1) Bromodomain Cell Line    
BRD3(1,2) InCELL Hunter™ HEK 293 BRD3(1,2) Bromodomain Cell Line  
BRD4(1) InCELL Hunter™ HEK 293 BRD4(1) Bromodomain Cell Line  
BRD7 InCELL Hunter™ HEK 293 BRD7 Bromodomain Cell Pool      
BRDT(1) InCELL Hunter™ HEK 293 BRDT(1) Bromodomain Cell Line    
BRDT(1,2) InCELL Hunter™ HEK 293 BRDT(1,2) Bromodomain Cell Line  
BRPF3 InCELL Hunter™ A549 BRPF3 Bromodomain Cell Pool      
BRWD3(2) InCELL Hunter™ HEK 293 BRWD3(2) Bromodomain Cell Pool      
CECR2 InCELL Hunter™ HEK 293 CECR2 Bromodomain Cell Pool      
FALZ InCELL Hunter™ HEK 293 FALZ Bromodomain Cell Pool      
GCN5L2 InCELL Hunter™ A549 GCN5L2 Bromodomain Cell Pool      
MLL InCELL Hunter™ HEK 293 MLL Bromodomain Cell Pool      
PB1(1) InCELL Hunter™ A549 PB1(1) Bromodomain Cell Pool      
PB1(2) InCELL Hunter™ HEK 293 PB1(2) Bromodomain Cell Pool      
PCAF InCELL Hunter™ HEK 293 PCAF Bromodomain Cell Pool      
PHIP(1) InCELL Hunter™ HEK 293 PHIP(1) Bromodomain Cell Pool      
PHIP(2) InCELL Hunter™ HEK 293 PHIP(2) Bromodomain Cell Pool      
PRKCBP1 InCELL Hunter™ HEK 293 PRKCBP1 Bromodomain Cell Pool      
SMARCA4 InCELL Hunter™ HEK 293 SMARCA4 Bromodomain Cell Line      
SP110 InCELL Hunter™ HEK 293 SP110 Bromodomain Cell Pool      
SP140 InCELL Hunter™ HEK 293 SP140 Bromodomain Cell Pool      
TAF1(1,2) InCELL Hunter™ HEK 293 TAF1(1,2) Bromodomain Cell Pool      
TAF1L(1) InCELL Hunter™ HEK 293 TAF1L(1) Bromodomain Cell Pool      
TAF1L(2) InCELL Hunter™ HEK 293 TAF1L(2) Bromodomain Cell Line      
TRIM33 InCELL Hunter™ HEK 293 TRIM33 Bromodomain Cell Pool      
WDR9(1) InCELL Hunter™ HEK 293 WDR9(1) Bromodomain Cell Pool      
WDR9(2) InCELL Hunter™ HEK 293 WDR9(2) Bromodomain Cell Pool      
WDR9(2) InCELL Hunter™ HEK 293 WDR9(2) Bromodomain Cell Pool      
InCELL Hunter Compound Binding Assays - Kinase
BLK InCELL Hunter™ HEK 293 BLK Cell Line    
BTK InCELL Hunter™ A549 BTK Cell Line    
CLK1 InCELL Hunter™ HEK 293 CLK1 Cell Line    
CLK2 InCELL Hunter™ A549 CLK2 Cell Line    
CSF1R InCELL Hunter™ A549 CSF1R Cell Line    
CSNK1D InCELL Hunter™ A549 CSNK1D Cell Line    
FGR InCELL Hunter™ HEK 293 FGR Cell Line      
HCK InCELL Hunter™ A549 HCK Cell Line    
MEK1 InCELL Hunter™ A549 MEK1 Cell Line    
PI3Kδ InCELL Hunter™ HEK 293 PI3Kδ Cell Line      
PIM1 InCELL Hunter™ A549 PIM1 Cell Line    
PYK2 InCELL Hunter™ A549 PYK2 Cell Line    
RIPK2 InCELL Hunter™ HEK 293 RIPK2 Cell Line    
SIK1 InCELL Hunter™ A549 SIK1 Cell Line    
InCELL Hunter Compound Binding Assays - Methyltransferase
G9a InCELL Hunter™ A549 G9a Methyltransferase Cell Line  
GLP InCELL Hunter™ A549 GLP Methyltransferase Cell Line  
PRMT3 InCELL Hunter™ A549 PRMT3 Methyltransferase Cell Line      
InCELL Hunter Protein Binding Assays
Bcl2-Bax InCELL Hunter™ U2OS Bcl2-Bax Cell Line      
Bcl2-Bim InCELL Hunter™ U2OS Bcl2-Bim Cell Line   Inquire
Bcl2L1-Bax InCELL Hunter™ U2OS Bcl2L1-Bax Cell Line   Inquire
Bcl2L1-Bim InCELL Hunter™ U2OS Bcl2L1-Bim Cell Line      

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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