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相分離過程としての方向感知のシミュレーション環境

A Simulation Environment for Directional Sensing as a Phase Separation Process

Protocols

Sci. STKE, 20 March 2007 Vol. 2007, Issue 378, p. pl1
[DOI: 10.1126/stke.3782007pl1]

Antonio de Candia1, Andrea Gamba2*, Fausto Cavalli3, Antonio Coniglio1, Stefano Di Talia4, Federico Bussolino5, and Guido Serini5*

1Department of Physical Sciences, Universita di Napoli "Federico II," Istituto Nazionale di Fisica della Materia, and Istituto Nazionale di Fisica Nucleare, Unita di Napoli, 80126 Napoli, Italy.
2Department of Mathematics, Politecnico di Torino, Corso Duca degli Abruzzi 24, 10129 Torino, and Istituto Nazionale di Fisica Nucleare, Unita di Torino, Via Giuria 1, 10125 Torino, Italy.
3Department of Mathematics, Universita degli Studi di Milano, Via Saldini 50, 20133 Milano, Italy.
4Laboratory of Mathematical Physics, The Rockefeller University, 1230 York Avenue, New York, NY 10021, USA.
5Department of Oncological Sciences and Division of Molecular Angiogenesis, IRCC, Institute for Cancer Research and Treatment, University of Torino School of Medicine, Strada Provinciale 142 Km 3.95, 10060 Candiolo (TO), Italy.
* Corresponding authors. E-mail: andrea.gamba@polito.it (A.G.); guido.serini@ircc.it (G.S.)

要約 : 真核細胞が細胞外誘導シグナルの空間的勾配に沿って移動する能力は、胚発生、組織再生、癌の進行にきわめて重要である。提案されている走化性モデルの1つは、ホスホイノシチドをベースにした相分離過程であり、これは走化性因子による刺激に際して細胞膜で発生し、真核細胞の方向性のある運動を誘発する。今回われわれは、in silicoでの走化性実験の実行と時空間解析を可能にする仮想細胞ソフトウェアを提供する。このソフトウェアでは、ユーザーが走化性因子源の数と位置だけでなく物理パラメータや化学パラメータを制御することができる。

A. de Candia, A. Gamba, F. Cavalli, A. Coniglio, S. Di Talia, F. Bussolino, G. Serini, A Simulation Environment for Directional Sensing as a Phase Separation Process. Sci. STKE 2007, pl1 (2007).

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