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- キャンサーパネルを使用して、がん遺伝子または腫瘍抑制遺伝子の全エキソンまたはホッ トスポット変異をHigh depthでシーケンシングを行えます。
- 多様なサンプル（Formalin-Fixed Paraffin-Embeded（FFPE）等）のDNAから解析可能 です。
記事ID ： 13597
Cancer Panel Sequencing キャンサーパネルシーケンシング
マクロジェン社：Cancer Panel Sequencing
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プラットフォーム
- HiSeq® /MiSeq® system
- Ion Torrent™/Proton
Cancer Panel
| Panel Description | Gene No. | Library | Panel Size | Platform | Starting Material | Features |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 |
50 | 207 amplicons | 25 kb | Ion Torrent™ | 10 ng | multiplex amplicon of 2,800 COSMIC "hot spot" regions from 50 genes, FFPE-compatible |
| Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel |
409 | 16,000 amplicons | 1.75 Mb | Ion Torrent™ | 40 ng | whole-exon coverage of 409 target genes, FFPE-compatible |
| TruSight™ Cancer Content Set |
94 | Target Enrichment | 255kb | MiSeq® /HiSeq® |
50 ng | targeting mutational"hot spots" in 94 genes, including 284 cancer -associated SNPs |
| TruSight™ Tumor Content Set |
26 | 175 amplicons | 21kb | MiSeq® | 300 ng | whole-exon coverage of 26 target genes, FFPE-compatible |
| TruSeq™ Amplicon Cancer Panel |
48 | 212 amplicons | 35 kb | MiSeq® | 250 ng | targeting mutational"hot spots" in cancer genes, FFPE-compatible |
| HaloPlex Cancer | 47 | Enrichment-amplicon（hybrid） | 10 kb | Ion Torrent™ /MiSeq® |
200 ng | targeting 1,205 mutational"hot spots" in cancer genes, FFPE-compatible |
データ解析
- Standard data analysis
- Mapping to the current reference genome
- Analysis of mapping statistics
- SNPs calling - Advanced data analysis
- Comparative analysis
参考価格及び標準納期
| 品番 | MAG-161204-2 | MAG-161204-1 |
|---|---|---|
| サービス項目 | Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 | Ion AmpliSeq™ Comprehensive Cancer Panel |
| 使用機種 | Ion PGM | Ion Proton |
| 必要サンプル量 | gDNA 1ug以上(分解なし、A260/A280は1.7以上)、10uL 以上 | gDNA 300 ng 以上、10 uL 以上 |
| データ解析 |
|
|
| 価格（税抜） | ご照会 | ご照会 |
| 納期（QC合格後） | 約 4〜6 週間 | 約 4〜6 週間 |
| 納品物 |
|
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| 納品データ例 |
サンプルのご送付方法
- サンプルは緩衝材と保冷剤を入れた発泡スチロール製保冷箱に入れ、サンプルがDNAの場合は保冷剤を、サンプルがRNAの場合はドライアイスを十分入れてご送付ください。チューブの破損やクロスコンタミネーションに十分ご注意下さい。
- チューブには必ずラベルや油性マジックでサンプル名を記載し、他のチューブと判別できるようにご注意下さい。
- ご送付は宅急便等で下記宛先まで着払いにてご送付ください。なお、サンプルの紛失を避けるために事前に jutaku_gr@cosmobio.co.jp までご送付日、配送業者名、お問合せ番号をお知らせください。
| サンプル 送付先 |
〒135-0064 東京都江東区青海2-4-32 タイム24ビル16F （株）マクロジェン・ジャパン NGSサービス係行き TEL: 03-5962-1124 |
|---|
ご提供いただくサンプルについては、インフォームド・コンセントが取得されており、かつドナーの個人情報が特定できないように匿名化されたものである必要がございます。
お見積り・ご注文方法
お見積り依頼・ご注文の際は下記のオーダーシートに必要事項をご入力いただき、Email にてご送付をお願いいたします。ご注文の際はお取引のある代理店様に品番、数量をご指定の上ご発注下さい。またサンプルをご送付いただく際は本オーダーシートをサンプルに同封して下さい。
| オーダーシート 送付先 |
コスモ・バイオ株式会社 創薬・受託サービス部 E-mail： jutaku_gr@cosmobio.co.jp |
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次世代シーケンシング受託サービス （MACROGEN）一覧
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- 全ゲノムシーケンシング (NovaSeq6000)
- PacBio® SequelⅡ ロングリードシーケンシング
- トランスクリプトームシーケンシング
- エピゲノムシーケンシング
- エクソーム/ターゲットシーケンシング
- キャンサーパネルシーケンシング
- メタゲノムシーケンシング
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商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。
