PacBio® ロングリードシーケンシング PacBio® Sequel Ⅱ ロングリードシーケンシング
マクロジェン社：PacBio RS II

PacBio® のシーケンサーは1分子リアルタイム（SMRT®）シークエンシングテクノロジーを基盤としており、他社のシーケンサーに比べ高精度ではるかに長いリードを得ることができます。 シーケンスは SMRT Cells 上にある数千個の Zero-Mode Waveguides（ZMWs）内で行われます。ZMWs 内には 1分子の DNA ポリメラーゼが固定されており、蛍光を用いて DNA 合成反応を検出することでシーケンスデータが得られます。バクテリア等の de novo アセンブリにご利用頂けます。

Generate Finished Genomes

• Resolve mobile elements and structural variation events
• Generate complete, accurate, and contiguous genome assemblies
• Annotate more genes

De novo assembly

• Hierarchical assembly
• Hybrid assembly
• Scaffolding
• Gap filling

Characterize Genomic Variation

• Isoform sequencing
• Repeat expansions
• Structural variation and copy number variants
• Full-length 16S rRNA sequencing
• Compound mutations and haplotype phasing
• Minor variants and Quasispecies
• SNP detection and validation

[De novo Assembly＋Annotation]

PacBio®の場合は、他の次世代シーケンサーと比較し、サンプル状態が結果に大きく影響します。

- gDNA抽出：Qiagen DNeasy kitまたはPromega Wizard kit 等（他のkitも使用可能です。）
- elution buffer：EDTAなどが入ってないTris-HCl(PH8) buffer等
- 不純物（腐植酸、phenol類など）が入らないようにしてください。
- 電気泳動で確認した際に分解がなく、スメアが見られないこと

また、サンプルQCで2-3µl使用致しますので、サンプル量は10µlを目安に多めにご準備ください。

• サンプルは緩衝材と保冷剤を入れた発泡スチロール製保冷箱に入れ、サンプルがDNAの場合は保冷剤を、サンプルがRNAの場合はドライアイスを十分入れてご送付ください。チューブの破損やクロスコンタミネーションに十分ご注意下さい。
• チューブには必ずラベルや油性マジックでサンプル名を記載し、他のチューブと判別できるようにご注意下さい。
• ご送付は宅急便等で下記宛先まで着払いにてご送付ください。なお、サンプルの紛失を避けるために事前に jutaku_gr@cosmobio.co.jp までご送付日、配送業者名、お問合せ番号をお知らせください。

ご提供いただくサンプルについては、インフォームド・コンセントが取得されており、かつドナーの個人情報が特定できないように匿名化されたものである必要がございます。

お見積り依頼・ご注文の際は下記のオーダーシートに必要事項をご入力いただき、E­mail にてご送付をお願いいたします。ご注文の際はお取引のある代理店様に品番、数量をご指定の上ご発注下さい。またサンプルをご送付いただく際は本オーダーシートをサンプルに同封して下さい。

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