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- トランスクリプトームシーケンシングでは、RNA 解析によりサンプル間の 発現量の差 （Expression profile） を見ることができ、リファレンスデータベースがない種でも新規トランスクリプトーム解析を行えます。
記事ID ： 13594
Transcriptome Sequencing(RNA-seq) トランスクリプトームシーケンシング (RNA-seq)
マクロジェン社：Transcriptome Sequencing
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データ解析*
- Transcriptome de novo sequencing
- de novo アセンブリ
- 遺伝子発現プロファイル
- 遺伝子 アノテーション
- 発現変動遺伝子（DEGs）解析 - Transcriptome Resequencing
- リファレンスゲノムへのマッピング
- 遺伝子発現プロファイル（＋新規転写産物の同定）
- 発現変動遺伝子（DEGs）解析、Gene Ontology (GO) Enrichiment 解析
- KEGG解析 - 追加解析
- SNP解析
- 融合遺伝子解析
- small RNAデータ解析
- 発現プロファイル、新規small RNA、発現変動miRNA
- 既知miRNAのターゲット予測
- 遺伝子群解析
- 比較解析
＊データ解析は、リファレンスの有無および使用するプラットフォームの種類によって異なる場合があります。
納品データ例
参考価格および標準納期
| サービス項目 | RNA-seq | small RNA-seq |
|---|---|---|
| 使用機種 | NovaSeq X plus | NovaSeq X plus |
| 対象生物 | ヒト、マウス、ラット等 | ヒト、マウス、ラット等 |
| データ量 | 4 Gb or 6Gb (リード数：4,000 万) | 0.5Gb or 1Gb |
| リード長 | 100 bp or 150bp | 50 bp |
| シーケンス方法 | Paired End | Single End |
| 必要サンプル量 | Total RNA 1 µg 以上(mRNA Library Prep) Total RNA 0.5 µg 以上(Total RNA Library Prep) ※微量サンプルの場合はお問い合わせください。 |
Total RNA 1 µg 以上 ※微量サンプルの場合はお問い合わせください。 |
| 価格（税抜） |
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| 納期（QC合格後） | 約 4〜6 週間 | 約 4〜6 週間 |
| 納品物 |
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※1 リファレンス情報のご提示が必要です。
※2 サンプル数によって価格が変動する場合がございます。
※3 比較パターンごとの費用になります。
※4 miRBase登録情報、リファレンス情報のご提示が必要です。
サンプルのご送付方法
- サンプルは緩衝材と保冷剤を入れた発泡スチロール製保冷箱に入れ、サンプルがDNAの場合は保冷剤を、サンプルがRNAの場合はドライアイスを十分入れてご送付ください。チューブの破損やクロスコンタミネーションに十分ご注意ください。
- チューブには必ずラベルや油性マジックでサンプル名を記載し、他のチューブと判別できるようにご注意ください。
- ご送付は宅急便等で下記宛先まで着払いにてご送付ください。なお、サンプルの紛失を避けるために事前に jutaku_gr@cosmobio.co.jp までご送付日、配送業者名、お問合せ番号をお知らせください。
| サンプル 送付先 |
〒135-0064 東京都江東区青海2-4-32 タイム24ビル16F （株）マクロジェン・ジャパン NGSサービス係行き TEL: 03-5962-1124 |
|---|
ご提供いただくサンプルについては、インフォームド・コンセントが取得されており、かつドナーの個人情報が特定できないように匿名化されたものである必要がございます。
お見積り・ご注文方法
お見積り依頼・ご注文の際は下記のオーダーシートに必要事項をご入力いただき、Email にてご送付をお願いいたします。ご注文の際はお取引のある代理店様に品番、数量をご指定の上ご発注ください。またサンプルをご送付いただく際は本オーダーシートをサンプルに同封してください。
| オーダーシート 送付先 |
コスモ・バイオ株式会社 創薬・受託サービス部 E-mail： jutaku_gr@cosmobio.co.jp |
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次世代シーケンシング受託サービス （MACROGEN）一覧
« 次世代シーケンシング受託サービス （MACROGEN）に戻る
- 全ゲノムシーケンシング (NovaSeq6000)
- PacBio® SequelⅡ ロングリードシーケンシング
- トランスクリプトームシーケンシング
- エピゲノムシーケンシング
- エクソーム/ターゲットシーケンシング
- キャンサーパネルシーケンシング
- メタゲノムシーケンシング
受託サービスに関するご相談
商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。
