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研究用

ChIP SequencingChIP シーケンシング
マクロジェン社:ChIP Sequencing

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遺伝子の転写過程における後成的な調整メカニズムは、DNA メチル化やヒストン修飾が最もよく知られています。NGS を利用することで、 そのメカニズムをより効果的に解析できます。

Technology pipeline for MBD(Methyl-CpG binding domain)sequencing

シーケンシングプラットフォーム

・ HiSeq / MiSeq system (Single, Paired-end)

データ解析*

Methylation / MBD (Methyl-CpG Binding Domain) data analysis

  • Standard data analysis
    - Global Methylation Profiles
    - Specific Methylation Profiles
    - Differentially Methylation Regions (DMR)
  • Advanced data analysis
    - DMR-Associated Genes
    - Gene Set Analysis
    - Comparative Analysis

ChIP (Chromatin Immuno Precipitation) data analysis

  • Standard data analysis
    - Enrichment Peak Profiles and Gene Annotation
    - Differentially Enriched Peaks and Gene Annotation
    - Multiple Alignment and Consensus Motif
  • Advanced data analysis
    - Gene Set Analysis
    - Comparative Analysis
technology pipeline for ChIP sequencing

* Data Analysis may be varified by the availability of reference and the type of platform.

参考価格および標準納期

サービス項目 ChIP Sequencing
対象生物 リファレンスのある生物のみ
使用機種 HiSeq2500 NovaSeq6000
リード数 220-250 M リード 26 Mリード (paired-end なので実質は 13 M リード)
リード長 50 bp 150 bp
シーケンス方法 Single End, 1レーンに 4-8 サンプル Paired-End
価格(税抜)
  • ライブラリー作製:42,000 円/サンプル
  • シーケンス:21 万円/1レーン
  • データ解析:45,000 円
  • ライブラリ作製:42,000 円/サンプル
  • シーケンス:16,000円/サンプル
  • データ解析:45,000 円/サンプル
データ解析
ピーク解析
必要サンプル量 IPしたDNA(精製したDNA断片)の濃度は10ng/µL以上で 10µL以上必要です。sizeは500bp以下で300bp程度が適しています。
納期(QC合格後) シーケンス: 6-8 週間
データ解析:1-2 週間
納品物
  1. シーケンシング結果(fastqフォーマットファイル)
  2. リファレンスゲノムへのマッピング結果
  3. ピークの検出およびアノテーション結果

 

お見積り・ご注文方法

お見積り依頼・ご注文の際は下記のオーダーシートに必要事項をご入力いただき、FAX か E­mail にて営業部宛にご送付をお願いいたします。ご注文の際はお取引のある代理店様に品番、数量をご指定の上ご発注下さい。またサンプルをご送付いただく際は本オーダーシートをサンプルに同封して下さい。

オーダーシート
送付先
コスモ・バイオ株式会社 営業部
FAX: 03-5632-9614
E-mail: jutaku_gr@cosmobio.co.jp

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03-5632-9616
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E-mail
MAG@cosmobio.co.jp

商品は「研究用試薬」です。人や動物の医療用・臨床診断用・食品用としては使用しないように、十分ご注意ください。

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