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超多重化:高次多重化定量プロテオミクス手法によって、酵母におけるラパマイシンに対する動的応答のマップが得られる

Hyperplexing: A Method for Higher-Order Multiplexed Quantitative Proteomics Provides a Map of the Dynamic Response to Rapamycin in Yeast

Research Resources

Sci. Signal., 27 March 2012
Vol. 5, Issue 217, p. rs2
[DOI: 10.1126/scisignal.2002548]

Noah Dephoure and Steven P. Gygi*

Department of Cell Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA.

* To whom correspondence should be addressed. E-mail: sgygi@hms.harvard.edu

要約:大規模な定量プロテオミクスは、細胞のタンパク質存在量に関するほぼ全体的な概観を提供することができる。しかし、タンパク質を無理なく網羅し、信頼性のある定量化を実現するために必要な時間、労力、専門知識は、この技術の幅広い適用を制限してきた。生物系の解明のために質量分析法を最大限に活用するには、全条件下での動的変化をモニタリングし、統計学的なパワーを得るための反復解析を可能にするための十分なスループットが必要である。われわれは、定量的質量分析の多重化能を高める直接的なアプローチについて報告する。この方法は、細胞シグナル伝達経路の解析の基盤となるものである。三重の代謝標識と6つの構成要素を持つ等圧タグを用いて、18サンプルのタンパク質存在量の変化を同時にモニタリングし、ラパマイシンにより刺激された酵母における6点の時間的経過を生物学に3回反復した。このデータセットから、何千もの酵母タンパク質に関する時間的な存在量のプロファイルが得られ、TOR(ラパマイシン標的タンパク質)経路の細胞における複雑な役割が強調される。

N. Dephoure, S. P. Gygi, Hyperplexing: A Method for Higher-Order Multiplexed Quantitative Proteomics Provides a Map of the Dynamic Response to Rapamycin in Yeast. Sci. Signal. 5, rs2 (2012).

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