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記事ID : 43156
研究用

タグタンパク質の高効率かつ特異的な精製・免疫沈降(IP)に最適 DYKDDDDK Fab-Trap™ Agarose(アガロースビーズ標識DYKDDDDK抗体)

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DYKDDDDK Fab-Trap™ Agarose(DYKDDDDK-Fabトラップ™アガロース)は、DYKDDDDKタグ融合タンパク質の単離・精製・免疫沈降(IP:Immunoprecipitation)実験に最適なアガロースビーズ担体結合済みのDYKDDDDKタグ抗体です。

アガロースビーズ(agarose beads)には、1xおよび3xDYKDDDDKタグ配列(1xおよび3xFlag®タグ)を特異的に認識する「抗DYKDDDDK組換えモノクローナル抗体(Fab領域)」が結合しています。

高親和性&高特異性組換えFab抗体免疫沈降(IP)に最適
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背景

DYKDDDDKタグとは?

DYKDDDDKタグ(別名:Flag®タグ)は、天然のタンパク質に由来しないアミノ酸配列からなる、人為的に作られたペプチドタグです。1988年に発表されたHoppらの論文で最初に報告されました[DOI:10.1038/nbt1088-1204 外部リンク]。DYKDDDDKタグは、目的タンパク質配列のN末端またはC末端に付加・クローニングされることでタグ融合組換えタンパク質の作製・発現に用いられ、抗体による様々な捕捉や検出アプリケーションのためのエピトープタグとして利用されます。「Flag®タグ」としても知られますが、「Flag®(Anti-Flag®)」という名称はSigma-Aldrich(Merck)社の登録商標です。そのため、一般的にはそのペプチド配列に基づきDYKDDDDKタグと呼称されます。DYKDDDDKタグは、8つのアミノ酸残基からなり、そのアミノ酸配列は「DYKDDDDK(Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys)」です。いわゆる1xFlag®タグに加えて、3xFlag®タグも使用されますが、多くの3xFlag®タグに使用されている配列モチーフ(アミノ酸配列:DYKDHDG-DYKDHDI-DYKDDDDK)は、1xFlag®配列(アミノ酸配列:DYKDDDDK)の単純な繰り返し配列ではありません。クロモテック(2020年よりプロテインテックグループ)の『DYKDDDDK Fab-Trap™(ファブトラップ)』は、免疫沈降用アガロースビーズ結合済みの抗DYKDDDDKタグ Fabフラグメント抗体です。1xFlag®タグ配列および3xFlag®配列を認識し、純度が高くバックグラウンドの低い良好な免疫沈降(IP)を実現します

■ Proteintech Group(プロテインテック)とは?

Proteintech Group, Inc.(プロテインテック)社は、2001年に設立された抗体製造メーカーです。現在までに、米国本社の他、英国、中国、ドイツ、フランス、シンガポール等で支社を展開し、各国で様々なマーカー抗体、タンパク質研究用試薬を供給しています。国内におけるテクニカルサポート等は、2016年より株式会社プロテインテック・ジャパン(www.ptglab.co.jp 外部リンク)が担当しています。

  • 全てオリジナル商品:自社ラボで製造、検証済み(購入後1年間の交換保証付き)
  • 数多くの評判:国内・海外における累計104,300報以上の論文使用実績(2024年4月現在)
  • 迅速な納期:約14,500品目を当社倉庫に国内在庫!
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プロテインテックは「日本で成長している抗体サプライヤー」

プロテインテックとChromoTek(クロモテック、ドイツ)は、引用数ランキング付の抗体検索サイトを運営する英国「CiteAb 外部リンク」が主催の「2022 CiteAb Awards」において「Researchers' choice(研究者の選択)外部リンク」部門と「Environmental Initiative of the Year(今年の環境イニシアチブ)外部リンク」部門でそれぞれ受賞者として選出されました。優れた品質およびカスタマーサービス、環境への取り組みが高く評価されています。

また「Which suppliers should you watch in the Japanese antibody market?(日本の抗体市場で注目すべきサプライヤーは?)外部リンク」のブログ記事で、近年発表された論文中の製品引用数を根拠にプロテインテックが「日本で成長している抗体サプライヤー」として「注目に値するシェアの拡大・急上昇」を見せていると言及されています。以下のリンクから、プロテインテックの主なカテゴリー製品をご覧いただけます。

 

特長

■ DYKDDDDK Fab-Trap™ Agarose(アガロースビーズ標識DYKDDDDK抗体)
商品名DYKDDDDK Fab-Trap™ Agarose(DYKDDDDK-Fabトラップ™アガロース)
(Fab-Trap anti-DYKDDDDK , recombinant Fab, coupled to agarose beads)
(アガロースビーズ標識組換え抗DYKDDDDK抗体)
品番ffa-10/ffa-20/ffa-100/ffa-200/ffa-400 外部リンク
免疫原DYKDDDDKタグ
交差種-
特異性1x and 3xDYKDDDDK-tag sequence (1x and 3xFlag®-tag).
アプリケーションIP(免疫沈降)、CoIP(共免疫沈降)、MS(Mass spectrometry)、Protein purification、ChIP(クロマチン免疫沈降)、RIP(RNA免疫沈降)
標識アガロースビーズ(Agarose Beads)
宿主動物/免疫動物マウス(組換えモノクローナルFab抗体)
クローン番号M2.1
抗体タイプマウスIgG1由来組換えFab抗体
(Recombinant Fab fragment of monoclonal mouse IgG1 M2.1)
抗体親和性(KD値)-
結合キャパシティ25 µL slurry bind about 12.5-15 µg of recombinant 3xDYKDDDDK-tagged protein (~30 kDa)
容量250 µL (10 reactions)/500 µL (20 reactions)/2.5 mL (100 reactions)/5 mL (200 reactions)/10 mL (400 reactions)
フォーマット液体(slurry)
ビーズ詳細Bead size: ~ 90 µm (cross-linked 4 % agarose beads)
洗浄バッファー適合性0.5 % Nonidet P40 Substitute, 5 % Tween™ 20, 2 M NaCl, 10 mM TCEP, 10 mM DTT, 10 mM β-mercaptoethanol, 2 M Urea
溶出方法- 3xDYKDDDDK-peptide
- SDS sample buffer
- 0.2 M glycine pH 2.5
Please consider whether elution is really needed. We recommend on-bead assays like on-bead digestion for MS analysis.
別名-
バッファー・保存剤1x PBS, Preservative: 0.09 % sodium azide
保存方法
  • 商品到着後は、4℃で保管してください。
  • 凍結はしないよう注意してください(凍結禁止)。

その他

■ DYKDDDDK Fab-Trap™ アプリケーション参考資料

よくある質問 FAQ

【01】N末端またはC末端の融合タグを使用する必要がありますか?

はい、N末端またはC末端の融合タグはどちらもトラップでうまく機能します。

【02】非特異的タンパク質の結合を回避する方法はありますか?

必要に応じて、サンプルの「プレクリア処理(Pre-clearing)」を実施してください。その際、コントロールアガロース(品番:bab-20)またはコントロール磁性アガロース(品番:bmab-20)を利用できます。詳細は以下のトラブルシューティングガイドをご覧ください。

【03】免疫沈降に必要な哺乳類細胞数を教えてください。

1回の免疫沈降反応で約10^6~10^7の哺乳類細胞の使用をおすすめします。収量は目的のタンパク質や相互作用因子の発現レベルに依存する場合があります。

【04】免疫沈降に必要な細胞抽出物量を教えてください。

哺乳類細胞以外の場合、0.5~1.0mgの細胞抽出物の使用をおすすめします。

【05】質量分析のために、結合タンパク質をビーズから溶出する必要がありますか?

免疫沈降後にビーズ上で直接消化する方法も利用可能です。より迅速で効率的なサンプル前処理と高収率を実現します。詳細は以下の資料をご覧ください。

【06】酵素アッセイのために目的タンパク質をビーズから溶出する必要がありますか?

いいえ、活性中心がブロックされていない限り、直接酵素アッセイが可能です。詳細は以下の資料をご覧ください。

【07】1回の免疫沈降に必要なFab-Trap量を教えてください。

親和性が非常に高いため、1回の反応あたり25 µL(Fab-Trap slurry量)で十分です。

使用例

■ DYKDDDDK Fab-Trap™ Agarose(アガロースビーズ標識DYKDDDDK抗体)(品番:ffa-10/-20/-100/-200/-400)

DYKDDDDK Fab-Trap™ was used for immunoprecipitation of Flag®-tagged protein from HEK293T cell lysate. During elution with 3xDYKDDDDK-peptide (fp-1) the enriched Flag® fusion protein is released from DYKDDDDK Fab-Trap™. Western blot was probed with DYKDDDDK tag Polyclonal antibody (Binds to FLAG® tag epitope) (Proteintech, 20543-1-AP) and Nano-Secondary® alpaca anti-human IgG/anti-rabbit IgG, recombinant VHH, Alexa Fluor® 488 [CTK0101, CTK0102] (srbAF488-1). L: Prestained protein marker (Proteintech, PL00001), I: Input, FT: Flow-Through, E: Elution.
図1
DYKDDDDK Fab-Trap™ was used for immunoprecipitation of Flag®-tagged protein from HEK293T cell lysate. During elution with 3xDYKDDDDK-peptide (fp-1) the enriched Flag® fusion protein is released from DYKDDDDK Fab-Trap™. Western blot was probed with DYKDDDDK tag Polyclonal antibody (Binds to FLAG® tag epitope) (Proteintech, 20543-1-AP) and Nano-Secondary® alpaca anti-human IgG/anti-rabbit IgG, recombinant VHH, Alexa Fluor® 488 [CTK0101, CTK0102] (srbAF488-1). L: Prestained protein marker (Proteintech, PL00001), I: Input, FT: Flow-Through, E: Elution.
Analysis of unspecific binding of endogenous proteins to the DYKDDDDK Fab-Trap™ in the absence of Flag® fusion protein. Lysates devoid of Flag® fusion protein from HEK cells (HEK293T), Yeast (Saccharomyces cerevisiae), Insect cells (HighFive), Bacteria (Escherichia coli TG1) , and Plant (Arabidopsis thaliana) were subjected to immunoprecipitation with DYKDDDDK Fab-Trap™ and elution with 2x SDS-sample buffer. SDS-PAGE analysis shows elution of Fab-fragment only without contamination of endogenous proteins. L: Prestained protein marker (Proteintech, PL00001), I: Input, B: Bound.
図2
Analysis of unspecific binding of endogenous proteins to the DYKDDDDK Fab-Trap™ in the absence of Flag® fusion protein. Lysates devoid of Flag® fusion protein from HEK cells (HEK293T), Yeast (Saccharomyces cerevisiae), Insect cells (HighFive), Bacteria (Escherichia coli TG1) , and Plant (Arabidopsis thaliana) were subjected to immunoprecipitation with DYKDDDDK Fab-Trap™ and elution with 2x SDS-sample buffer. SDS-PAGE analysis shows elution of Fab-fragment only without contamination of endogenous proteins. L: Prestained protein marker (Proteintech, PL00001), I: Input, B: Bound.
 
DYKDDDDK Fab-Trap™ was used for immunoprecipitation of Flag®-tagged protein from HEK293T cell lysate. During elution with 2x SDS-sample buffer the enriched Flag® fusion protein and Fab-fragment are released from DYKDDDDK Fab-Trap™. Western blot was probed with DYKDDDDK tag Polyclonal antibody (Binds to FLAG® tag epitope) (Proteintech, 20543-1-AP) and Nano-Secondary® alpaca anti-human IgG/anti-rabbit IgG, recombinant VHH, Alexa Fluor® 488 [CTK0101, CTK0102] (srbAF488-1). L: Prestained protein marker (Proteintech, PL00001), I: Input, FT: Flow-Through, B: Bound.
図3
DYKDDDDK Fab-Trap™ was used for immunoprecipitation of Flag®-tagged protein from HEK293T cell lysate. During elution with 2x SDS-sample buffer the enriched Flag® fusion protein and Fab-fragment are released from DYKDDDDK Fab-Trap™. Western blot was probed with DYKDDDDK tag Polyclonal antibody (Binds to FLAG® tag epitope) (Proteintech, 20543-1-AP) and Nano-Secondary® alpaca anti-human IgG/anti-rabbit IgG, recombinant VHH, Alexa Fluor® 488 [CTK0101, CTK0102] (srbAF488-1). L: Prestained protein marker (Proteintech, PL00001), I: Input, FT: Flow-Through, B: Bound.
 

DYKDDDDK Fab-Trap™ Agarose(アガロースビーズ標識DYKDDDDK抗体)

■アガロースビーズ標識モノクローナル抗体(組換えFab抗体)

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
Anti DYKDDDDK, Fab-Trap(R), Recombinant Fab, Agarose詳細データ PGI FFA-10 10 RXN
¥55,000
Anti DYKDDDDK, Fab-Trap(R), Recombinant Fab, Agarose詳細データ PGI FFA-20 20 RXN
¥92,000
Anti DYKDDDDK, Fab-Trap(R), Recombinant Fab, Agarose詳細データ PGI FFA-100 100 RXN
[5 x 20 rxns]
¥415,000
Anti DYKDDDDK, Fab-Trap(R), Recombinant Fab, Agarose詳細データ PGI FFA-200 200 RXN
[10 x 20 rxns]
お問い合わせ
Anti DYKDDDDK, Fab-Trap(R), Recombinant Fab, Agarose詳細データ PGI FFA-400 400 RXN
[20 x 20 rxns]
お問い合わせ

[関連]DYKDDDDK Fab-Trap™ Agarose(アガロースビーズ標識DYKDDDDK抗体)キット

■ 「推奨バッファー」も入ってお得な免疫沈降(IP)キットです。

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
DYKDDDDK Fab-Trap(R) Agarose, kit詳細データ PGI FFAK-20 20 RXN
¥115,000

「アガロースビーズ標識DYKDDDDK抗体」と「バッファー類(Lysis buffer、RIPA buffer、Dilution buffer、Wash bufferを含む)」のセット商品です。

[関連]DYKDDDDK 免疫沈降 Starter Pack(アガロースビーズ標識抗体、ペプチド、検出抗体のセット品)

■ 「溶出用ペプチド&検出抗体」も入って便利な免疫沈降(IP)パックです。

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
DYKDDDDK Immunoprecipitation Starter Pack詳細データ PGI FFAP-20 20 RXN
[500μL + 1mg + 20μL]
¥110,000

「アガロースビーズ標識DYKDDDDK抗体(品番:FFA-20)」「3xDYKDDDDKペプチド(品番:FP-1)」「検出用抗体(品番:20543-1-AP、包装:20UL)」のセット商品です。

[関連]3xDYKDDDDK-peptide(3xDYKDDDDKペプチド)

■ 溶出用ペプチド(配列:MDYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDK)

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
3xDYKDDDDK Peptide, lyphilized詳細データ PGI FP-1 1 MG
¥21,000

[関連]Binding Control Agarose(コントロールアガロース)

結合コントロール」または「プレクリア処理(Pre-clearing)」に利用できるアガロースビーズです。VHH抗体は結合していません。プレクリア処理に関しては、プロテインテック社ブログ記事「免疫沈降(IP)で低バックグラウンドを実現するために 外部リンク」をご参照ください。

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
Blocked agarose beads (binding control), Agarose詳細データ PGI BAB-20 20 RXN
¥17,000

[関連]DYKDDDDK tag 抗体

[関連]Nano-Trap(ナノトラップ)一覧

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