ヒトセクレトーム

Sci. Signal. 26 Nov 2019:
Vol. 12, Issue 609, eaaz0274
DOI: 10.1126/scisignal.aaz0274

Mathias Uhlén^1,2,3,*, Max J. Karlsson¹, Andreas Hober¹, Anne-Sophie Svensson⁴, Julia Scheffel⁴, David Kotol¹, Wen Zhong¹, Abdellah Tebani¹, Linnéa Strandberg¹, Fredrik Edfors^1,5, Evelina Sjöstedt³, Jan Mulder³, Adil Mardinoglu¹, Anna Berling⁴, Siri Ekblad⁴, Melanie Dannemeyer⁴, Sara Kanje⁴, Johan Rockberg⁴, Magnus Lundqvist⁴, Magdalena Malm⁴, Anna-Luisa Volk⁴, Peter Nilsson¹, Anna Månberg¹, Tea Dodig-Crnkovic¹, Elisa Pin¹, Martin Zwahlen¹, Per Oksvold¹, Kalle von Feilitzen¹, Ragna S. Häussler¹, Mun-Gwan Hong¹, Cecilia Lindskog⁶, Fredrik Ponten⁶, Borbala Katona⁶, Jimmy Vuu⁶, Emil Lindström⁶, Jens Nielsen⁷, Jonathan Robinson⁷, Burcu Ayoglu¹, Diana Mahdessian¹, Devin Sullivan¹, Peter Thul¹, Frida Danielsson¹, Charlotte Stadler¹, Emma Lundberg¹, Göran Bergström^8,9, Anders Gummesson⁸, Bjørn G. Voldborg², Hanna Tegel⁴, Sophia Hober⁴, Björn Forsström¹, Jochen M. Schwenk¹, Linn Fagerberg¹, and Åsa Sivertsson¹

¹ Department of Protein Science, Science for Life Laboratory, KTH-Royal Institute of Technology, Stockholm, Sweden.
² Center for Biosustainability, Technical University of Denmark, Lyngby, Denmark.
³ Department of Neuroscience, Karolinska Institute, Stockholm, Sweden.
⁴ Department of Protein Science, AlbaNova University Center, KTH-Royal Institute of Technology, Stockholm, Sweden.
⁵ Department of Genetics, School of Medicine, Stanford University, Stanford, CA, USA.
⁶ Department of Pathology, Uppsala University, Uppsala, Sweden.
⁷ Department of Chemical and Biological Engineering, Chalmers University of Technology, Gothenburg, Sweden.
⁸ Department of Molecular and Clinical Medicine, Institute of Medicine, Sahlgrenska Academy, University of Gothenburg, Gothenburg, Sweden.
⁹ Region Västra Götaland, Sahlgrenska University Hospital, Department of Clinical Physiology, Gothenburg, Sweden.

* Corresponding author. Email: mathias.uhlen@scilifelab.se

要約

ヒト細胞によって分泌されるタンパク質群（総称してセクレトームと呼ばれる）は、ヒト生物学の基本的理解だけでなく、将来の診断および治療の潜在的な標的の特定にも重要である。ここでは、ヒト細胞で分泌されると予測されるタンパク質の包括的な解析を提示する。この解析は末梢血へ活発に分泌されるタンパク質を含む、人体での最終的な局在化に関する情報を提供している。解析結果から、セクレトームの多数のタンパク質が細胞外に分泌されず、細胞内に保持されることが示唆され、さらに発現組織に局所的に保持され、血液へ分泌されないことが予測される別の大きなタンパク質群が同定された。質量分析ベースプロテオミクスおよび抗体ベースイムノアッセイによりヒト血液中に検出されたタンパク質は、血中濃度の推定値とともに提示されている。これらの結果は、ヒトタンパク質アトラスの更新バージョン19に示されている。このバージョンでは、セクレトームタンパク質をコードする各遺伝子に注釈が付けられ、体全体の発現データ、単一細胞および細胞内レベルまでの空間局在データ、および血液中で検出可能なタンパク質の存在に関するデータを含む、ヒトセクレトームのオープンアクセス知識リソースを提供する。

Citation: M. Uhlén, M.J. Karlsson, A. Hober, A.-S. Svensson, J. Scheffel, D. Kotol, W. Zhong, A. Tebani, L. Strandberg, F. Edfors, E. Sjöstedt, J. Mulder, A. Mardinoglu, A. Berling, S. Ekblad, M. Dannemeyer, S. Kanje, J. Rockberg, M. Lundqvist, M. Malm, A.-L. Volk, P. Nilsson, A. Månberg, T. Dodig-Crnkovic, E. Pin, M. Zwahlen, P. Oksvold, K. von Feilitzen, R. S. Häussler, M.-G. Hong, C. Lindskog, F. Ponten, B. Katona, J. Vuu, E. Lindström, J. Nielsen, J. Robinson, B. Ayoglu, D. Mahdessian, D. Sullivan, P. Thul, F.Danielsson, C. Stadler, E. Lundberg, G. Bergström, A.Gummesson, B.G. Voldborg, H. Tegel, S. Hober, B. Forsström, J. M. Schwenk, L. Fagerberg, Å. Sivertsson, The human secretome. Sci. Signal. 12, eaaz0274 (2019).