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研究用

免疫沈降(IP)で豊富な実績!高い特異性と親和性、Nano-Trap シリーズ V5-Trap® Agarose(アガロースビーズ標識V5タグ抗体)

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V5-Trap® Agarose(V5トラップ®アガロース)は、V5タグ融合タンパク質の免疫沈降(IP:Immunoprecipitation)実験に最適なアガロースビーズ担体結合済みのV5タグ抗体です。

アガロースビーズ(agarose beads)には、アルパカ(Alpaca)を宿主動物(免疫動物)として作製された「抗V5組換えモノクローナルVHH抗体」が結合しています。VHH抗体は、Nanobody® としても知られるラクダ科動物の「重鎖抗体(Heavy chain-only antibody)」由来の抗原結合ドメインであり、高い特異性と親和性を示します。

高親和性&高特異性アルパカ組換えVHH免疫沈降(IP)に最適
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背景

V5タグとは?

V5タグ(V5-tag)とは、14残基のアミノ酸配列「GKPIPNPLLGLDST(Gly Lys Pro Ile Pro Asn Pro Leu Leu Gly Leu Asp Ser Thr)」からなる短鎖ペプチドタグです。V5タグは、クローニング技術によりタグ融合タンパク質として組換え発現させることが可能であり、V5タグ融合タンパク質は、V5タグに対する抗体やVHH抗体(別名:Nanobody®)を用いることでELISA、フローサイトメトリー、免疫沈降、免疫蛍光染色、ウェスタンブロット等の実験手法により検出や精製を実施することができます。V5タグは、シミアンウイルス5(パラミクソウイルス科、SV5:simian virus 5)のRNAポリメラーゼのαサブユニットに関与するPタンパク質およびアクセサリータンパク質であるVタンパク質に共通のN末端配列に存在する95番目から108番目のアミノ酸配列に由来し、1992年の論文で最初に記載されました [PMID:1372038 外部リンク]。

V5タグペプチドを認識する、様々なポリクローナル抗体やモノクローナル抗体、およびVHH抗体(Nanobody®)が市販されています。V5タグ抗体によって捕捉されたV5タグ融合タンパク質は、通常はグリシンやクエン酸バッファーを用いる酸溶出法、またはV5タグペプチド(配列:GKPIPNPLLGLDST)を用いるペプチド競合溶出法によって、溶出させることができます。免疫沈降を実施する場合、ChromoTek(クロモテック、ドイツ:2020年10月よりプロテインテックグループの一部)の『V5-Trap® 外部リンク』を推奨します。V5-Trap®は各種担体(アガロースビーズ、磁性アガロースビーズ、磁気ビーズ)を結合させたアルパカ由来の抗V5タグ VHH抗体(Nanobody®)からなる高い親和性と特異性を示す製品です。

■ VHH抗体とは?

VHH抗体は、Nanobody® としても知られるラクダ科動物の「重鎖抗体(Heavy chain-only antibody)」由来の抗原結合ドメインです。一般的な抗体と比べて、10分の1程度とサイズが小さく、高い特異性と親和性を示すことで知られます。

図. ラクダ科動物のユニークな重鎖抗体・VHH
図. ラクダ科動物のユニークな重鎖抗体・VHH
図. 従来の1/10ほどの分子量
図. 従来の1/10ほどの分子量
 

■ Nano-Trapとは?

ビーズに結合したVHH抗体Nano-Trap(ナノトラップ)は、迅速かつ効率的な免疫沈降(IP)に最適です。各種担体(アガロースビーズ、磁性アガロースビーズ、磁気ビーズ)に結合したVHH抗体で構成されます。

各種ビーズ上に結合したVHH抗体は、ビーズ上に残存し、SDSサンプルバッファー中で溶出されません。したがって、従来のIP解析でしばしば問題となるIP抗体由来の軽鎖または重鎖バンドの干渉が無く、シングルバンドの精製を可能とします。さらに、ウエスタンブロットに使用する一次抗体/二次抗体を自由に選択できます。

 

■ Nano-Trapのアプリケーション

  • IP(免疫沈降)/ CoIP(共免疫沈降)
  • ChIP(クロマチン免疫沈降)/ RIP(RNA免疫沈降)
  • 質量分析(Mass spectrometry)
  • On-bead enzyme assay
NanoTrap(左)と従来型であるProtein A/G結合IgG抗体(右)を用いた免疫沈降の概要。Nano-Trapでは、単一のバンドを得られ、従来型とは異なり軽鎖/重鎖由来のバンドは観察されません。
図. Nano-Trap(左)と従来型であるProtein A/G結合IgG抗体(右)を用いた免疫沈降の概要。Nano-Trapでは、単一のバンドを得られ、従来型とは異なり軽鎖/重鎖由来のバンドは観察されません。
 

■ Proteintech Group(プロテインテック)とは?

Proteintech Group, Inc.(プロテインテック)社は、2001年に設立された抗体製造メーカーです。現在までに、米国本社の他、英国、中国、ドイツ、フランス、シンガポール等で支社を展開し、各国で様々なマーカー抗体、タンパク質研究用試薬を供給しています。国内におけるテクニカルサポート等は、2016年より株式会社プロテインテック・ジャパン(www.ptglab.co.jp 外部リンク)が担当しています。

  • 全てオリジナル商品:自社ラボで製造、検証済み(購入後1年間の交換保証付き)
  • 数多くの評判:国内・海外における累計104,300報以上の論文使用実績(2024年4月現在)
  • 迅速な納期:約14,500品目を当社倉庫に国内在庫!
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プロテインテックは「日本で成長している抗体サプライヤー」

プロテインテックとChromoTek(クロモテック、ドイツ)は、引用数ランキング付の抗体検索サイトを運営する英国「CiteAb 外部リンク」が主催の「2022 CiteAb Awards」において「Researchers' choice(研究者の選択)外部リンク」部門と「Environmental Initiative of the Year(今年の環境イニシアチブ)外部リンク」部門でそれぞれ受賞者として選出されました。優れた品質およびカスタマーサービス、環境への取り組みが高く評価されています。

また「Which suppliers should you watch in the Japanese antibody market?(日本の抗体市場で注目すべきサプライヤーは?)外部リンク」のブログ記事で、近年発表された論文中の製品引用数を根拠にプロテインテックが「日本で成長している抗体サプライヤー」として「注目に値するシェアの拡大・急上昇」を見せていると言及されています。以下のリンクから、プロテインテックの主なカテゴリー製品をご覧いただけます。

 

特長

■ V5-Trap® Agarose(アガロースビーズ標識V5タグ抗体)
商品名V5-Trap® Agarose(V5トラップ®アガロース)
(Nano-Trap alpaca anti-V5, recombinant VHH, coupled to agarose beads)
(アガロースビーズ標識アルパカ由来抗V5ナノ抗体)
品番v5ta-10/v5ta-20/v5ta-100/v5ta-200/v5ta-400 外部リンク
免疫原V5-tag
交差種-
特異性V5-tag sequence motif GKPIPNPLLGLDST
アプリケーションIP(免疫沈降)、CoIP(共免疫沈降)、ChIP(クロマチン免疫沈降)、RIP(RNA免疫沈降)
標識アガロースビーズ(Agarose Beads)
宿主動物/免疫動物アルパカ(組換えモノクローナルVHH抗体)
クローン番号-
抗体タイプアルパカ由来シングルドメイン一価抗体
(Alpaca single domain antibodies, monovalent)
抗体親和性(KD値)Dissociation constant KD of 40 nM
結合キャパシティ10 µL slurry bind about 6 µg of recombinant V5-tagged protein (~30 kDa)
容量250 µL (10 reactions)/500 µL (20 reactions)/2.5 mL (100 reactions)/5 mL (200 reactions)/10 mL (400 reactions)
フォーマット液体(slurry)
ビーズ詳細Bead size: ~ 90 µm (cross-linked 4 % agarose beads)
洗浄バッファー適合性2 % Nonidet P40 Substitute, 2 % Triton X-100, 1 M NaCl, 5 mM TCEP, 5 mM DTT, 10 mM ?-mercaptoethanol, 4 M Urea
溶出方法- V5-peptide - SDS sample buffer - 0.1 M glycine pH 2.0 Please consider whether elution is really needed. We recommend on-bead assays like on-bead digestion for MS analysis.
別名Recombinant, monoclonal anti-V5-tag single domain antibody (sdAb) fragment
バッファー・保存剤20 % EtOH
保存方法
  • 商品到着後は、4℃で保管してください。
  • 凍結はしないよう注意してください(凍結禁止)。

その他

■ V5-Trap® Agarose アプリケーション参考資料

よくある質問 FAQ

【01】N末端とC末端融合タグはどちらも機能しますか?

はい、N末端とC末端融合タグのどちらも機能します。

【02】非特異的タンパク質の結合を回避する方法はありますか?

必要に応じて、サンプルの「プレクリア処理(Pre-clearing)」を実施してください。その際、コントロールアガロース(品番:bab-20)またはコントロール磁性アガロース(品番:bmab-20)を利用できます。詳細は以下のトラブルシューティングガイドをご覧ください。

【03】免疫沈降に必要な哺乳類細胞数を教えてください。

1回の免疫沈降反応で約10^6~10^7の哺乳類細胞の使用をおすすめします。収量は目的のタンパク質や相互作用因子の発現レベルに依存する場合があります。

【04】免疫沈降に必要な細胞抽出物量を教えてください。

哺乳類細胞以外の場合、0.5~1.0mgの細胞抽出物の使用をおすすめします。

【05】質量分析のために、結合タンパク質をビーズから溶出する必要がありますか?

免疫沈降後にビーズ上で直接消化する方法も利用可能です。より迅速で効率的なサンプル前処理と高収率を実現します。詳細は以下の資料をご覧ください。

【06】酵素アッセイのために目的タンパク質をビーズから溶出する必要がありますか?

いいえ、活性中心がブロックされていない限り、直接酵素アッセイが可能です。詳細は以下の資料をご覧ください。

【07】1回の免疫沈降に必要なNano-Trap量を教えてください。

親和性が非常に高いため、1回の反応あたり25 µL(Nano-Trap slurry量)で十分です。

【08】各V5-Trap®(アガロース、磁性アガロース、磁性ビーズ)の違いを教えてください。

各ビーズの特性(表1)に基づいて以下のように推奨します。

  • アガロースビーズ(Agarose)非常に低いバックグラウンドおよび高い結合能を必要とするIPに最適
  • 磁性アガロースビーズ(Magnetic Agarose)磁気分離および高い結合能を必要とするIPに最適
  • 磁気ビーズ(Magnetic Particles M-270)磁気分離および非常に大きなタンパク質を対象とするIPに最適
表1. V5-Trap® 各種ビーズの特性
V5-Trap® 結合担体 アガロース 磁性アガロース 磁気ビーズ
ビーズ詳細 アガロース
(4% cross-linked)
磁性アガロース
(6% cross-linked)
磁気ビーズ M-270
ビーズ形状 多孔質 多孔質、鉄コア 固体
結合抗体 抗V5タグ組換えモノクローナルVHH抗体
分離可能なタンパク質サイズ* 小〜大(<200 kDa) 小〜大(<200 kDa)
特大(>200 kDa)
ビーズ外観
ビーズサイズ 90 µm 40 µm 2.8 µm
結合能
(10 µLあたり)
6 µg ~7 µg ~0.25-0.5 µg
バックグラウンド 非常に低い 低い
磁気分離/自動化 No Yes
最大遠心力(x g) 2,500 x g 800 x g 8,000 x g

*タンパク質のサイズ、形状、多量体/複合体、相互作用因子に依存します。

使用例

■ V5-Trap® Agarose(アガロースビーズ標識V5タグ抗体)(品番:v5ta-10/-20/-100/-200/-400)

V5-Trap Agarose for immunoprecipitation of V5-tagged proteins. The V5-tag is C-terminal. I: Input, FT: Flow-Through, B: Bound
図1
V5-Trap Agarose for immunoprecipitation of V5-tagged proteins. The V5-tag is C-terminal. I: Input, FT: Flow-Through, B: Bound
V5-Trap for immunoprecipitation of V5 fusion proteins. HEK293T cell lysate with V5-tagged protein. Coomassie and Western blot. V5-tag antibody [SV5-P-K], monoclonal mouse IgG1 kappa and Alpaca anti-mouse IgG1, Fc-specific recombinant VHH, Alexa Fluor® 488 I: Input, FT: Flow-Through, B: Bound
図2
V5-Trap for immunoprecipitation of V5 fusion proteins. HEK293T cell lysate with V5-tagged protein. Coomassie and Western blot. V5-tag antibody [SV5-P-K], monoclonal mouse IgG1 kappa and Alpaca anti-mouse IgG1, Fc-specific recombinant VHH, Alexa Fluor® 488 I: Input, FT: Flow-Through, B: Bound
 

V5-Trap® Agarose(アガロースビーズ標識V5タグ抗体)

■アガロースビーズ標識モノクローナル抗体(組換えVHH抗体)

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
Anti V5, V5-TrapTM, recombinant VHH (Alpaca) Agarose詳細データ PGI V5TA-10 10 RXN
¥55,000
Anti V5, V5-TrapTM, recombinant VHH (Alpaca) Agarose詳細データ PGI V5TA-20 20 RXN
¥92,000
Anti V5, V5-TrapTM, recombinant VHH (Alpaca) Agarose詳細データ PGI V5TA-100 100 RXN
[5 x 20 rxns]
¥415,000
Anti V5, V5-TrapTM, recombinant VHH (Alpaca) Agarose詳細データ PGI V5TA-200 200 RXN
[10 x 20 rxns]
お問い合わせ
Anti V5, V5-TrapTM, recombinant VHH (Alpaca) Agarose詳細データ PGI V5TA-400 400 RXN
[20 x 20 rxns]
お問い合わせ

[関連]V5-Trap® Agarose(アガロースビーズ標識V5タグ抗体)キット

■ 「推奨バッファー」も入ってお得な免疫沈降(IP)キットです。

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
V5-TrapTM Agarose Kit (Alpaca) 詳細データ PGI V5TAK-20 20 RXN
¥115,000

「アガロースビーズ標識V5タグ抗体」と「バッファー類(Lysis buffer、RIPA buffer、Dilution buffer、Wash bufferを含む)」のセット商品です。

[関連]V5-peptide(V5 ペプチド)

■ 溶出用ペプチド(配列:GKPIPNPLLGLDST)

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
V5-peptide詳細データ PGI V5P-1 1 MG
¥17,000

[関連]Binding Control Agarose(コントロールアガロース)

結合コントロール」または「プレクリア処理(Pre-clearing)」に利用できるアガロースビーズです。VHH抗体は結合していません。プレクリア処理に関しては、プロテインテック社ブログ記事「ヒントとコツ | 免疫沈降(IP)でバックグラウンドを低減するための最適化方法 外部リンク」をご参照ください。

品名 メーカー 品番 包装 希望販売価格
Blocked agarose beads (binding control), Agarose詳細データ PGI BAB-20 20 RXN
¥17,000

[関連]V5-Trap® 別標識ラインアップ

[関連]V5-tag 抗体(主にWBに!非標識製品)

[関連]Nano-Trap(ナノトラップ)一覧

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