

GTPase 活性化アッセイ: アイソフォームの検出
Ras/Rho ファミリー GTPase は、発生、増殖、運動、細胞内輸送などの多様なアクチン依存的細胞プロセスの調節に重要な役割を果たしている低分子量Gタンパク質です1,2。さらに、Ras/Rho ファミリー GTPase の機能不全は、ヒトの疾患(例: 癌、神経変性)に関連しており、これらの GTPase は多くの病原性細菌の標的となっています3-5。GTPase ファミリーは多数のアイソフォームから構成されており、Rho ファミリーには Cdc42、RhoJ、RhoA、RhoB、RhoC、Rac1、Rac2、Rac3 が、Ras ファミリーには N-Ras、K-Ras、H-Ras が含まれます。これらの GTPase は、生理学的および病理学的プロセスにおいて主要な役割を担っていることから、特定の Rho/Ras アイソフォーム活性を測定する技術は非常に有用であると考えられます(表1、2)。
Rho/Ras ファミリー GTPase は、不活性な GDP 結合型と、活性を有する GTP 結合型のサイクルをくり返しています。従来の低分子量 GTPase 活性化アッセイは、アガロースビーズに結合したエフェクタータンパク質を利用して活性化 GTPase を単離(プルダウン)した後、ウエスタンブロットで定量化します。G-LISA は、プルダウンアッセイの代替として使用できる、より定量的で迅速、高感度な ELISA 法に基づく活性化アッセイです。Cytoskeleton(サイトスケルトン/CYT)社では、プルダウンと G-LISA の両方のキットを提供しており、どちらのキットも特定の Ras/Rho ファミリーアイソフォーム活性を測定するために、アッセイ条件の変更が可能です(表1、2)。重要なのは、アイソフォーム(例: H-Ras と K-Ras/N-Ras、RhoC と RhoA)によっては、他の関連するアイソフォームよりかなり低いレベルで発現する場合があることです6,7。発現量に大きな差があるため、低発現のアイソフォームの検出は困難です。ライセート濃度、溶解バッファー、抗体濃度/希釈率、といったアッセイ条件を変更し、至適条件を検討しますが、下記の例では、主にライセートの用量設定やアイソフォーム特異的な抗体について変更を行っています。
RhoA G-LISA キットを使用した RhoB/RhoC 活性の測定
Rho GTPase は、様々な生理学的および病理学的な細胞機能を仲介しています。Cytoskeleton 社の RhoA G-LISA キットは、血管新生(既存の血管系から新しい血管が形成される現象)における RhoB 活性の研究に使用されました。血管新生には成長因子による内皮細胞の活性化が必要となり、RhoB は成長因子の輸送および機能を調節することがわかっていることから8,9、内皮細胞の成長因子を介した血管新生において RhoB の果たす役割が検討されました10。血管内皮細胞増殖因子(VEGF)で刺激した後、RhoB の発現および活性が測定されました。活性の測定には、キットに標準で付属する RhoA 抗体を RhoB 抗体に変更した RhoA G-LISA キットが使用されました。得られた結果から、VEGF が介する内皮細胞の形態形成は、RhoB による(および RhoB が介する)RhoA 活性の阻害に依存する、と報告されています10。
アッセイする GTPase | キット | 参考文献 | 抗体(サプライヤー) | 抗体の希釈率 |
---|---|---|---|---|
RhoB | BK124 | 10 | SC-8048, Clone C-5 (Santa Cruz/SCB 社) |
- |
RhoC | BK124 | 10 | SC-130339, Clone 37 (Santa Cruz/SCB 社) |
- |
RhoC | BK124 | 14 | - | 1:50 |
RhoC | BK124 | 15, 16 | - | - |
RhoJ | BK127 | 18 | H00057381-M01, Clone 1E4 (Abnova/ABV 社) |
- |
RhoJ (HA-tag) | PAK02 または BK034 | 19 | Clone 3F10 for HA (Roche 社) |
- |
N-Ras | BK008 | 17 | - | - |
RhoA G-LISA キットは、RhoB 活性の他に、RhoC 活性の測定にも使用できます。RhoC の恒常的な活性は、多くの癌において腫瘍の進行、浸潤、転移に相関することから、RhoC は癌細胞の運動性に関与していると考えられています11-13。RhoA 抗体を RhoC 抗体に変更した RhoA G-LISA 活性化アッセイキットを使用して、前立腺癌の骨転移における RhoC の役割が検討されました14。また、RhoC 活性の制御因子も検討され、コレステロール生合成阻害剤であるアトルバスタチンが、多くの頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)細胞株において RhoC 活性を低下させることが報告されました15。その後、同じ腫瘍細胞株における microRNA-138 の発現が検討され、microRNA-138 は RhoC 発現および活性を負に制御すると報告されました16。どちらの論文でも15,16、RhoA 抗体を RhoC 抗体に変更した RhoA G-LISA キットを使用して、RhoC 活性の測定が行われています。
アッセイする GTPase | 検出可能なアイソフォーム | 品番 |
---|---|---|
RhoA | RhoA, RhoB, RhoC | BK036, BK036-S (プルダウン) BK121, BK124 (G-LISA) |
Rac1 | Rac1, Rac2, Rac3 | BK035, BK035-S, (プルダウン) BK125, BK126, BK128 (G-LISA) |
Ras | K-Ras, N-Ras, H-Ras | BK008, BK008-S (プルダウン) BK131 (G-LISA) |
RalA | RalA または RalB | BK040 (プルダウン) BK129 (G-LISA) |
Cdc42 | Cdc42 または RhoJ | BK034, BK034-S (プルダウン) BK127 (G-LISA) |
Ras プルダウンキットを使用した N-Ras 活性の測定
Ras は、Rho と同様に、癌や炎症性疾患などの多様な病態に関与する GTPase です。最近、Cytoskeleton 社の Ras プルダウンキットは、以前使われていた pan Ras 抗体が N-Ras 特異的抗体に変更され、N-Ras 活性を特異的に測定できるように改良されました17。このキットを使用して、原発性硬化性胆管炎(PSC)に伴う胆管細胞の老化に関与する分子経路が検討され、胆管細胞(胆管の上皮細胞)における N-Ras の発現および活性レベルの変化が焦点となりました17。
Cdc42 G-LISA キット/PAK ビーズを使用した RhoJ 活性の測定
RhoJ は、まだ研究報告が少ない GTPaseですが、 Cdc42 とアミノ酸配列が 55% の相同性を示すことがわかっており、Cytoskeleton 社の Cdc42 G-LISA キット18 または Cdc42 プルダウンキットに付属する PAK (p21-activated kinase 1 protein)-GST ビーズを用いて測定することが可能です19。様々な網膜症の原因となる異常な血管形成における GTPase の役割を解明することを目的として、HEK-293T および内皮細胞において、VEGF が介する Cdc42 および外因的に発現させた RhoJ の活性が測定されています。
プルダウンキット/G-LISA キットでアイソフォームを測定するには
特定の Ras/Rho アイソフォーム活性を測定するには、表1に示した文献リストをご参照ください。目的のアイソフォームに関する参考文献がない場合は、最も近い活性化アッセイキットを使用し、活性化したライセートおよび活性化していないライセートに対して特定の一次抗体を 1:50、1:100、1:200 で希釈してテストし、適切な濃度を設定してください。活性化/非活性化ライセートは、アッセイマニュアルに従い、血清含有培地中で 50% コンフルエントにした細胞を PBS で2回洗浄し、ライセートを調製して保存することで作製できます。分注したライセートを1つ解凍し、室温で1時間インキュベートして GTPase の活性レベルを低下させ、非活性化状態にします。未処理のライセートは、血清により最も増殖が促進され、活性化した状態であると考えられます。活性化/非活性化ライセートの調製には、ライセートをそれぞれ GTPγS または GDP とインキュベートする方法もあります(プルダウンアッセイマニュアルに記載)。
まとめ
アッセイ条件の変更が可能なのは、Rho および Ras 活性化アッセイだけではありません。Rac1活性化アッセイキットを使用した Rac2 / Rac3 活性の研究、RalA 活性化アッセイキットを用いた RalB の研究、Ras 活性化アッセイキットを用いた H-Ras / K-Ras / N-Ras の研究にも、同様の変更を適用できます(表2)。汎用性に優れたこれらのアッセイキットは、GTPase 活性化の研究に有用であると考えられます。
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アッセイの変更に使用できる抗体
品名 | メーカー | 品番 | 包装 | 希望販売価格 |
---|---|---|---|---|
Anti Rho B (C-5), Human (Mouse) Unlabeled, C-5![]() |
SCB | SC-8048 | 200 UG [200 μg/ml] |
¥67,000 |
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SCB | SC-130339 | 200 UG [200 μg/ml] |
¥67,000 |
Anti RHOJ, Human (Mouse) Unlabeled, 1E4![]() |
ABV | H00057381-M01 | 100 UG |
¥86,000 |
参考文献
- A.B. Jaffe and A. Hall. 2005. Rho GTPases: biochemistry and biology. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 21, 247-269.
- S.J. Heasman and A.J. Ridley. 2008. Mammalian Rho GTPases: new insights into their functions from in vivo studies. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 9, 690-701.
- N. Kasri Nadif and L. Van Aelst. 2008. Rho-linked genes and neurological disorders. Pflugers Arch. 455, 787-797.
- F.M. Vega and A.J. Ridley, 2008. Rho GTPases in cancer cell biology. FEBS Lett. 582, 2093-2101.
- K. Aktories. 2011. Bacterial protein toxins that modify host regulatory GTPases. Nat. Rev. Microbiol. 9, 487-498.
- J. Omerovic et al. 2008. Ras isoform abundance and signalling in human cancer cell lines. Oncogene. 27, 2754-2762.
- K.L. van Golen. personal communication.
- M. Huang et al. 2011. RhoB links PDGF signaling to cell migration by coordinating activation and localization of Cdc42 and Rac. J. Cell Biochem. 112, 1572-1584.
- A. Gampel et al. 1999. Regulation of epidermal growth factor receptor traffick by the small GTPase rhoB. Curr. Biol. 9, 955-958.
- G.A. Howe and C.L. Addison. 2012. RhoB controls endothelial cell morphogenesis in part via negative regulation of RhoA. Vasc. Cell. 4:1.
- E.A. Clark et al. 2000. Genomic analysis of metastasis reveals an essential role for RhoC. Nature. 406, 532-535.
- H. Suwa et al. 1998. Overexpression of the rhoC gene correlates with progression of ductal adenocarcinoma of the pancreas. Br. J. Cancer. 77, 147-152.
- K.L. van Golen et al. 2002. Reversion of RhoC GTPase-induced inflammatory breast cancer phenotype by treatment with a farnesyl transferase inhibitor. Mol. Cancer Ther. 1, 575-583.
- C.L. Hall et al. 2008. Type I collagen receptor (a2b1) signaling promotes prostate cancer invasion through RhoC GTPase. Neoplasia. 10, 797-803.
- M. Islam et al. 2013. Atorvastatin inhibits RhoC function and limits head and neck cancer metastasis. Oral Oncol. 49, 778-86.
- M. Islam et al. 2014. Down regulation of RhoC by microRNA-138 results in de-activation of FAK, Src and Erk1/2 signaling pathway in head and neck squamous cell carcinoma. Oral Oncol. 50, 448-456.
- J.H. Tabibian et al. 2014. Cholangiocyte senescence by way of N-Ras activation is a characteristic of primary sclerosing cholangitis. Hepatology. 59, 2263-2275.
- Y. Fukushima et al. 2011. Sema3E-PlexinD1 signaling selectively suppresses disoriented angiogenesis in ischemic retinopathy in mice. J. Clin. Invest. 121, 1974-1985.
- S. Kusuhara et al. 2012. Arhgef15 promotes retinal angiogenesis by mediating VEGF-induced Cdc42 activation and potentiating RhoJ inactivation in endothelial cells. PLoS ONE. 9:e45858.
■ CYTOSKELETON NEWS バックナンバー
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- 2020年8月号 細胞膜染色用蛍光プローブ
- 2020年4月号 生細胞におけるF-アクチンプローブ
- 2020年3月号 コロナウイルスと細胞骨格
- 2020年2月号 タウ(Tau)の将来性をMapping
- 2020年1月号 Rho GTPaseによる細胞遊走制御
- 2019年12月号 表現型プロファイリング:アクチンに焦点を当てたがん治療
- 2019年11月号 チューブリンの過剰グルタミル化、ミトコンドリア、神経変性
- 2019年9月号 細胞運動性を制御するために相互作用する膜張力とアクチン細胞骨格
- 2019年8月号 Rac1B、がん、およびRac1
- 2019年7月号 Rhoファミリー GTPases、神経可塑性、およびうつ状態
- 2019年6月号 アクチンメチオニン酸化: 動的制御の次の段階
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2018年
- 2018年12月号 アクチン細胞骨格とメカノトランスダクション(機械的シグナル伝達)
- 2018年11月号 軸索再生と細胞骨格
- 2018年10月号 ニューロンにおける微小管と極性
- 2018年8月号 Rab GTPase と 神経変性
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- 2018年4月号 RhoファミリーGEFと樹状突起スパインの構造的可塑性
- 2018年3月号 βカテニンとTFC/LEF-1の翻訳後修飾による標準的なWntシグナル制御
- 2018年2月号 がん抑制遺伝子p53の翻訳後修飾による機能の調整
- 2018年1月号 自閉スペクトラム症におけるGEF Trioの役割
2017年
- 2017年12月号 プロフィリン: アクチン結合タンパク質の多機能な役割
- 2017年11月号 ミトコンドリアにおけるアセチル化:新たな考え方と治療への応用の可能性
- 2017年9月号 翻訳後修飾のアセチル化による微小管の安定化
- 2017年8月号 神経軸索におけるアクチンリングを基盤とした周期的膜骨格(PMS)
- 2017年7月号 E3ユビキチンリガーゼMdm2によるがん抑制遺伝子p53の翻訳後制御
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- 2017年5月号 Arf6 GEF と癌細胞の浸潤・転移
- 2017年4月号 PTEN(Phosphatase and Tensin Homolog)による翻訳後制御
- 2017年3月号 Tau の翻訳後修飾: アルツハイマー病の治療標的
- 2017年2月号 樹状細胞の移動におけるアクチン結合タンパク質とF-アクチン
2016年
- 2016年11月/12月号 GEF を介した GTPase シグナル伝達の低分子阻害剤
- 2016年9月号 FtsZ タンパク質: 抗菌薬の新規ターゲット
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- 2016年4月号 Rac1と糖尿病: ポジティブな役割とネガティブな役割
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- 2016年1月/2月号 ビメンチン中間径フィラメント: リン酸化による調節
2015年
- 2015年8月号 タンパク質調節に不可欠な翻訳後修飾
- 2015年7月号 アクチン細胞骨格のライブセルイメージング
- 2015年6月号 有糸分裂に関わるタンパク質のSUMO化: 局在と機能
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- 2015年4月号 Ras 依存性の癌で注目される YAP1
- 2015年3月号 増刊号 統合失調症において遺伝子変異により誘導されるアクチン依存のシナプスの変化
- 2015年3月号 Ral GTPase を調節する翻訳後修飾
- 2015年1月/2月号 RhoA のリン酸化はシグナル伝達を調節する
- 2015年1月号 増刊号 微小管を不安定化する suprafenacine: 新規抗癌剤のリード化合物としての可能性
2014年
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- 2014年11月号 増刊号 樹状突起の形態形成: ドーパミンD1受容体 および Rho ファミリー GTPase による制御
- 2014年11月/12月号 GTPase 活性化アッセイ: アイソフォームの検出
- 2014年10月号 アルギニンの正電荷を消失させるシトルリン化
- 2014年9月号 キネシンサブドメインの探索
- 2014年9月号 増刊号 アクチン結合タンパク質コフィリンの S-ニトロシル化: 細胞移動に対する影響
- 2014年8月号 増刊号 原発性硬化性胆管炎における N-Ras 発現および活性
- 2014年8月号 SUMO化: 細胞骨格タンパク質を標的とした翻訳後修飾
- 2014年7月号 Sos/K-Ras 結合を介して Ras シグナル伝達を制御する新しい低分子阻害剤
- 2014年6月号 増刊号 頭頸部扁平上皮癌における microRNA-138 による RhoC のダウンレギュレーション
- 2014年6月号 Rho GTPase と活性酸素種: クロストークとフィードバック
- 2014年5月号 ミオシンのアセチル化はサルコメアの構造と機能を調節する
- 2014年4月号 リジンのアセチル化 - 多様な細胞プロセスの制御因子
- 2014年3月号 インテグリンを介したβ-アクチンの酸化還元制御: PDIの出現
- 2014年1/2月号 ダイニン: 一つのモーターが関わる複数の神経変性疾患
2013年
- 2013年11/12月号 ダイニン:チームとして強力に作用するモータータンパク質
- 2013年10月号 神経変性:Rhes、SUMO化、ハンチントン病
- 2013年9月号 モノユビキチン化:タンパク質調節のダイナミックなタグ
- 2013年8月号 Ras及びRhoのプレニル化による翻訳後修飾:癌創薬における役割
- 2013年7月号 アクチンが引き起こす膜突起による浸潤:コルタクチン
- 2013年6月号 アクチン修飾と細胞骨格
- 2013年5月号 微小管内部の実体
- 2013年4月号 神経変性におけるTauの多面性
- 2013年3月号 蛍光フィブロネクチンタンパク質を用いた特発性肺線維症の創薬
- 2013年1/2月号 樹状突起棘:発生におけるArf6の役割
2012年
- 2012年11/12月号 ミオシンの小分子モジュレーター
- 2012年10月号 Rhoファミリーパスウェイのユビキチン化と制御
- 2012年9月号 神経変性におけるRac1 GTPaseの機能
- 2012年8月号 上皮間葉転換(EMT)とRhoファミリー低分子量G-タンパク質の関与
- 2012年7月号 チューブリンの多重修飾:グルタミル化とグリシル化
- 2012年6月号 細胞接着のフィブロネクチン制御と原線維形成
- 2012年5月号 アクチン酸化サイクルの機能
- 2012年4月号 トラフィッキング:ArfとCdc42/Racの結合
- 2012年3月号 G-LISAを用いた心臓研究: 糖尿病性心筋症におけるRho経路に関する研究
- 2012年1月/2月号 FtsZ: 新たな抗生剤の標的となるチュ−ブリンホモログ
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